RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556020.1

GPHN-211, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-211ENST00000556020 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
GPHN-211ENST00000556020 JPH4Q96JJ6 628 aa29.65■■■□□ 2.34
GPHN-211ENST00000556020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.55■■■□□ 2.32
GPHN-211ENST00000556020 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.53■■■□□ 2.32
GPHN-211ENST00000556020 IQGAP2Q13576 1575 aa29.34■■■□□ 2.29
GPHN-211ENST00000556020 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
GPHN-211ENST00000556020 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.32■■■□□ 2.28
GPHN-211ENST00000556020 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.31■■■□□ 2.28
GPHN-211ENST00000556020 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
GPHN-211ENST00000556020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.26■■■□□ 2.27
GPHN-211ENST00000556020 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.26■■■□□ 2.27
GPHN-211ENST00000556020 PTPRGP23470 1445 aa29.23■■■□□ 2.27
GPHN-211ENST00000556020 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.19■■■□□ 2.26
GPHN-211ENST00000556020 MAPKBP1O60336 1514 aa29.16■■■□□ 2.26
GPHN-211ENST00000556020 DISP1Q96F81 1524 aa29.15■■■□□ 2.26
GPHN-211ENST00000556020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.14■■■□□ 2.26
GPHN-211ENST00000556020 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.12■■■□□ 2.25
GPHN-211ENST00000556020 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.11■■■□□ 2.25
GPHN-211ENST00000556020 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.1■■■□□ 2.25
GPHN-211ENST00000556020 DIP2BQ9P265 1576 aa29.08■■■□□ 2.25
GPHN-211ENST00000556020 KIAA0556O60303 1618 aa29.07■■■□□ 2.24
GPHN-211ENST00000556020 PRXQ9BXM0 1461 aa29.05■■■□□ 2.24
GPHN-211ENST00000556020 ABCC2Q92887 1545 aa29.03■■■□□ 2.24
GPHN-211ENST00000556020 UACAQ9BZF9 1416 aa29.01■■■□□ 2.23
GPHN-211ENST00000556020 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.97■■■□□ 2.23
GPHN-211ENST00000556020 TSPOAP1O95153 1857 aa28.97■■■□□ 2.23
GPHN-211ENST00000556020 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.93■■■□□ 2.22
GPHN-211ENST00000556020 GOLGA3Q08378 1498 aa28.92■■■□□ 2.22
GPHN-211ENST00000556020 ASXL2Q76L83 1435 aa28.92■■■□□ 2.22
GPHN-211ENST00000556020 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GPHN-211ENST00000556020 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.87■■■□□ 2.21
GPHN-211ENST00000556020 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.86■■■□□ 2.21
GPHN-211ENST00000556020 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GPHN-211ENST00000556020 EEA1Q15075 1411 aa28.83■■■□□ 2.21
GPHN-211ENST00000556020 P3H3Q8IVL6 736 aa28.79■■■□□ 2.2
GPHN-211ENST00000556020 KDM6BO15054 1643 aa28.79■■■□□ 2.2
GPHN-211ENST00000556020 GLI2P10070 1586 aa28.77■■■□□ 2.2
GPHN-211ENST00000556020 ABCA8O94911 1581 aa28.76■■■□□ 2.19
GPHN-211ENST00000556020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
GPHN-211ENST00000556020 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
GPHN-211ENST00000556020 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
GPHN-211ENST00000556020 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GPHN-211ENST00000556020 SAMD9Q5K651 1589 aa28.68■■■□□ 2.18
GPHN-211ENST00000556020 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.68■■■□□ 2.18
GPHN-211ENST00000556020 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.67■■■□□ 2.18
GPHN-211ENST00000556020 ARID3CA6NKF2 412 aa28.66■■■□□ 2.18
GPHN-211ENST00000556020 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.66■■■□□ 2.18
GPHN-211ENST00000556020 KIF21BO75037 1637 aa28.63■■■□□ 2.17
GPHN-211ENST00000556020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.61■■■□□ 2.17
GPHN-211ENST00000556020 KCNH8Q96L42 1107 aa28.6■■■□□ 2.17
GPHN-211ENST00000556020 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.55■■■□□ 2.16
GPHN-211ENST00000556020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.54■■■□□ 2.16
GPHN-211ENST00000556020 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.53■■■□□ 2.16
GPHN-211ENST00000556020 ATP10BO94823 1461 aa28.52■■■□□ 2.16
GPHN-211ENST00000556020 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.51■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 CD109Q6YHK3 1445 aa28.48■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
GPHN-211ENST00000556020 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.44■■■□□ 2.14
GPHN-211ENST00000556020 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
GPHN-211ENST00000556020 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.4■■■□□ 2.14
GPHN-211ENST00000556020 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.33■■■□□ 2.13
GPHN-211ENST00000556020 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.32■■■□□ 2.12
GPHN-211ENST00000556020 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
GPHN-211ENST00000556020 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.24■■■□□ 2.11
GPHN-211ENST00000556020 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
GPHN-211ENST00000556020 ADGRL1O94910 1474 aa28.21■■■□□ 2.11
GPHN-211ENST00000556020 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GPHN-211ENST00000556020 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.18■■■□□ 2.1
GPHN-211ENST00000556020 FMN1Q68DA7 1419 aa28.18■■■□□ 2.1
GPHN-211ENST00000556020 HECW1Q76N89 1606 aa28.15■■■□□ 2.1
GPHN-211ENST00000556020 NEO1Q92859 1461 aa28.13■■■□□ 2.09
GPHN-211ENST00000556020 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
GPHN-211ENST00000556020 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.11■■■□□ 2.09
GPHN-211ENST00000556020 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.11■■■□□ 2.09
GPHN-211ENST00000556020 RAPGEF3O95398 923 aa28.08■■■□□ 2.09
GPHN-211ENST00000556020 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.02■■■□□ 2.08
GPHN-211ENST00000556020 FANCAO15360 1455 aa28.02■■■□□ 2.08
GPHN-211ENST00000556020 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.01■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 AKNAQ7Z591 1439 aa27.99■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 KIF14Q15058 1648 aa27.96■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
GPHN-211ENST00000556020 RICTORQ6R327 1708 aa27.94■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.93■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 CLIP1P30622 1438 aa27.92■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.91■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 PLCH2O75038 1416 aa27.9■■■□□ 2.06
GPHN-211ENST00000556020 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.86■■■□□ 2.05
GPHN-211ENST00000556020 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GPHN-211ENST00000556020 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.85■■■□□ 2.05
GPHN-211ENST00000556020 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.83■■■□□ 2.05
GPHN-211ENST00000556020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.82■■■□□ 2.04
GPHN-211ENST00000556020 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.81■■■□□ 2.04
GPHN-211ENST00000556020 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.81■■■□□ 2.04
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