RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.61■■■□□ 2.97
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CITED2-202ENST00000536159 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.71■■■□□ 2.83
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CITED2-202ENST00000536159 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.33■■■□□ 2.77
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CITED2-202ENST00000536159 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.3■■■□□ 2.76
CITED2-202ENST00000536159 ITGAEP38570 1179 aa32.28■■■□□ 2.76
CITED2-202ENST00000536159 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.21■■■□□ 2.75
CITED2-202ENST00000536159 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
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CITED2-202ENST00000536159 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.16■■■□□ 2.74
CITED2-202ENST00000536159 MIA2Q96PC5 1412 aa32.15■■■□□ 2.74
CITED2-202ENST00000536159 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
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CITED2-202ENST00000536159 KCNH8Q96L42 1107 aa32.09■■■□□ 2.73
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CITED2-202ENST00000536159 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
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CITED2-202ENST00000536159 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.07■■■□□ 2.72
CITED2-202ENST00000536159 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CITED2-202ENST00000536159 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.03■■■□□ 2.72
CITED2-202ENST00000536159 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.98■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CITED2-202ENST00000536159 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.94■■■□□ 2.72e-6■■□□□ 13.1
CITED2-202ENST00000536159 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.93■■■□□ 2.7
CITED2-202ENST00000536159 PTPRKQ15262 1439 aa31.93■■■□□ 2.7
CITED2-202ENST00000536159 ASXL2Q76L83 1435 aa31.92■■■□□ 2.7
CITED2-202ENST00000536159 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.9■■■□□ 2.7
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