RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LETMD1-224	ENST00000550446	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.93	■■■□□ 2.86
LETMD1-224	ENST00000550446	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LETMD1-224	ENST00000550446	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LETMD1-224	ENST00000550446	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
LETMD1-224	ENST00000550446	CUL7	Q14999	1698 aa		32.81	■■■□□ 2.84
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LETMD1-224	ENST00000550446	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
LETMD1-224	ENST00000550446	PTPRG	P23470	1445 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LETMD1-224	ENST00000550446	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LETMD1-224	ENST00000550446	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LETMD1-224	ENST00000550446	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LETMD1-224	ENST00000550446	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LETMD1-224	ENST00000550446	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LETMD1-224	ENST00000550446	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LETMD1-224	ENST00000550446	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LETMD1-224	ENST00000550446	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LETMD1-224	ENST00000550446	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LETMD1-224	ENST00000550446	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LETMD1-224	ENST00000550446	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LETMD1-224	ENST00000550446	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LETMD1-224	ENST00000550446	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.31	■■■□□ 2.76
LETMD1-224	ENST00000550446	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LETMD1-224	ENST00000550446	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LETMD1-224	ENST00000550446	KDM6B	O15054	1643 aa		32.25	■■■□□ 2.75
LETMD1-224	ENST00000550446	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.19	■■■□□ 2.74
LETMD1-224	ENST00000550446	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.18	■■■□□ 2.74
LETMD1-224	ENST00000550446	GLI2	P10070	1586 aa		32.15	■■■□□ 2.74
LETMD1-224	ENST00000550446	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.13	■■■□□ 2.73
LETMD1-224	ENST00000550446	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.12	■■■□□ 2.73
LETMD1-224	ENST00000550446	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
LETMD1-224	ENST00000550446	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.1	■■■□□ 2.73
LETMD1-224	ENST00000550446	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
LETMD1-224	ENST00000550446	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LETMD1-224	ENST00000550446	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LETMD1-224	ENST00000550446	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LETMD1-224	ENST00000550446	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LETMD1-224	ENST00000550446	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LETMD1-224	ENST00000550446	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LETMD1-224	ENST00000550446	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LETMD1-224	ENST00000550446	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCA8	O94911	1581 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LETMD1-224	ENST00000550446	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.87	■■■□□ 2.69
LETMD1-224	ENST00000550446	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP10B	O94823	1461 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LETMD1-224	ENST00000550446	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LETMD1-224	ENST00000550446	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
LETMD1-224	ENST00000550446	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
LETMD1-224	ENST00000550446	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LETMD1-224	ENST00000550446	EEA1	Q15075	1411 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LETMD1-224	ENST00000550446	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LETMD1-224	ENST00000550446	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LETMD1-224	ENST00000550446	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.58	■■■□□ 2.65
LETMD1-224	ENST00000550446	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.57	■■■□□ 2.64
LETMD1-224	ENST00000550446	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.57	■■■□□ 2.64
LETMD1-224	ENST00000550446	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.52	■■■□□ 2.64
LETMD1-224	ENST00000550446	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
LETMD1-224	ENST00000550446	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.51	■■■□□ 2.63
LETMD1-224	ENST00000550446	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.5	■■■□□ 2.63
LETMD1-224	ENST00000550446	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.49	■■■□□ 2.63
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.47	■■■□□ 2.63
LETMD1-224	ENST00000550446	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
LETMD1-224	ENST00000550446	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LETMD1-224	ENST00000550446	KIF21B	O75037	1637 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LETMD1-224	ENST00000550446	NEO1	Q92859	1461 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
LETMD1-224	ENST00000550446	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
LETMD1-224	ENST00000550446	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.26	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.24	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	FANCA	O15360	1455 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.21	■■■□□ 2.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
LETMD1-224	ENST00000550446	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LETMD1-224	ENST00000550446	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LETMD1-224	ENST00000550446	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
LETMD1-224	ENST00000550446	PTPRM	P28827	1452 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PLCH2	O75038	1416 aa		31.08	■■■□□ 2.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.08	■■■□□ 2.57
LETMD1-224	ENST00000550446	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.06	■■■□□ 2.56
LETMD1-224	ENST00000550446	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.05	■■■□□ 2.56
LETMD1-224	ENST00000550446	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.05	■■■□□ 2.56
LETMD1-224	ENST00000550446	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.03	■■■□□ 2.56
LETMD1-224	ENST00000550446	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.03	■■■□□ 2.56
LETMD1-224	ENST00000550446	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.01	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		30.99	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	MLEC	Q14165	292 aa		30.98	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	MADD	Q8WXG6	1647 aa		30.96	■■■□□ 2.55
LETMD1-224	ENST00000550446	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		30.95	■■■□□ 2.55

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