RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560152.1

LHX6-211, Transcript of LIM homeobox 6, humanhuman

TSL 3

Gene LHX6, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6-211ENST00000560152 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX6-211ENST00000560152 JPH4Q96JJ6 628 aa23.2■■□□□ 1.3
LHX6-211ENST00000560152 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.14■■□□□ 1.3
LHX6-211ENST00000560152 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
LHX6-211ENST00000560152 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.11■■□□□ 1.29
LHX6-211ENST00000560152 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.09■■□□□ 1.29
LHX6-211ENST00000560152 IQGAP2Q13576 1575 aa23.03■■□□□ 1.28
LHX6-211ENST00000560152 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX6-211ENST00000560152 MAPKBP1O60336 1514 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX6-211ENST00000560152 DISP1Q96F81 1524 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX6-211ENST00000560152 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
LHX6-211ENST00000560152 PRXQ9BXM0 1461 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX6-211ENST00000560152 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX6-211ENST00000560152 DIP2BQ9P265 1576 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX6-211ENST00000560152 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.89■■□□□ 1.25
LHX6-211ENST00000560152 KIAA0556O60303 1618 aa22.87■■□□□ 1.25
LHX6-211ENST00000560152 PTPRGP23470 1445 aa22.86■■□□□ 1.25
LHX6-211ENST00000560152 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.86■■□□□ 1.25
LHX6-211ENST00000560152 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.82■■□□□ 1.24
LHX6-211ENST00000560152 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
LHX6-211ENST00000560152 ABCC2Q92887 1545 aa22.81■■□□□ 1.24
LHX6-211ENST00000560152 UACAQ9BZF9 1416 aa22.74■■□□□ 1.23
LHX6-211ENST00000560152 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.73■■□□□ 1.23
LHX6-211ENST00000560152 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LHX6-211ENST00000560152 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.7■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 TSPOAP1O95153 1857 aa22.69■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 GLI2P10070 1586 aa22.68■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 ABCA8O94911 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 ASXL2Q76L83 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.65■■□□□ 1.22
LHX6-211ENST00000560152 SAMD9Q5K651 1589 aa22.63■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 GOLGA3Q08378 1498 aa22.61■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 EEA1Q15075 1411 aa22.58■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LHX6-211ENST00000560152 KDM6BO15054 1643 aa22.56■■□□□ 1.2
LHX6-211ENST00000560152 KIF21BO75037 1637 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX6-211ENST00000560152 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.5■■□□□ 1.19
LHX6-211ENST00000560152 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LHX6-211ENST00000560152 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.45■■□□□ 1.18
LHX6-211ENST00000560152 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
LHX6-211ENST00000560152 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.42■■□□□ 1.18
LHX6-211ENST00000560152 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.42■■□□□ 1.18
LHX6-211ENST00000560152 P3H3Q8IVL6 736 aa22.38■■□□□ 1.17
LHX6-211ENST00000560152 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LHX6-211ENST00000560152 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LHX6-211ENST00000560152 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.35■■□□□ 1.17
LHX6-211ENST00000560152 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.35■■□□□ 1.17
LHX6-211ENST00000560152 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.32■■□□□ 1.16
LHX6-211ENST00000560152 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.32■■□□□ 1.16
LHX6-211ENST00000560152 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.31■■□□□ 1.16
LHX6-211ENST00000560152 CD109Q6YHK3 1445 aa22.27■■□□□ 1.16
LHX6-211ENST00000560152 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.26■■□□□ 1.15
LHX6-211ENST00000560152 ARID3CA6NKF2 412 aa22.24■■□□□ 1.15
LHX6-211ENST00000560152 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX6-211ENST00000560152 KCNH8Q96L42 1107 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX6-211ENST00000560152 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX6-211ENST00000560152 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX6-211ENST00000560152 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX6-211ENST00000560152 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX6-211ENST00000560152 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LHX6-211ENST00000560152 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX6-211ENST00000560152 ADGRL1O94910 1474 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-211ENST00000560152 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-211ENST00000560152 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-211ENST00000560152 NEO1Q92859 1461 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.07■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 HECW1Q76N89 1606 aa22.06■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 RICTORQ6R327 1708 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 FMN1Q68DA7 1419 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX6-211ENST00000560152 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 KIF14Q15058 1648 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.96■■□□□ 1.11
LHX6-211ENST00000560152 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.95■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.94■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 RAPGEF3O95398 923 aa21.94■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 FANCAO15360 1455 aa21.94■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.92■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.92■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 AKNAQ7Z591 1439 aa21.92■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.91■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.9■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 PLCH2O75038 1416 aa21.9■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.9■■□□□ 1.1
LHX6-211ENST00000560152 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
LHX6-211ENST00000560152 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.87■■□□□ 1.09
LHX6-211ENST00000560152 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
LHX6-211ENST00000560152 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.86■■□□□ 1.09
LHX6-211ENST00000560152 CLIP1P30622 1438 aa21.82■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.82■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.8■■□□□ 1.08
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