RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541999.5

ATG16L2-217, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 3

Gene ATG16L2, Length 537 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-217ENST00000541999 KIF27Q86VH2 1401 aa29.97■■■□□ 2.39
ATG16L2-217ENST00000541999 CUL7Q14999 1698 aa29.95■■■□□ 2.38
ATG16L2-217ENST00000541999 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.85■■■□□ 2.37
ATG16L2-217ENST00000541999 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.8■■■□□ 2.36
ATG16L2-217ENST00000541999 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.77■■■□□ 2.36
ATG16L2-217ENST00000541999 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.75■■■□□ 2.35
ATG16L2-217ENST00000541999 MAPKBP1O60336 1514 aa29.63■■■□□ 2.33
ATG16L2-217ENST00000541999 IQGAP2Q13576 1575 aa29.61■■■□□ 2.33
ATG16L2-217ENST00000541999 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.6■■■□□ 2.33
ATG16L2-217ENST00000541999 DIP2BQ9P265 1576 aa29.58■■■□□ 2.33
ATG16L2-217ENST00000541999 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ATG16L2-217ENST00000541999 PTPRGP23470 1445 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG16L2-217ENST00000541999 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ATG16L2-217ENST00000541999 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG16L2-217ENST00000541999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.52■■■□□ 2.32
ATG16L2-217ENST00000541999 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.51■■■□□ 2.31
ATG16L2-217ENST00000541999 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.51■■■□□ 2.31
ATG16L2-217ENST00000541999 DISP1Q96F81 1524 aa29.5■■■□□ 2.31
ATG16L2-217ENST00000541999 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG16L2-217ENST00000541999 ABCC2Q92887 1545 aa29.41■■■□□ 2.3
ATG16L2-217ENST00000541999 TSPOAP1O95153 1857 aa29.4■■■□□ 2.3
ATG16L2-217ENST00000541999 KIAA0556O60303 1618 aa29.37■■■□□ 2.29
ATG16L2-217ENST00000541999 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.36■■■□□ 2.29
ATG16L2-217ENST00000541999 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
ATG16L2-217ENST00000541999 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ATG16L2-217ENST00000541999 UACAQ9BZF9 1416 aa29.34■■■□□ 2.29
ATG16L2-217ENST00000541999 ASXL2Q76L83 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
ATG16L2-217ENST00000541999 KDM6BO15054 1643 aa29.27■■■□□ 2.28
ATG16L2-217ENST00000541999 PRXQ9BXM0 1461 aa29.27■■■□□ 2.28
ATG16L2-217ENST00000541999 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.24■■■□□ 2.27
ATG16L2-217ENST00000541999 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ATG16L2-217ENST00000541999 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.24■■■□□ 2.27
ATG16L2-217ENST00000541999 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
ATG16L2-217ENST00000541999 GLI2P10070 1586 aa29.22■■■□□ 2.27
ATG16L2-217ENST00000541999 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ATG16L2-217ENST00000541999 GOLGA3Q08378 1498 aa29.12■■■□□ 2.25
ATG16L2-217ENST00000541999 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.1■■■□□ 2.25
ATG16L2-217ENST00000541999 ABCA8O94911 1581 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG16L2-217ENST00000541999 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.03■■■□□ 2.24
ATG16L2-217ENST00000541999 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29■■■□□ 2.23
ATG16L2-217ENST00000541999 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
ATG16L2-217ENST00000541999 P3H3Q8IVL6 736 aa28.95■■■□□ 2.22
ATG16L2-217ENST00000541999 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.94■■■□□ 2.22
ATG16L2-217ENST00000541999 SAMD9Q5K651 1589 aa28.93■■■□□ 2.22
ATG16L2-217ENST00000541999 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.91■■■□□ 2.22
ATG16L2-217ENST00000541999 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.88■■■□□ 2.21
ATG16L2-217ENST00000541999 EEA1Q15075 1411 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG16L2-217ENST00000541999 ARID3CA6NKF2 412 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG16L2-217ENST00000541999 KCNH8Q96L42 1107 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG16L2-217ENST00000541999 ATP10BO94823 1461 aa28.83■■■□□ 2.21
ATG16L2-217ENST00000541999 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
ATG16L2-217ENST00000541999 CD109Q6YHK3 1445 aa28.82■■■□□ 2.2
ATG16L2-217ENST00000541999 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.8■■■□□ 2.2
ATG16L2-217ENST00000541999 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.8■■■□□ 2.2
ATG16L2-217ENST00000541999 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
ATG16L2-217ENST00000541999 ADGRL1O94910 1474 aa28.74■■■□□ 2.19
ATG16L2-217ENST00000541999 KIF21BO75037 1637 aa28.73■■■□□ 2.19
ATG16L2-217ENST00000541999 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.73■■■□□ 2.19
ATG16L2-217ENST00000541999 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
ATG16L2-217ENST00000541999 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.68■■■□□ 2.18
ATG16L2-217ENST00000541999 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.59■■■□□ 2.17
ATG16L2-217ENST00000541999 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ATG16L2-217ENST00000541999 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ATG16L2-217ENST00000541999 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.58■■■□□ 2.17
ATG16L2-217ENST00000541999 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.58■■■□□ 2.17
ATG16L2-217ENST00000541999 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG16L2-217ENST00000541999 NEO1Q92859 1461 aa28.46■■■□□ 2.15
ATG16L2-217ENST00000541999 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.45■■■□□ 2.15
ATG16L2-217ENST00000541999 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
ATG16L2-217ENST00000541999 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.44■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 RAPGEF3O95398 923 aa28.43■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.143e-6■■□□□ 13.1
ATG16L2-217ENST00000541999 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.41■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.41■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.4■■■□□ 2.14
ATG16L2-217ENST00000541999 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.35■■■□□ 2.13
ATG16L2-217ENST00000541999 RICTORQ6R327 1708 aa28.33■■■□□ 2.13
ATG16L2-217ENST00000541999 HECW1Q76N89 1606 aa28.32■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 FANCAO15360 1455 aa28.31■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 AKNAQ7Z591 1439 aa28.3■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.29■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.28■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.27■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ATG16L2-217ENST00000541999 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ATG16L2-217ENST00000541999 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.25■■■□□ 2.11
ATG16L2-217ENST00000541999 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.23■■■□□ 2.11
ATG16L2-217ENST00000541999 KIF14Q15058 1648 aa28.21■■■□□ 2.11
ATG16L2-217ENST00000541999 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 MADDQ8WXG6 1647 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 PLCH2O75038 1416 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 PTPRMP28827 1452 aa28.17■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.17■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.14■■■□□ 2.1
ATG16L2-217ENST00000541999 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
ATG16L2-217ENST00000541999 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ATG16L2-217ENST00000541999 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms