RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.87■■■□□ 2.53
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COPS7A-216ENST00000543170 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.02■■■□□ 2.4
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COPS7A-216ENST00000543170 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.9■■■□□ 2.38
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.9■■■□□ 2.38
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COPS7A-216ENST00000543170 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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COPS7A-216ENST00000543170 TSPOAP1O95153 1857 aa29.55■■■□□ 2.32
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.55■■■□□ 2.32
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COPS7A-216ENST00000543170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
COPS7A-216ENST00000543170 KCNH8Q96L42 1107 aa29.46■■■□□ 2.31
COPS7A-216ENST00000543170 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.46■■■□□ 2.31
COPS7A-216ENST00000543170 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.45■■■□□ 2.31
COPS7A-216ENST00000543170 CD109Q6YHK3 1445 aa29.44■■■□□ 2.3
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COPS7A-216ENST00000543170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
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COPS7A-216ENST00000543170 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
COPS7A-216ENST00000543170 KDM6BO15054 1643 aa29.35■■■□□ 2.29
COPS7A-216ENST00000543170 KIF14Q15058 1648 aa29.35■■■□□ 2.29
COPS7A-216ENST00000543170 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.35■■■□□ 2.29
COPS7A-216ENST00000543170 NEO1Q92859 1461 aa29.24■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.24■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.24■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.24■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.23■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.2■■■□□ 2.27
COPS7A-216ENST00000543170 TIAM1Q13009 1591 aa29.2■■■□□ 2.26
COPS7A-216ENST00000543170 MAP3K1Q13233 1512 aa29.19■■■□□ 2.26
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COPS7A-216ENST00000543170 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
COPS7A-216ENST00000543170 FANCAO15360 1455 aa29.17■■■□□ 2.26
COPS7A-216ENST00000543170 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.15■■■□□ 2.26
COPS7A-216ENST00000543170 PREX2Q70Z35 1606 aa29.13■■■□□ 2.25
COPS7A-216ENST00000543170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.09■■■□□ 2.25
COPS7A-216ENST00000543170 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.08■■■□□ 2.25
COPS7A-216ENST00000543170 AKNAQ7Z591 1439 aa29.08■■■□□ 2.25
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.06■■■□□ 2.24
COPS7A-216ENST00000543170 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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