RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554669.5

LINC01578-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01578, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-203ENST00000554669 JPH4Q96JJ6 628 aa48.87■■■■■ 5.41
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LINC01578-203ENST00000554669 IQGAP2Q13576 1575 aa48.47■■■■■ 5.35
LINC01578-203ENST00000554669 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.36■■■■■ 5.33
LINC01578-203ENST00000554669 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
LINC01578-203ENST00000554669 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.31■■■■■ 5.32
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LINC01578-203ENST00000554669 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.23■■■■■ 5.31
LINC01578-203ENST00000554669 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.17■■■■■ 5.3
LINC01578-203ENST00000554669 PTPRGP23470 1445 aa48.16■■■■■ 5.3
LINC01578-203ENST00000554669 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.16■■■■■ 5.3
LINC01578-203ENST00000554669 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.14■■■■■ 5.3
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LINC01578-203ENST00000554669 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.07■■■■■ 5.29
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LINC01578-203ENST00000554669 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.89■■■■■ 5.26
LINC01578-203ENST00000554669 MAPKBP1O60336 1514 aa47.86■■■■■ 5.25
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LINC01578-203ENST00000554669 UACAQ9BZF9 1416 aa47.83■■■■■ 5.25
LINC01578-203ENST00000554669 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.82■■■■■ 5.25
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LINC01578-203ENST00000554669 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.72■■■■■ 5.23
LINC01578-203ENST00000554669 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.71■■■■■ 5.23
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LINC01578-203ENST00000554669 P3H3Q8IVL6 736 aa47.62■■■■■ 5.21
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LINC01578-203ENST00000554669 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.61■■■■■ 5.21
LINC01578-203ENST00000554669 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.6■■■■■ 5.21
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LINC01578-203ENST00000554669 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.18
LINC01578-203ENST00000554669 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.35■■■■■ 5.17
LINC01578-203ENST00000554669 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.28■■■■■ 5.16
LINC01578-203ENST00000554669 GLI2P10070 1586 aa47.27■■■■■ 5.16
LINC01578-203ENST00000554669 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
LINC01578-203ENST00000554669 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.21■■■■■ 5.15
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LINC01578-203ENST00000554669 ARID3CA6NKF2 412 aa47.19■■■■■ 5.14
LINC01578-203ENST00000554669 ATP10BO94823 1461 aa47.19■■■■■ 5.14
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LINC01578-203ENST00000554669 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
LINC01578-203ENST00000554669 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.1■■■■■ 5.13
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LINC01578-203ENST00000554669 KCNH8Q96L42 1107 aa46.99■■■■■ 5.11
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LINC01578-203ENST00000554669 CD109Q6YHK3 1445 aa46.81■■■■■ 5.08
LINC01578-203ENST00000554669 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.8■■■■■ 5.08
LINC01578-203ENST00000554669 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.77■■■■■ 5.08
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LINC01578-203ENST00000554669 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
LINC01578-203ENST00000554669 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.69■■■■■ 5.07
LINC01578-203ENST00000554669 HECW1Q76N89 1606 aa46.65■■■■■ 5.06
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LINC01578-203ENST00000554669 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.64■■■■■ 5.06
LINC01578-203ENST00000554669 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
LINC01578-203ENST00000554669 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
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LINC01578-203ENST00000554669 FANCAO15360 1455 aa46.19■■■■■ 4.98
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LINC01578-203ENST00000554669 RAPGEF3O95398 923 aa46.15■■■■■ 4.98
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LINC01578-203ENST00000554669 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.11■■■■■ 4.97
LINC01578-203ENST00000554669 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
LINC01578-203ENST00000554669 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.07■■■■■ 4.97
LINC01578-203ENST00000554669 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.03■■■■■ 4.96
LINC01578-203ENST00000554669 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
LINC01578-203ENST00000554669 RICTORQ6R327 1708 aa45.95■■■■■ 4.95
LINC01578-203ENST00000554669 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.93■■■■■ 4.94
LINC01578-203ENST00000554669 ADGRL1O94910 1474 aa45.92■■■■■ 4.94
LINC01578-203ENST00000554669 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.89■■■■■ 4.94
LINC01578-203ENST00000554669 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.88■■■■■ 4.94
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