RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555704.5

KLHDC1-204, Transcript of kelch domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KLHDC1, Length 1,447 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC1-204ENST00000555704 EEA1Q15075 1411 aa42.45■■■■■ 4.39
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KLHDC1-204ENST00000555704 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.43■■■■■ 4.38
KLHDC1-204ENST00000555704 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.39■■■■■ 4.38
KLHDC1-204ENST00000555704 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.36■■■■■ 4.37
KLHDC1-204ENST00000555704 JPH4Q96JJ6 628 aa42.32■■■■■ 4.37
KLHDC1-204ENST00000555704 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.29■■■■■ 4.36
KLHDC1-204ENST00000555704 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
KLHDC1-204ENST00000555704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
KLHDC1-204ENST00000555704 IQGAP2Q13576 1575 aa42.22■■■■■ 4.35
KLHDC1-204ENST00000555704 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.09■■■■■ 4.33
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KLHDC1-204ENST00000555704 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.01■■■■■ 4.32
KLHDC1-204ENST00000555704 DISP1Q96F81 1524 aa41.95■■■■■ 4.31
KLHDC1-204ENST00000555704 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.93■■■■■ 4.3
KLHDC1-204ENST00000555704 KIAA0556O60303 1618 aa41.85■■■■■ 4.29
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KLHDC1-204ENST00000555704 GOLGA3Q08378 1498 aa41.78■■■■■ 4.28
KLHDC1-204ENST00000555704 PTPRGP23470 1445 aa41.76■■■■■ 4.28
KLHDC1-204ENST00000555704 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.71■■■■■ 4.27
KLHDC1-204ENST00000555704 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
KLHDC1-204ENST00000555704 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.65■■■■■ 4.26
KLHDC1-204ENST00000555704 SAMD9Q5K651 1589 aa41.61■■■■■ 4.25
KLHDC1-204ENST00000555704 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
KLHDC1-204ENST00000555704 UACAQ9BZF9 1416 aa41.51■■■■■ 4.24
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KLHDC1-204ENST00000555704 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.48■■■■■ 4.23
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KLHDC1-204ENST00000555704 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.43■■■■■ 4.22
KLHDC1-204ENST00000555704 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.42■■■■■ 4.22
KLHDC1-204ENST00000555704 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.38■■■■■ 4.21
KLHDC1-204ENST00000555704 ABCA8O94911 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
KLHDC1-204ENST00000555704 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
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KLHDC1-204ENST00000555704 MAPKBP1O60336 1514 aa41.35■■■■■ 4.21
KLHDC1-204ENST00000555704 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.29■■■■■ 4.2
KLHDC1-204ENST00000555704 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.27■■■■■ 4.2
KLHDC1-204ENST00000555704 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
KLHDC1-204ENST00000555704 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.16■■■■■ 4.18
KLHDC1-204ENST00000555704 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.14■■■■■ 4.18
KLHDC1-204ENST00000555704 ASXL2Q76L83 1435 aa41.13■■■■■ 4.18
KLHDC1-204ENST00000555704 DIP2BQ9P265 1576 aa41.1■■■■■ 4.17
KLHDC1-204ENST00000555704 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.08■■■■■ 4.17
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KLHDC1-204ENST00000555704 ATP10BO94823 1461 aa41.01■■■■■ 4.16
KLHDC1-204ENST00000555704 FMN1Q68DA7 1419 aa41.01■■■■■ 4.16
KLHDC1-204ENST00000555704 ARID3CA6NKF2 412 aa41.01■■■■■ 4.15
KLHDC1-204ENST00000555704 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41■■■■■ 4.15
KLHDC1-204ENST00000555704 FAM69CQ0P6D2 419 aa41■■■■■ 4.15
KLHDC1-204ENST00000555704 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.95■■■■■ 4.15
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KLHDC1-204ENST00000555704 CEP162Q5TB80 1403 aa40.9■■■■■ 4.14
KLHDC1-204ENST00000555704 GLI2P10070 1586 aa40.87■■■■■ 4.13
KLHDC1-204ENST00000555704 HECW1Q76N89 1606 aa40.83■■■■■ 4.13
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KLHDC1-204ENST00000555704 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.7■■■■■ 4.11
KLHDC1-204ENST00000555704 KCNH8Q96L42 1107 aa40.69■■■■■ 4.1
KLHDC1-204ENST00000555704 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.65■■■■■ 4.1
KLHDC1-204ENST00000555704 TSPOAP1O95153 1857 aa40.65■■■■■ 4.1
KLHDC1-204ENST00000555704 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.65■■■■■ 4.1
KLHDC1-204ENST00000555704 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
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KLHDC1-204ENST00000555704 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.57■■■■■ 4.09
KLHDC1-204ENST00000555704 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.54■■■■■ 4.08
KLHDC1-204ENST00000555704 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.54■■■■■ 4.08
KLHDC1-204ENST00000555704 CD109Q6YHK3 1445 aa40.53■■■■■ 4.08
KLHDC1-204ENST00000555704 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.47■■■■■ 4.07
KLHDC1-204ENST00000555704 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.46■■■■■ 4.07
KLHDC1-204ENST00000555704 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
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KLHDC1-204ENST00000555704 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.4■■■■■ 4.06
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KLHDC1-204ENST00000555704 KDM6BO15054 1643 aa40.37■■■■■ 4.05
KLHDC1-204ENST00000555704 KIF14Q15058 1648 aa40.34■■■■■ 4.05
KLHDC1-204ENST00000555704 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
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KLHDC1-204ENST00000555704 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.11■■■■■ 4.01
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KLHDC1-204ENST00000555704 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.1■■■■■ 4.01
KLHDC1-204ENST00000555704 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
KLHDC1-204ENST00000555704 AKNAQ7Z591 1439 aa40.04■■■■■ 4
KLHDC1-204ENST00000555704 MAP3K1Q13233 1512 aa40.01■■■■□ 3.99
KLHDC1-204ENST00000555704 PREX2Q70Z35 1606 aa40■■■■□ 3.99
KLHDC1-204ENST00000555704 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.98■■■■□ 3.99
KLHDC1-204ENST00000555704 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.95■■■■□ 3.99
KLHDC1-204ENST00000555704 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.95■■■■□ 3.99
KLHDC1-204ENST00000555704 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.94■■■■□ 3.98
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