RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 CUL7Q14999 1698 aa31.91■■■□□ 2.7
PRDM4-205ENST00000550376 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
PRDM4-205ENST00000550376 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.85■■■□□ 2.69
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
PRDM4-205ENST00000550376 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
PRDM4-205ENST00000550376 IFT140Q96RY7 1462 aa31.7■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.7■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 PBRM1Q86U86 1689 aa31.67■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 GRIN2BQ13224 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.65■■■□□ 2.66
PRDM4-205ENST00000550376 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 ITGAEP38570 1179 aa31.6■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 TIAM1Q13009 1591 aa31.58■■■□□ 2.65
PRDM4-205ENST00000550376 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.57■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS12P58397 1594 aa31.55■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 FBLN2P98095 1184 aa31.53■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.52■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.51■■■□□ 2.64
PRDM4-205ENST00000550376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.48■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.46■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 FMN1Q68DA7 1419 aa31.45■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PRDM4-205ENST00000550376 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.44■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD9Q5K651 1589 aa31.43■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.43■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 MAP3K1Q13233 1512 aa31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 ARID3CA6NKF2 412 aa31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
PRDM4-205ENST00000550376 IQGAP2Q13576 1575 aa31.37■■■□□ 2.61
PRDM4-205ENST00000550376 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
PRDM4-205ENST00000550376 GRIN2AQ12879 1464 aa31.32■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.32■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.26■■■□□ 2.6
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.23■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.23■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
PRDM4-205ENST00000550376 SYNJ2O15056 1496 aa31.19■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.16■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 DISP1Q96F81 1524 aa31.15■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 CEP170Q5SW79 1584 aa31.14■■■□□ 2.58
PRDM4-205ENST00000550376 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 JPH4Q96JJ6 628 aa31.09■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.08■■■□□ 2.57
PRDM4-205ENST00000550376 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.05■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 NCOA2Q15596 1464 aa31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0556O60303 1618 aa31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.02■■■□□ 2.56
PRDM4-205ENST00000550376 NUP160Q12769 1436 aa30.98■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 HECW1Q76N89 1606 aa30.98■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.96■■■□□ 2.55
PRDM4-205ENST00000550376 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.94■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.92■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.91■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.91■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PRDM4-205ENST00000550376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRKQ15262 1439 aa30.88■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.84■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.83■■■□□ 2.53
PRDM4-205ENST00000550376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.525e-6■■■■■ 46.2
PRDM4-205ENST00000550376 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.81■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.79■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF11O15085 1522 aa30.79■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PRDM4-205ENST00000550376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.74■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.73■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.71■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 CHD1O14646 1710 aa30.71■■■□□ 2.51
PRDM4-205ENST00000550376 NEUROD1Q13562 356 aa30.69■■■□□ 2.5
PRDM4-205ENST00000550376 MAPKBP1O60336 1514 aa30.68■■■□□ 2.5
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRGP23470 1445 aa30.62■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 NAIPQ13075 1403 aa30.6■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 HFM1A2PYH4 1435 aa30.59■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PRDM4-205ENST00000550376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.56■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 MIA2Q96PC5 1412 aa30.56■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ATP10BO94823 1461 aa30.55■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ABCA8O94911 1581 aa30.53■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.53■■■□□ 2.48
PRDM4-205ENST00000550376 KIF14Q15058 1648 aa30.51■■■□□ 2.47
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM52Q96A61 297 aa30.47■■■□□ 2.47
PRDM4-205ENST00000550376 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC5O15440 1437 aa30.42■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 DAPK1P53355 1430 aa30.41■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 KDM6BO15054 1643 aa30.4■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 UACAQ9BZF9 1416 aa30.4■■■□□ 2.46
PRDM4-205ENST00000550376 SHROOM2Q13796 1616 aa30.35■■■□□ 2.45
PRDM4-205ENST00000550376 FOXD1Q16676 465 aa30.34■■■□□ 2.45
PRDM4-205ENST00000550376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.34■■■□□ 2.45
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