RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549760.1

RAB3IP-211, Transcript of RAB3A interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene RAB3IP, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IP-211ENST00000549760 KIF27Q86VH2 1401 aa36.84■■■■□ 3.49
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RAB3IP-211ENST00000549760 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.72■■■■□ 3.47
RAB3IP-211ENST00000549760 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.65■■■■□ 3.46
RAB3IP-211ENST00000549760 MAPKBP1O60336 1514 aa36.58■■■■□ 3.45
RAB3IP-211ENST00000549760 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB3IP-211ENST00000549760 DIP2BQ9P265 1576 aa36.5■■■■□ 3.43
RAB3IP-211ENST00000549760 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.43
RAB3IP-211ENST00000549760 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.5■■■■□ 3.43
RAB3IP-211ENST00000549760 IQGAP2Q13576 1575 aa36.46■■■■□ 3.43
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RAB3IP-211ENST00000549760 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB3IP-211ENST00000549760 PTPRGP23470 1445 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB3IP-211ENST00000549760 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.3■■■■□ 3.4
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RAB3IP-211ENST00000549760 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
RAB3IP-211ENST00000549760 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.26■■■■□ 3.4
RAB3IP-211ENST00000549760 ABCC2Q92887 1545 aa36.24■■■■□ 3.39
RAB3IP-211ENST00000549760 DISP1Q96F81 1524 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB3IP-211ENST00000549760 KDM6BO15054 1643 aa36.2■■■■□ 3.39
RAB3IP-211ENST00000549760 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB3IP-211ENST00000549760 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.16■■■■□ 3.38
RAB3IP-211ENST00000549760 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.15■■■■□ 3.38
RAB3IP-211ENST00000549760 KIAA0556O60303 1618 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB3IP-211ENST00000549760 UACAQ9BZF9 1416 aa36.1■■■■□ 3.37
RAB3IP-211ENST00000549760 ASXL2Q76L83 1435 aa36.09■■■■□ 3.37
RAB3IP-211ENST00000549760 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.07■■■■□ 3.37
RAB3IP-211ENST00000549760 GLI2P10070 1586 aa36.04■■■■□ 3.36
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RAB3IP-211ENST00000549760 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.99■■■■□ 3.35
RAB3IP-211ENST00000549760 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.9■■■■□ 3.34
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RAB3IP-211ENST00000549760 PRXQ9BXM0 1461 aa35.86■■■■□ 3.33
RAB3IP-211ENST00000549760 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.77■■■■□ 3.32
RAB3IP-211ENST00000549760 ABCA8O94911 1581 aa35.76■■■■□ 3.32
RAB3IP-211ENST00000549760 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.74■■■■□ 3.31
RAB3IP-211ENST00000549760 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.67■■■■□ 3.3
RAB3IP-211ENST00000549760 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.65■■■■□ 3.3
RAB3IP-211ENST00000549760 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
RAB3IP-211ENST00000549760 SAMD9Q5K651 1589 aa35.55■■■■□ 3.28
RAB3IP-211ENST00000549760 ADGRL1O94910 1474 aa35.52■■■■□ 3.28
RAB3IP-211ENST00000549760 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.51■■■■□ 3.27
RAB3IP-211ENST00000549760 CD109Q6YHK3 1445 aa35.49■■■■□ 3.27
RAB3IP-211ENST00000549760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.48■■■■□ 3.27
RAB3IP-211ENST00000549760 KCNH8Q96L42 1107 aa35.46■■■■□ 3.27
RAB3IP-211ENST00000549760 P3H3Q8IVL6 736 aa35.45■■■■□ 3.27
RAB3IP-211ENST00000549760 EEA1Q15075 1411 aa35.44■■■■□ 3.26
RAB3IP-211ENST00000549760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
RAB3IP-211ENST00000549760 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.43■■■■□ 3.26
RAB3IP-211ENST00000549760 ATP10BO94823 1461 aa35.4■■■■□ 3.26
RAB3IP-211ENST00000549760 ARID3CA6NKF2 412 aa35.37■■■■□ 3.25
RAB3IP-211ENST00000549760 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.33■■■■□ 3.25
RAB3IP-211ENST00000549760 KIF21BO75037 1637 aa35.25■■■■□ 3.23
RAB3IP-211ENST00000549760 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB3IP-211ENST00000549760 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB3IP-211ENST00000549760 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
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RAB3IP-211ENST00000549760 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
RAB3IP-211ENST00000549760 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
RAB3IP-211ENST00000549760 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.1■■■■□ 3.21
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RAB3IP-211ENST00000549760 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.08■■■■□ 3.21
RAB3IP-211ENST00000549760 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.03■■■■□ 3.2
RAB3IP-211ENST00000549760 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.97■■■■□ 3.19
RAB3IP-211ENST00000549760 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.94■■■■□ 3.18
RAB3IP-211ENST00000549760 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
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RAB3IP-211ENST00000549760 RICTORQ6R327 1708 aa34.92■■■■□ 3.18
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RAB3IP-211ENST00000549760 FANCAO15360 1455 aa34.85■■■■□ 3.17
RAB3IP-211ENST00000549760 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.85■■■■□ 3.17
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RAB3IP-211ENST00000549760 FMN1Q68DA7 1419 aa34.79■■■■□ 3.16
RAB3IP-211ENST00000549760 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.78■■■■□ 3.16
RAB3IP-211ENST00000549760 MADDQ8WXG6 1647 aa34.77■■■■□ 3.16
RAB3IP-211ENST00000549760 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.77■■■■□ 3.16
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RAB3IP-211ENST00000549760 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.67■■■■□ 3.14
RAB3IP-211ENST00000549760 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
RAB3IP-211ENST00000549760 KIF14Q15058 1648 aa34.65■■■■□ 3.14
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RAB3IP-211ENST00000549760 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
RAB3IP-211ENST00000549760 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.62■■■■□ 3.13
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