RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548477.5

SLC8B1-204, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC8B1, Length 2,053 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-204ENST00000548477 PBRM1Q86U86 1689 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC8B1-204ENST00000548477 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.952e-6■■■■■ 35.8
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SLC8B1-204ENST00000548477 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SLC8B1-204ENST00000548477 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SLC8B1-204ENST00000548477 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.18■■□□□ 1.94
SLC8B1-204ENST00000548477 GRIN2BQ13224 1484 aa27.17■■□□□ 1.94
SLC8B1-204ENST00000548477 MAP3K1Q13233 1512 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC8B1-204ENST00000548477 ADAMTS12P58397 1594 aa27.14■■□□□ 1.94
SLC8B1-204ENST00000548477 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC8B1-204ENST00000548477 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC8B1-204ENST00000548477 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SLC8B1-204ENST00000548477 TIAM1Q13009 1591 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC8B1-204ENST00000548477 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SLC8B1-204ENST00000548477 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.03■■□□□ 1.92
SLC8B1-204ENST00000548477 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
SLC8B1-204ENST00000548477 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27■■□□□ 1.91
SLC8B1-204ENST00000548477 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC8B1-204ENST00000548477 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SLC8B1-204ENST00000548477 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC8B1-204ENST00000548477 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC8B1-204ENST00000548477 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC8B1-204ENST00000548477 P3H3Q8IVL6 736 aa26.89■■□□□ 1.9
SLC8B1-204ENST00000548477 FMN1Q68DA7 1419 aa26.89■■□□□ 1.9
SLC8B1-204ENST00000548477 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.89■■□□□ 1.9
SLC8B1-204ENST00000548477 SAMD9Q5K651 1589 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC8B1-204ENST00000548477 GRIN2AQ12879 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC8B1-204ENST00000548477 SYNJ2O15056 1496 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC8B1-204ENST00000548477 IQGAP2Q13576 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC8B1-204ENST00000548477 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC8B1-204ENST00000548477 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SLC8B1-204ENST00000548477 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC8B1-204ENST00000548477 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC8B1-204ENST00000548477 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC8B1-204ENST00000548477 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC8B1-204ENST00000548477 CEP170Q5SW79 1584 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC8B1-204ENST00000548477 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ITGAEP38570 1179 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 NUP160Q12769 1436 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 FBLN2P98095 1184 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC8B1-204ENST00000548477 CHD1O14646 1710 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC8B1-204ENST00000548477 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC8B1-204ENST00000548477 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC8B1-204ENST00000548477 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC8B1-204ENST00000548477 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SLC8B1-204ENST00000548477 KIAA0556O60303 1618 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 HECW1Q76N89 1606 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 DISP1Q96F81 1524 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC8B1-204ENST00000548477 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC8B1-204ENST00000548477 NCOA2Q15596 1464 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC8B1-204ENST00000548477 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC8B1-204ENST00000548477 JPH4Q96JJ6 628 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC8B1-204ENST00000548477 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC8B1-204ENST00000548477 MAPKBP1O60336 1514 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 ARHGEF11O15085 1522 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 SHROOM2Q13796 1616 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC8B1-204ENST00000548477 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC8B1-204ENST00000548477 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC8B1-204ENST00000548477 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC8B1-204ENST00000548477 HFM1A2PYH4 1435 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC8B1-204ENST00000548477 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC8B1-204ENST00000548477 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC8B1-204ENST00000548477 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC8B1-204ENST00000548477 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC8B1-204ENST00000548477 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 MIA2Q96PC5 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 PTPRKQ15262 1439 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 ABCA8O94911 1581 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 UACAQ9BZF9 1416 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC8B1-204ENST00000548477 NAIPQ13075 1403 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 AKNAQ7Z591 1439 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 PTPRGP23470 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 ARID3CA6NKF2 412 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 MIER1Q8N108 512 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1-204ENST00000548477 NEUROD1Q13562 356 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC8B1-204ENST00000548477 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1-204ENST00000548477 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1-204ENST00000548477 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 ATP10BO94823 1461 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 TONSLQ96HA7 1378 aa25.95■■□□□ 1.75
SLC8B1-204ENST00000548477 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.95■■□□□ 1.74
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