RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.01■■■□□ 2.23
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HOXD8-204ENST00000544999 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
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HOXD8-204ENST00000544999 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
HOXD8-204ENST00000544999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.78■■■□□ 2.2
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HOXD8-204ENST00000544999 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.54■■■□□ 2.16
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HOXD8-204ENST00000544999 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.53■■■□□ 2.16
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HOXD8-204ENST00000544999 HECW1Q76N89 1606 aa27.62■■■□□ 2.01
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HOXD8-204ENST00000544999 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.51■■■□□ 2
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HOXD8-204ENST00000544999 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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HOXD8-204ENST00000544999 ADGRL1O94910 1474 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 CEP162Q5TB80 1403 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 RICTORQ6R327 1708 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-204ENST00000544999 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD8-204ENST00000544999 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.17■■□□□ 1.94
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