RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 CEP170Q5SW79 1584 aa46.41■■■■■ 5.02
BRF1-213ENST00000548421 NUP160Q12769 1436 aa46.4■■■■■ 5.02
BRF1-213ENST00000548421 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.31■■■■■ 5
BRF1-213ENST00000548421 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.29■■■■■ 5
BRF1-213ENST00000548421 IQGAP2Q13576 1575 aa46.28■■■■■ 5
BRF1-213ENST00000548421 CEP162Q5TB80 1403 aa46.26■■■■■ 5
BRF1-213ENST00000548421 CLIP1P30622 1438 aa46.13■■■■■ 4.97
BRF1-213ENST00000548421 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
BRF1-213ENST00000548421 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
BRF1-213ENST00000548421 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.04■■■■■ 4.96
BRF1-213ENST00000548421 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.01■■■■■ 4.96
BRF1-213ENST00000548421 OSCARQ8IYS5 282 aa45.98■■■■■ 4.95
BRF1-213ENST00000548421 SAMD9Q5K651 1589 aa45.97■■■■■ 4.95
BRF1-213ENST00000548421 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.97■■■■■ 4.95
BRF1-213ENST00000548421 SHROOM2Q13796 1616 aa45.94■■■■■ 4.94
BRF1-213ENST00000548421 JPH4Q96JJ6 628 aa45.91■■■■■ 4.94
BRF1-213ENST00000548421 KIAA0556O60303 1618 aa45.82■■■■■ 4.93
BRF1-213ENST00000548421 DISP1Q96F81 1524 aa45.82■■■■■ 4.93
BRF1-213ENST00000548421 ARAP1Q96P48 1450 aa45.81■■■■■ 4.92
BRF1-213ENST00000548421 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.75■■■■■ 4.91
BRF1-213ENST00000548421 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
BRF1-213ENST00000548421 P3H3Q8IVL6 736 aa45.74■■■■■ 4.91
BRF1-213ENST00000548421 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.73■■■■■ 4.91
BRF1-213ENST00000548421 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.61■■■■■ 4.89
BRF1-213ENST00000548421 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.58■■■■■ 4.89
BRF1-213ENST00000548421 FMN1Q68DA7 1419 aa45.55■■■■■ 4.88
BRF1-213ENST00000548421 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
BRF1-213ENST00000548421 PTPRGP23470 1445 aa45.35■■■■■ 4.85
BRF1-213ENST00000548421 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
BRF1-213ENST00000548421 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.33■■■■■ 4.85
BRF1-213ENST00000548421 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.33■■■■■ 4.85
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF11O15085 1522 aa45.28■■■■■ 4.84
BRF1-213ENST00000548421 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.26■■■■■ 4.84
BRF1-213ENST00000548421 HECW1Q76N89 1606 aa45.22■■■■■ 4.83
BRF1-213ENST00000548421 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
BRF1-213ENST00000548421 ABCA8O94911 1581 aa45.21■■■■■ 4.83
BRF1-213ENST00000548421 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.16■■■■■ 4.82
BRF1-213ENST00000548421 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.16■■■■■ 4.82
BRF1-213ENST00000548421 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.16■■■■■ 4.82
BRF1-213ENST00000548421 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
BRF1-213ENST00000548421 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.11■■■■■ 4.81
BRF1-213ENST00000548421 UACAQ9BZF9 1416 aa45.11■■■■■ 4.81
BRF1-213ENST00000548421 APLP2Q06481 763 aa45.08■■■■■ 4.81
BRF1-213ENST00000548421 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
BRF1-213ENST00000548421 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.05■■■■■ 4.8
BRF1-213ENST00000548421 ABCC2Q92887 1545 aa45.04■■■■■ 4.8
BRF1-213ENST00000548421 MAP3K1Q13233 1512 aa45.03■■■■■ 4.8
BRF1-213ENST00000548421 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.03■■■■■ 4.8
BRF1-213ENST00000548421 TIAM1Q13009 1591 aa45.02■■■■■ 4.8
BRF1-213ENST00000548421 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
BRF1-213ENST00000548421 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.99■■■■■ 4.79
BRF1-213ENST00000548421 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
BRF1-213ENST00000548421 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.91■■■■■ 4.78
BRF1-213ENST00000548421 ARID3CA6NKF2 412 aa44.85■■■■■ 4.77
BRF1-213ENST00000548421 ATP10BO94823 1461 aa44.82■■■■■ 4.77
BRF1-213ENST00000548421 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.78■■■■■ 4.76
BRF1-213ENST00000548421 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.78■■■■■ 4.76
BRF1-213ENST00000548421 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
BRF1-213ENST00000548421 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.75■■■■■ 4.75
BRF1-213ENST00000548421 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
BRF1-213ENST00000548421 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
BRF1-213ENST00000548421 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
BRF1-213ENST00000548421 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
BRF1-213ENST00000548421 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.68■■■■■ 4.74
BRF1-213ENST00000548421 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.68■■■■■ 4.74
BRF1-213ENST00000548421 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
BRF1-213ENST00000548421 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.67■■■■■ 4.74
BRF1-213ENST00000548421 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
BRF1-213ENST00000548421 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.54■■■■■ 4.72
BRF1-213ENST00000548421 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
BRF1-213ENST00000548421 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
BRF1-213ENST00000548421 KIF14Q15058 1648 aa44.41■■■■■ 4.7
BRF1-213ENST00000548421 NCOA2Q15596 1464 aa44.4■■■■■ 4.7
BRF1-213ENST00000548421 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.38■■■■■ 4.7
BRF1-213ENST00000548421 ASXL2Q76L83 1435 aa44.37■■■■■ 4.69
BRF1-213ENST00000548421 MAPKBP1O60336 1514 aa44.34■■■■■ 4.69
BRF1-213ENST00000548421 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.26■■■■■ 4.68
BRF1-213ENST00000548421 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.22■■■■■ 4.67
BRF1-213ENST00000548421 KCNH8Q96L42 1107 aa44.2■■■■■ 4.67
BRF1-213ENST00000548421 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.66
BRF1-213ENST00000548421 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.16■■■■■ 4.66
BRF1-213ENST00000548421 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.16■■■■■ 4.66
BRF1-213ENST00000548421 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.15■■■■■ 4.66
BRF1-213ENST00000548421 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.15■■■■■ 4.66
BRF1-213ENST00000548421 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.12■■■■■ 4.65
BRF1-213ENST00000548421 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
BRF1-213ENST00000548421 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.08■■■■■ 4.65
BRF1-213ENST00000548421 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
BRF1-213ENST00000548421 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
BRF1-213ENST00000548421 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.07■■■■■ 4.64
BRF1-213ENST00000548421 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.06■■■■■ 4.64
BRF1-213ENST00000548421 PREX2Q70Z35 1606 aa44.03■■■■■ 4.64
BRF1-213ENST00000548421 MIA2Q96PC5 1412 aa44.02■■■■■ 4.64
BRF1-213ENST00000548421 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.98■■■■■ 4.63
BRF1-213ENST00000548421 DIP2BQ9P265 1576 aa43.96■■■■■ 4.63
BRF1-213ENST00000548421 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.96■■■■■ 4.63
BRF1-213ENST00000548421 GLI2P10070 1586 aa43.95■■■■■ 4.63
BRF1-213ENST00000548421 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
BRF1-213ENST00000548421 PLCH2O75038 1416 aa43.9■■■■■ 4.62
BRF1-213ENST00000548421 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.89■■■■■ 4.62
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