RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 JPH4Q96JJ6 628 aa42.5■■■■■ 4.39
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TM7SF3-212ENST00000543088 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.34■■■■■ 4.37
TM7SF3-212ENST00000543088 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
TM7SF3-212ENST00000543088 IQGAP2Q13576 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
TM7SF3-212ENST00000543088 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.11■■■■■ 4.33
TM7SF3-212ENST00000543088 PRXQ9BXM0 1461 aa42.05■■■■■ 4.32
TM7SF3-212ENST00000543088 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.01■■■■■ 4.32
TM7SF3-212ENST00000543088 EEA1Q15075 1411 aa41.99■■■■■ 4.31
TM7SF3-212ENST00000543088 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.96■■■■■ 4.31
TM7SF3-212ENST00000543088 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.95■■■■■ 4.31
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRGP23470 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
TM7SF3-212ENST00000543088 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.91■■■■■ 4.3
TM7SF3-212ENST00000543088 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.91■■■■■ 4.3
TM7SF3-212ENST00000543088 DISP1Q96F81 1524 aa41.9■■■■■ 4.3
TM7SF3-212ENST00000543088 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
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TM7SF3-212ENST00000543088 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.75■■■■■ 4.27
TM7SF3-212ENST00000543088 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
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TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC2Q92887 1545 aa41.64■■■■■ 4.26
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TM7SF3-212ENST00000543088 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.64■■■■■ 4.26
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TM7SF3-212ENST00000543088 KIF21BO75037 1637 aa41.56■■■■■ 4.24
TM7SF3-212ENST00000543088 DIP2BQ9P265 1576 aa41.52■■■■■ 4.24
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.49■■■■■ 4.23
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.44■■■■■ 4.23
TM7SF3-212ENST00000543088 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.42■■■■■ 4.22
TM7SF3-212ENST00000543088 SAMD9Q5K651 1589 aa41.41■■■■■ 4.22
TM7SF3-212ENST00000543088 ASXL2Q76L83 1435 aa41.39■■■■■ 4.22
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TM7SF3-212ENST00000543088 ABCA8O94911 1581 aa41.36■■■■■ 4.21
TM7SF3-212ENST00000543088 P3H3Q8IVL6 736 aa41.3■■■■■ 4.2
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TM7SF3-212ENST00000543088 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.2■■■■■ 4.19
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TM7SF3-212ENST00000543088 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.11■■■■■ 4.17
TM7SF3-212ENST00000543088 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.1■■■■■ 4.17
TM7SF3-212ENST00000543088 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.03■■■■■ 4.16
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM6BO15054 1643 aa41■■■■■ 4.15
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP10BO94823 1461 aa40.98■■■■■ 4.15
TM7SF3-212ENST00000543088 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
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TM7SF3-212ENST00000543088 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.92■■■■■ 4.14
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TM7SF3-212ENST00000543088 CD109Q6YHK3 1445 aa40.8■■■■■ 4.12
TM7SF3-212ENST00000543088 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.75■■■■■ 4.11
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.69■■■■■ 4.1
TM7SF3-212ENST00000543088 HECW1Q76N89 1606 aa40.68■■■■■ 4.1
TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.64■■■■■ 4.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
TM7SF3-212ENST00000543088 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-212ENST00000543088 CLIP1P30622 1438 aa40.5■■■■■ 4.07
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TM7SF3-212ENST00000543088 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.46■■■■■ 4.07
TM7SF3-212ENST00000543088 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
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TM7SF3-212ENST00000543088 NEO1Q92859 1461 aa40.41■■■■■ 4.06
TM7SF3-212ENST00000543088 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.41■■■■■ 4.06
TM7SF3-212ENST00000543088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.41■■■■■ 4.06
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TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.36■■■■■ 4.05
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.35■■■■■ 4.05
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.33■■■■■ 4.05
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.33■■■■■ 4.05
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TM7SF3-212ENST00000543088 KIF14Q15058 1648 aa40.28■■■■■ 4.04
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TM7SF3-212ENST00000543088 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
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TM7SF3-212ENST00000543088 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.1■■■■■ 4.01
TM7SF3-212ENST00000543088 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.1■■■■■ 4.01
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRL1O94910 1474 aa40.08■■■■■ 4.01
TM7SF3-212ENST00000543088 RICTORQ6R327 1708 aa40.05■■■■■ 4
TM7SF3-212ENST00000543088 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.02■■■■■ 4
TM7SF3-212ENST00000543088 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40■■■■□ 3.99
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP5Q13017 1502 aa40■■■■□ 3.99
TM7SF3-212ENST00000543088 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.94■■■■□ 3.98
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