RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.91■■■■■ 4.14
PITX3-202ENST00000539804 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.83■■■■■ 4.13
PITX3-202ENST00000539804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
PITX3-202ENST00000539804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.72■■■■■ 4.11
PITX3-202ENST00000539804 EEA1Q15075 1411 aa40.67■■■■■ 4.1
PITX3-202ENST00000539804 IQGAP2Q13576 1575 aa40.61■■■■■ 4.09
PITX3-202ENST00000539804 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.59■■■■■ 4.09
PITX3-202ENST00000539804 PRXQ9BXM0 1461 aa40.56■■■■■ 4.08
PITX3-202ENST00000539804 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.52■■■■■ 4.08
PITX3-202ENST00000539804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
PITX3-202ENST00000539804 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.43■■■■■ 4.06
PITX3-202ENST00000539804 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.39■■■■■ 4.06
PITX3-202ENST00000539804 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.39■■■■■ 4.06
PITX3-202ENST00000539804 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.38■■■■■ 4.05
PITX3-202ENST00000539804 PTPRGP23470 1445 aa40.36■■■■■ 4.05
PITX3-202ENST00000539804 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA3Q08378 1498 aa40.29■■■■■ 4.04
PITX3-202ENST00000539804 DISP1Q96F81 1524 aa40.25■■■■■ 4.03
PITX3-202ENST00000539804 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0556O60303 1618 aa40.19■■■■■ 4.02
PITX3-202ENST00000539804 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.15■■■■■ 4.02
PITX3-202ENST00000539804 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
PITX3-202ENST00000539804 KIF21BO75037 1637 aa40.1■■■■■ 4.01
PITX3-202ENST00000539804 MAPKBP1O60336 1514 aa40.09■■■■■ 4.01
PITX3-202ENST00000539804 UACAQ9BZF9 1416 aa40.08■■■■■ 4.01
PITX3-202ENST00000539804 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.08■■■■■ 4.01
PITX3-202ENST00000539804 ABCC2Q92887 1545 aa40.02■■■■■ 4
PITX3-202ENST00000539804 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.91■■■■□ 3.98
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PITX3-202ENST00000539804 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.84■■■■□ 3.97
PITX3-202ENST00000539804 SAMD9Q5K651 1589 aa39.84■■■■□ 3.97
PITX3-202ENST00000539804 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.83■■■■□ 3.97
PITX3-202ENST00000539804 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PITX3-202ENST00000539804 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.79■■■■□ 3.96
PITX3-202ENST00000539804 DIP2BQ9P265 1576 aa39.76■■■■□ 3.96
PITX3-202ENST00000539804 ABCA8O94911 1581 aa39.76■■■■□ 3.95
PITX3-202ENST00000539804 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.75■■■■□ 3.95
PITX3-202ENST00000539804 ASXL2Q76L83 1435 aa39.74■■■■□ 3.95
PITX3-202ENST00000539804 P3H3Q8IVL6 736 aa39.73■■■■□ 3.95
PITX3-202ENST00000539804 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
PITX3-202ENST00000539804 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
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PITX3-202ENST00000539804 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.55■■■■□ 3.92
PITX3-202ENST00000539804 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.55■■■■□ 3.92
PITX3-202ENST00000539804 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.54■■■■□ 3.92
PITX3-202ENST00000539804 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.54■■■■□ 3.92
PITX3-202ENST00000539804 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
PITX3-202ENST00000539804 FMN1Q68DA7 1419 aa39.43■■■■□ 3.9
PITX3-202ENST00000539804 ATP10BO94823 1461 aa39.43■■■■□ 3.9
PITX3-202ENST00000539804 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
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PITX3-202ENST00000539804 TSPOAP1O95153 1857 aa39.36■■■■□ 3.89
PITX3-202ENST00000539804 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.36■■■■□ 3.89
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.35■■■■□ 3.89
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.33■■■■□ 3.89
PITX3-202ENST00000539804 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
PITX3-202ENST00000539804 KCNH8Q96L42 1107 aa39.31■■■■□ 3.88
PITX3-202ENST00000539804 ARID3CA6NKF2 412 aa39.29■■■■□ 3.88
PITX3-202ENST00000539804 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.25■■■■□ 3.87
PITX3-202ENST00000539804 KDM6BO15054 1643 aa39.25■■■■□ 3.87
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.23■■■■□ 3.87
PITX3-202ENST00000539804 CD109Q6YHK3 1445 aa39.23■■■■□ 3.87
PITX3-202ENST00000539804 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
PITX3-202ENST00000539804 HECW1Q76N89 1606 aa39.18■■■■□ 3.86
PITX3-202ENST00000539804 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.18■■■■□ 3.86
PITX3-202ENST00000539804 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
PITX3-202ENST00000539804 CLIP1P30622 1438 aa39.12■■■■□ 3.85
PITX3-202ENST00000539804 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PITX3-202ENST00000539804 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.08■■■■□ 3.85
PITX3-202ENST00000539804 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.05■■■■□ 3.84
PITX3-202ENST00000539804 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39■■■■□ 3.83
PITX3-202ENST00000539804 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
PITX3-202ENST00000539804 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.96■■■■□ 3.83
PITX3-202ENST00000539804 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.92■■■■□ 3.82
PITX3-202ENST00000539804 NEO1Q92859 1461 aa38.89■■■■□ 3.82
PITX3-202ENST00000539804 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
PITX3-202ENST00000539804 CEP162Q5TB80 1403 aa38.85■■■■□ 3.81
PITX3-202ENST00000539804 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.84■■■■□ 3.81
PITX3-202ENST00000539804 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
PITX3-202ENST00000539804 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.8
PITX3-202ENST00000539804 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
PITX3-202ENST00000539804 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.79■■■■□ 3.8
PITX3-202ENST00000539804 KIF14Q15058 1648 aa38.76■■■■□ 3.8
PITX3-202ENST00000539804 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.71■■■■□ 3.79
PITX3-202ENST00000539804 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.7■■■■□ 3.79
PITX3-202ENST00000539804 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
PITX3-202ENST00000539804 FANCAO15360 1455 aa38.7■■■■□ 3.79
PITX3-202ENST00000539804 PLCH2O75038 1416 aa38.68■■■■□ 3.78
PITX3-202ENST00000539804 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.67■■■■□ 3.78
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PITX3-202ENST00000539804 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
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PITX3-202ENST00000539804 ADGRL1O94910 1474 aa38.49■■■■□ 3.75
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PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.48■■■■□ 3.75
PITX3-202ENST00000539804 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.46■■■■□ 3.75
PITX3-202ENST00000539804 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.42■■■■□ 3.74
PITX3-202ENST00000539804 RICTORQ6R327 1708 aa38.39■■■■□ 3.74
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