RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561096.5

MEIS3-210, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,883 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-210ENST00000561096 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.59■■□□□ 1.69
MEIS3-210ENST00000561096 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
MEIS3-210ENST00000561096 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
MEIS3-210ENST00000561096 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-210ENST00000561096 GRIN2AQ12879 1464 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-210ENST00000561096 SYNJ2O15056 1496 aa25.48■■□□□ 1.67
MEIS3-210ENST00000561096 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
MEIS3-210ENST00000561096 CEP170Q5SW79 1584 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-210ENST00000561096 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-210ENST00000561096 IQGAP2Q13576 1575 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-210ENST00000561096 SAMD9Q5K651 1589 aa25.34■■□□□ 1.65
MEIS3-210ENST00000561096 FBLN2P98095 1184 aa25.34■■□□□ 1.65
MEIS3-210ENST00000561096 NUP160Q12769 1436 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 P3H3Q8IVL6 736 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.3■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 APLP2Q06481 763 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-210ENST00000561096 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-210ENST00000561096 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-210ENST00000561096 HRCP23327 699 aa25.22■■□□□ 1.63
MEIS3-210ENST00000561096 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MEIS3-210ENST00000561096 MAP3K1Q13233 1512 aa25.2■■□□□ 1.62
MEIS3-210ENST00000561096 DISP1Q96F81 1524 aa25.19■■□□□ 1.62
MEIS3-210ENST00000561096 TIAM1Q13009 1591 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-210ENST00000561096 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.14■■□□□ 1.62
MEIS3-210ENST00000561096 KIAA0556O60303 1618 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-210ENST00000561096 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.13■■□□□ 1.61
MEIS3-210ENST00000561096 FMN1Q68DA7 1419 aa25.12■■□□□ 1.61
MEIS3-210ENST00000561096 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.1■■□□□ 1.61
MEIS3-210ENST00000561096 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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MEIS3-210ENST00000561096 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-210ENST00000561096 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.02■■□□□ 1.6
MEIS3-210ENST00000561096 SHROOM2Q13796 1616 aa25.01■■□□□ 1.59
MEIS3-210ENST00000561096 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25■■□□□ 1.59
MEIS3-210ENST00000561096 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
MEIS3-210ENST00000561096 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.94■■□□□ 1.58
MEIS3-210ENST00000561096 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
MEIS3-210ENST00000561096 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
MEIS3-210ENST00000561096 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
MEIS3-210ENST00000561096 HECW1Q76N89 1606 aa24.88■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.86■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.85■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-210ENST00000561096 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.81■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.8■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 ABCA8O94911 1581 aa24.79■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.78■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 ARID3CA6NKF2 412 aa24.78■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.76■■□□□ 1.56
MEIS3-210ENST00000561096 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 PTPRGP23470 1445 aa24.74■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 OSCARQ8IYS5 282 aa24.73■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.72■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MEIS3-210ENST00000561096 ARHGEF11O15085 1522 aa24.67■■□□□ 1.54
MEIS3-210ENST00000561096 NCOA2Q15596 1464 aa24.65■■□□□ 1.54
MEIS3-210ENST00000561096 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
MEIS3-210ENST00000561096 ATP10BO94823 1461 aa24.62■■□□□ 1.53
MEIS3-210ENST00000561096 UACAQ9BZF9 1416 aa24.62■■□□□ 1.53
MEIS3-210ENST00000561096 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
MEIS3-210ENST00000561096 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.6■■□□□ 1.53
MEIS3-210ENST00000561096 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.57■■□□□ 1.52
MEIS3-210ENST00000561096 ABCC2Q92887 1545 aa24.57■■□□□ 1.52
MEIS3-210ENST00000561096 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 KIF14Q15058 1648 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-210ENST00000561096 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 ITGAEP38570 1179 aa24.45■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.43■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 MIA2Q96PC5 1412 aa24.41■■□□□ 1.5
MEIS3-210ENST00000561096 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.38■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.38■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.37■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.36■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 PTPRKQ15262 1439 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-210ENST00000561096 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-210ENST00000561096 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-210ENST00000561096 HFM1A2PYH4 1435 aa24.26■■□□□ 1.47
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