RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.87■■■□□ 2.37
NEDD1-212ENST00000557478 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.84■■■□□ 2.37
NEDD1-212ENST00000557478 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.8■■■□□ 2.36
NEDD1-212ENST00000557478 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
NEDD1-212ENST00000557478 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.65■■■□□ 2.34
NEDD1-212ENST00000557478 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
NEDD1-212ENST00000557478 IQGAP2Q13576 1575 aa29.57■■■□□ 2.32
NEDD1-212ENST00000557478 PTPRGP23470 1445 aa29.53■■■□□ 2.32
NEDD1-212ENST00000557478 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.52■■■□□ 2.32
NEDD1-212ENST00000557478 PRXQ9BXM0 1461 aa29.45■■■□□ 2.31
NEDD1-212ENST00000557478 EEA1Q15075 1411 aa29.44■■■□□ 2.3
NEDD1-212ENST00000557478 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
NEDD1-212ENST00000557478 MAPKBP1O60336 1514 aa29.4■■■□□ 2.3
NEDD1-212ENST00000557478 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.38■■■□□ 2.29
NEDD1-212ENST00000557478 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.37■■■□□ 2.29
NEDD1-212ENST00000557478 DISP1Q96F81 1524 aa29.36■■■□□ 2.29
NEDD1-212ENST00000557478 GOLGA3Q08378 1498 aa29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-212ENST00000557478 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.32■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 UACAQ9BZF9 1416 aa29.3■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC2Q92887 1545 aa29.3■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.28■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
NEDD1-212ENST00000557478 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.25■■■□□ 2.27
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA0556O60303 1618 aa29.25■■■□□ 2.27
NEDD1-212ENST00000557478 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.2■■■□□ 2.26
NEDD1-212ENST00000557478 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.15■■■□□ 2.26
NEDD1-212ENST00000557478 DIP2BQ9P265 1576 aa29.15■■■□□ 2.26
NEDD1-212ENST00000557478 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.14■■■□□ 2.25
NEDD1-212ENST00000557478 ASXL2Q76L83 1435 aa29.11■■■□□ 2.25
NEDD1-212ENST00000557478 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD1-212ENST00000557478 GLI2P10070 1586 aa29.02■■■□□ 2.24
NEDD1-212ENST00000557478 KIF21BO75037 1637 aa28.98■■■□□ 2.23
NEDD1-212ENST00000557478 ABCA8O94911 1581 aa28.97■■■□□ 2.23
NEDD1-212ENST00000557478 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NEDD1-212ENST00000557478 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NEDD1-212ENST00000557478 SAMD9Q5K651 1589 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD1-212ENST00000557478 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD1-212ENST00000557478 P3H3Q8IVL6 736 aa28.89■■■□□ 2.22
NEDD1-212ENST00000557478 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.87■■■□□ 2.21
NEDD1-212ENST00000557478 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD1-212ENST00000557478 KDM6BO15054 1643 aa28.83■■■□□ 2.21
NEDD1-212ENST00000557478 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
NEDD1-212ENST00000557478 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.77■■■□□ 2.2
NEDD1-212ENST00000557478 TSPOAP1O95153 1857 aa28.77■■■□□ 2.2
NEDD1-212ENST00000557478 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
NEDD1-212ENST00000557478 ATP10BO94823 1461 aa28.76■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 KCNH8Q96L42 1107 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.72■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 CD109Q6YHK3 1445 aa28.72■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.7■■■□□ 2.19
NEDD1-212ENST00000557478 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
NEDD1-212ENST00000557478 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NEDD1-212ENST00000557478 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
NEDD1-212ENST00000557478 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.67■■■□□ 2.18
NEDD1-212ENST00000557478 FMN1Q68DA7 1419 aa28.64■■■□□ 2.18
NEDD1-212ENST00000557478 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
NEDD1-212ENST00000557478 ARID3CA6NKF2 412 aa28.63■■■□□ 2.17
NEDD1-212ENST00000557478 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.62■■■□□ 2.17
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.62■■■□□ 2.17
NEDD1-212ENST00000557478 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.54■■■□□ 2.16
NEDD1-212ENST00000557478 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.52■■■□□ 2.16
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.52■■■□□ 2.16
NEDD1-212ENST00000557478 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NEDD1-212ENST00000557478 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NEDD1-212ENST00000557478 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.47■■■□□ 2.15
NEDD1-212ENST00000557478 NEO1Q92859 1461 aa28.46■■■□□ 2.15
NEDD1-212ENST00000557478 HECW1Q76N89 1606 aa28.43■■■□□ 2.14
NEDD1-212ENST00000557478 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
NEDD1-212ENST00000557478 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.34■■■□□ 2.13
NEDD1-212ENST00000557478 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.29■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 CLIP1P30622 1438 aa28.29■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.29■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.27■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 FANCAO15360 1455 aa28.27■■■□□ 2.12
NEDD1-212ENST00000557478 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 AKNAQ7Z591 1439 aa28.24■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 ADGRL1O94910 1474 aa28.23■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 PLCH2O75038 1416 aa28.23■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 RAPGEF3O95398 923 aa28.21■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
NEDD1-212ENST00000557478 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.19■■■□□ 2.1
NEDD1-212ENST00000557478 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.18■■■□□ 2.1
NEDD1-212ENST00000557478 KIF14Q15058 1648 aa28.17■■■□□ 2.1
NEDD1-212ENST00000557478 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
NEDD1-212ENST00000557478 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.11■■■□□ 2.09
NEDD1-212ENST00000557478 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.06■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.06■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.05■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.04■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.03■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 CEP162Q5TB80 1403 aa28.02■■■□□ 2.08
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms