RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558856.5

MEF2A-208, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, human

TSL 4

Gene MEF2A, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEF2A-208	ENST00000558856	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.7	■■■■■ 4.59
MEF2A-208	ENST00000558856	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
MEF2A-208	ENST00000558856	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.63	■■■■■ 4.58
MEF2A-208	ENST00000558856	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.53	■■■■■ 4.56
MEF2A-208	ENST00000558856	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.45	■■■■■ 4.55
MEF2A-208	ENST00000558856	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.33	■■■■■ 4.53
MEF2A-208	ENST00000558856	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.22	■■■■■ 4.51
MEF2A-208	ENST00000558856	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.17	■■■■■ 4.5
MEF2A-208	ENST00000558856	PTPRG	P23470	1445 aa		43.1	■■■■■ 4.49
MEF2A-208	ENST00000558856	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.09	■■■■■ 4.49
MEF2A-208	ENST00000558856	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.07	■■■■■ 4.49
MEF2A-208	ENST00000558856	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.07	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.05	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.04	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.04	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	EEA1	Q15075	1411 aa		43.02	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.01	■■■■■ 4.48
MEF2A-208	ENST00000558856	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
MEF2A-208	ENST00000558856	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.93	■■■■■ 4.46
MEF2A-208	ENST00000558856	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.91	■■■■■ 4.46
MEF2A-208	ENST00000558856	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.83	■■■■■ 4.45
MEF2A-208	ENST00000558856	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.83	■■■■■ 4.45
MEF2A-208	ENST00000558856	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.79	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.76	■■■■■ 4.44
MEF2A-208	ENST00000558856	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.69	■■■■■ 4.42
MEF2A-208	ENST00000558856	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.68	■■■■■ 4.42
MEF2A-208	ENST00000558856	KIF21B	O75037	1637 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MEF2A-208	ENST00000558856	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MEF2A-208	ENST00000558856	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MEF2A-208	ENST00000558856	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MEF2A-208	ENST00000558856	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
MEF2A-208	ENST00000558856	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MEF2A-208	ENST00000558856	ABCA8	O94911	1581 aa		42.47	■■■■■ 4.39
MEF2A-208	ENST00000558856	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MEF2A-208	ENST00000558856	GLI2	P10070	1586 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MEF2A-208	ENST00000558856	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
MEF2A-208	ENST00000558856	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
MEF2A-208	ENST00000558856	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MEF2A-208	ENST00000558856	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MEF2A-208	ENST00000558856	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MEF2A-208	ENST00000558856	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MEF2A-208	ENST00000558856	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.23	■■■■■ 4.35
MEF2A-208	ENST00000558856	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MEF2A-208	ENST00000558856	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MEF2A-208	ENST00000558856	KDM6B	O15054	1643 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MEF2A-208	ENST00000558856	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MEF2A-208	ENST00000558856	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MEF2A-208	ENST00000558856	ATP10B	O94823	1461 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MEF2A-208	ENST00000558856	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
MEF2A-208	ENST00000558856	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MEF2A-208	ENST00000558856	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MEF2A-208	ENST00000558856	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.01	■■■■■ 4.32
MEF2A-208	ENST00000558856	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
MEF2A-208	ENST00000558856	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
MEF2A-208	ENST00000558856	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MEF2A-208	ENST00000558856	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.93	■■■■■ 4.3
MEF2A-208	ENST00000558856	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.92	■■■■■ 4.3
MEF2A-208	ENST00000558856	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MEF2A-208	ENST00000558856	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.85	■■■■■ 4.29
MEF2A-208	ENST00000558856	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
MEF2A-208	ENST00000558856	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MEF2A-208	ENST00000558856	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.73	■■■■■ 4.27
MEF2A-208	ENST00000558856	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.7	■■■■■ 4.27
MEF2A-208	ENST00000558856	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
MEF2A-208	ENST00000558856	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
MEF2A-208	ENST00000558856	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
MEF2A-208	ENST00000558856	CLIP1	P30622	1438 aa		41.53	■■■■■ 4.24
MEF2A-208	ENST00000558856	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.53	■■■■■ 4.24
MEF2A-208	ENST00000558856	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MEF2A-208	ENST00000558856	NEO1	Q92859	1461 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MEF2A-208	ENST00000558856	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.49	■■■■■ 4.23
MEF2A-208	ENST00000558856	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
MEF2A-208	ENST00000558856	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.45	■■■■■ 4.23
MEF2A-208	ENST00000558856	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.22
MEF2A-208	ENST00000558856	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.43	■■■■■ 4.22
MEF2A-208	ENST00000558856	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.37	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.36	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.34	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.34	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.34	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.34	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	FANCA	O15360	1455 aa		41.34	■■■■■ 4.21
MEF2A-208	ENST00000558856	KIF14	Q15058	1648 aa		41.3	■■■■■ 4.2
MEF2A-208	ENST00000558856	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.27	■■■■■ 4.2
MEF2A-208	ENST00000558856	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.27	■■■■■ 4.2
MEF2A-208	ENST00000558856	PLCH2	O75038	1416 aa		41.25	■■■■■ 4.19
MEF2A-208	ENST00000558856	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.24	■■■■■ 4.19
MEF2A-208	ENST00000558856	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.23	■■■■■ 4.19
MEF2A-208	ENST00000558856	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
MEF2A-208	ENST00000558856	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MEF2A-208	ENST00000558856	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.18	■■■■■ 4.18
MEF2A-208	ENST00000558856	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.1	■■■■■ 4.17
MEF2A-208	ENST00000558856	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.1	■■■■■ 4.17
MEF2A-208	ENST00000558856	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.07	■■■■■ 4.17
MEF2A-208	ENST00000558856	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.05	■■■■■ 4.16
MEF2A-208	ENST00000558856	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.04	■■■■■ 4.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms