RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 NUP160Q12769 1436 aa25.47■■□□□ 1.67
CADM1-211ENST00000541434 CEP170Q5SW79 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
CADM1-211ENST00000541434 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.42■■□□□ 1.66
CADM1-211ENST00000541434 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CADM1-211ENST00000541434 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
CADM1-211ENST00000541434 JPH4Q96JJ6 628 aa25.35■■□□□ 1.65
CADM1-211ENST00000541434 IQGAP2Q13576 1575 aa25.31■■□□□ 1.64
CADM1-211ENST00000541434 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.27■■□□□ 1.64
CADM1-211ENST00000541434 CEP162Q5TB80 1403 aa25.25■■□□□ 1.63
CADM1-211ENST00000541434 CLIP1P30622 1438 aa25.22■■□□□ 1.63
CADM1-211ENST00000541434 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.22■■□□□ 1.63
CADM1-211ENST00000541434 P3H3Q8IVL6 736 aa25.2■■□□□ 1.62
CADM1-211ENST00000541434 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CADM1-211ENST00000541434 SHROOM2Q13796 1616 aa25.15■■□□□ 1.62
CADM1-211ENST00000541434 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.15■■□□□ 1.62
CADM1-211ENST00000541434 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.14■■□□□ 1.62
CADM1-211ENST00000541434 DISP1Q96F81 1524 aa25.12■■□□□ 1.61
CADM1-211ENST00000541434 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
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CADM1-211ENST00000541434 KIAA0556O60303 1618 aa25.05■■□□□ 1.6
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CADM1-211ENST00000541434 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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CADM1-211ENST00000541434 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.03■■□□□ 1.6
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CADM1-211ENST00000541434 FMN1Q68DA7 1419 aa24.94■■□□□ 1.58
CADM1-211ENST00000541434 ARHGEF11O15085 1522 aa24.93■■□□□ 1.58
CADM1-211ENST00000541434 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.89■■□□□ 1.58
CADM1-211ENST00000541434 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.87■■□□□ 1.57
CADM1-211ENST00000541434 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CADM1-211ENST00000541434 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
CADM1-211ENST00000541434 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
CADM1-211ENST00000541434 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
CADM1-211ENST00000541434 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.82■■□□□ 1.56
CADM1-211ENST00000541434 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.82■■□□□ 1.56
CADM1-211ENST00000541434 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.81■■□□□ 1.56
CADM1-211ENST00000541434 UACAQ9BZF9 1416 aa24.8■■□□□ 1.56
CADM1-211ENST00000541434 ABCA8O94911 1581 aa24.76■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 APLP2Q06481 763 aa24.75■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.75■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.74■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 ARID3CA6NKF2 412 aa24.73■■□□□ 1.55
CADM1-211ENST00000541434 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.7■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 ABCC2Q92887 1545 aa24.68■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 HECW1Q76N89 1606 aa24.68■■□□□ 1.54
CADM1-211ENST00000541434 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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CADM1-211ENST00000541434 ATP10BO94823 1461 aa24.63■■□□□ 1.53
CADM1-211ENST00000541434 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.62■■□□□ 1.53
CADM1-211ENST00000541434 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.61■■□□□ 1.53
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CADM1-211ENST00000541434 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CADM1-211ENST00000541434 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.58■■□□□ 1.53
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CADM1-211ENST00000541434 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CADM1-211ENST00000541434 TIAM1Q13009 1591 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM1-211ENST00000541434 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CADM1-211ENST00000541434 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.48■■□□□ 1.51
CADM1-211ENST00000541434 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.48■■□□□ 1.51
CADM1-211ENST00000541434 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.48■■□□□ 1.51
CADM1-211ENST00000541434 KCNH8Q96L42 1107 aa24.43■■□□□ 1.5
CADM1-211ENST00000541434 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.42■■□□□ 1.5
CADM1-211ENST00000541434 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CADM1-211ENST00000541434 ASXL2Q76L83 1435 aa24.41■■□□□ 1.5
CADM1-211ENST00000541434 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.37■■□□□ 1.49
CADM1-211ENST00000541434 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.36■■□□□ 1.49
CADM1-211ENST00000541434 MAPKBP1O60336 1514 aa24.34■■□□□ 1.49
CADM1-211ENST00000541434 NCOA2Q15596 1464 aa24.29■■□□□ 1.48
CADM1-211ENST00000541434 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CADM1-211ENST00000541434 KIF14Q15058 1648 aa24.26■■□□□ 1.47
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CADM1-211ENST00000541434 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.23■■□□□ 1.47
CADM1-211ENST00000541434 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.22■■□□□ 1.47
CADM1-211ENST00000541434 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.22■■□□□ 1.47
CADM1-211ENST00000541434 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
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CADM1-211ENST00000541434 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.16■■□□□ 1.46
CADM1-211ENST00000541434 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.14■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.13■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 GLI2P10070 1586 aa24.13■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 PLCH2O75038 1416 aa24.12■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 CD109Q6YHK3 1445 aa24.12■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 DIP2BQ9P265 1576 aa24.11■■□□□ 1.45
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CADM1-211ENST00000541434 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 MIA2Q96PC5 1412 aa24.1■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.09■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.09■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.08■■□□□ 1.45
CADM1-211ENST00000541434 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.06■■□□□ 1.44
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