RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARAP1Q96P48 1450 aa27.97■■■□□ 2.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.97■■■□□ 2.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.97■■■□□ 2.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRIN2AQ12879 1464 aa27.96■■■□□ 2.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.89■■■□□ 2.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQGAP2Q13576 1575 aa27.84■■■□□ 2.05
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SAMD9Q5K651 1589 aa27.8■■■□□ 2.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP160Q12769 1436 aa27.79■■■□□ 2.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBLN2P98095 1184 aa27.78■■■□□ 2.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP170Q5SW79 1584 aa27.78■■■□□ 2.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.73■■■□□ 2.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.72■■■□□ 2.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 P3H3Q8IVL6 736 aa27.71■■■□□ 2.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD1O14646 1710 aa27.66■■■□□ 2.02
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USP3-AS1-208ENST00000560962 DISP1Q96F81 1524 aa27.59■■■□□ 2.01
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.56■■■□□ 2
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USP3-AS1-208ENST00000560962 JPH4Q96JJ6 628 aa27.55■■■□□ 2
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K1Q13233 1512 aa27.54■■■□□ 2
USP3-AS1-208ENST00000560962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.47■■□□□ 1.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 TIAM1Q13009 1591 aa27.46■■□□□ 1.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.41■■□□□ 1.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHROOM2Q13796 1616 aa27.41■■□□□ 1.98
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.34■■□□□ 1.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 HECW1Q76N89 1606 aa27.34■■□□□ 1.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.31■■□□□ 1.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.29■■□□□ 1.96
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USP3-AS1-208ENST00000560962 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.21■■□□□ 1.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRGP23470 1445 aa27.2■■□□□ 1.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCA8O94911 1581 aa27.19■■□□□ 1.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.19■■□□□ 1.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSCARQ8IYS5 282 aa27.18■■□□□ 1.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.16■■□□□ 1.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
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USP3-AS1-208ENST00000560962 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.14■■□□□ 1.93
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID3CA6NKF2 412 aa27.06■■□□□ 1.92
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.03■■□□□ 1.92
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USP3-AS1-208ENST00000560962 NCOA2Q15596 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF11O15085 1522 aa27.01■■□□□ 1.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP10BO94823 1461 aa27■■□□□ 1.91
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC2Q92887 1545 aa26.97■■□□□ 1.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.9■■□□□ 1.9
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.87■■□□□ 1.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGAEP38570 1179 aa26.83■■□□□ 1.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.82■■□□□ 1.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIA2Q96PC5 1412 aa26.8■■□□□ 1.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF14Q15058 1648 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.76■■□□□ 1.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.72■■□□□ 1.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.69■■□□□ 1.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.58■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.58■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.58■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRKQ15262 1439 aa26.58■■□□□ 1.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 PREX2Q70Z35 1606 aa26.53■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.53■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
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