RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535759.1

TPRX1-202, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 2,059 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-202ENST00000535759 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.15■■□□□ 1.14
TPRX1-202ENST00000535759 WDR62O43379 1518 aa22.14■■□□□ 1.13
TPRX1-202ENST00000535759 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TPRX1-202ENST00000535759 PBRM1Q86U86 1689 aa22.09■■□□□ 1.13
TPRX1-202ENST00000535759 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.08■■□□□ 1.13
TPRX1-202ENST00000535759 ERCC6Q03468 1493 aa22.07■■□□□ 1.12
TPRX1-202ENST00000535759 NEUROD1Q13562 356 aa22.07■■□□□ 1.12
TPRX1-202ENST00000535759 IFT140Q96RY7 1462 aa22.05■■□□□ 1.12
TPRX1-202ENST00000535759 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
TPRX1-202ENST00000535759 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 GRIN2BQ13224 1484 aa21.98■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 MAP3K1Q13233 1512 aa21.98■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 ADAMTS12P58397 1594 aa21.98■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 TIAM1Q13009 1591 aa21.97■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.96■■□□□ 1.11
TPRX1-202ENST00000535759 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 P3H3Q8IVL6 736 aa21.94■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 SAMD9Q5K651 1589 aa21.92■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.9■■□□□ 1.1
TPRX1-202ENST00000535759 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.88■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 FMN1Q68DA7 1419 aa21.88■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.87■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.85■■□□□ 1.09
TPRX1-202ENST00000535759 IQGAP2Q13576 1575 aa21.83■■□□□ 1.08
TPRX1-202ENST00000535759 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.81■■□□□ 1.08
TPRX1-202ENST00000535759 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TPRX1-202ENST00000535759 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.77■■□□□ 1.08
TPRX1-202ENST00000535759 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TPRX1-202ENST00000535759 GRIN2AQ12879 1464 aa21.73■■□□□ 1.07
TPRX1-202ENST00000535759 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.71■■□□□ 1.07
TPRX1-202ENST00000535759 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.71■■□□□ 1.07
TPRX1-202ENST00000535759 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.69■■□□□ 1.06
TPRX1-202ENST00000535759 SYNJ2O15056 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
TPRX1-202ENST00000535759 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.67■■□□□ 1.06
TPRX1-202ENST00000535759 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.66■■□□□ 1.06
TPRX1-202ENST00000535759 HECW1Q76N89 1606 aa21.62■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 MIER1Q8N108 512 aa21.62■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 KIAA0556O60303 1618 aa21.6■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 CEP170Q5SW79 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TPRX1-202ENST00000535759 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.57■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 DISP1Q96F81 1524 aa21.57■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 ITGAEP38570 1179 aa21.55■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 FBLN2P98095 1184 aa21.53■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 NUP160Q12769 1436 aa21.53■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TPRX1-202ENST00000535759 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TPRX1-202ENST00000535759 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
TPRX1-202ENST00000535759 NCOA2Q15596 1464 aa21.5■■□□□ 1.03
TPRX1-202ENST00000535759 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.5■■□□□ 1.03
TPRX1-202ENST00000535759 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.47■■□□□ 1.03
TPRX1-202ENST00000535759 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 MYT1Q01538 1121 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 ARHGEF11O15085 1522 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.42■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.42■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.41■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
TPRX1-202ENST00000535759 JPH4Q96JJ6 628 aa21.38■■□□□ 1.01
TPRX1-202ENST00000535759 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.35■■□□□ 1.01
TPRX1-202ENST00000535759 ARID3CA6NKF2 412 aa21.35■■□□□ 1.01
TPRX1-202ENST00000535759 CHD1O14646 1710 aa21.34■■□□□ 1.01
TPRX1-202ENST00000535759 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.31■■□□□ 1
TPRX1-202ENST00000535759 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TPRX1-202ENST00000535759 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TPRX1-202ENST00000535759 MIA2Q96PC5 1412 aa21.28■■□□□ 1
TPRX1-202ENST00000535759 PTPRKQ15262 1439 aa21.25■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 MAPKBP1O60336 1514 aa21.24■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 ABCA8O94911 1581 aa21.24■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 HFM1A2PYH4 1435 aa21.24■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
TPRX1-202ENST00000535759 SHROOM2Q13796 1616 aa21.19■□□□□ 0.98
TPRX1-202ENST00000535759 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.18■□□□□ 0.98
TPRX1-202ENST00000535759 NAIPQ13075 1403 aa21.17■□□□□ 0.98
TPRX1-202ENST00000535759 PTPRGP23470 1445 aa21.15■□□□□ 0.98
TPRX1-202ENST00000535759 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.15■□□□□ 0.98
TPRX1-202ENST00000535759 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.14■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 AKNAQ7Z591 1439 aa21.13■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 KIF14Q15058 1648 aa21.13■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 ATP10BO94823 1461 aa21.11■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 UACAQ9BZF9 1416 aa21.11■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TPRX1-202ENST00000535759 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
TPRX1-202ENST00000535759 DAPK1P53355 1430 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms