RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535710.1

VWCE-205, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VWCE, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-205ENST00000535710 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
VWCE-205ENST00000535710 SHROOM2Q13796 1616 aa24.19■■□□□ 1.46
VWCE-205ENST00000535710 CUL7Q14999 1698 aa24.18■■□□□ 1.46
VWCE-205ENST00000535710 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.14■■□□□ 1.45
VWCE-205ENST00000535710 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.06■■□□□ 1.44
VWCE-205ENST00000535710 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.01■■□□□ 1.43
VWCE-205ENST00000535710 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
VWCE-205ENST00000535710 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VWCE-205ENST00000535710 PRXQ9BXM0 1461 aa23.97■■□□□ 1.43
VWCE-205ENST00000535710 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.96■■□□□ 1.43
VWCE-205ENST00000535710 IQGAP2Q13576 1575 aa23.92■■□□□ 1.42
VWCE-205ENST00000535710 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
VWCE-205ENST00000535710 PTPRGP23470 1445 aa23.88■■□□□ 1.41
VWCE-205ENST00000535710 DISP1Q96F81 1524 aa23.88■■□□□ 1.41
VWCE-205ENST00000535710 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.85■■□□□ 1.41
VWCE-205ENST00000535710 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.84■■□□□ 1.41
VWCE-205ENST00000535710 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
VWCE-205ENST00000535710 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.81■■□□□ 1.4
VWCE-205ENST00000535710 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
VWCE-205ENST00000535710 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.78■■□□□ 1.4
VWCE-205ENST00000535710 EEA1Q15075 1411 aa23.75■■□□□ 1.39
VWCE-205ENST00000535710 P3H3Q8IVL6 736 aa23.74■■□□□ 1.39
VWCE-205ENST00000535710 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
VWCE-205ENST00000535710 KIAA0556O60303 1618 aa23.71■■□□□ 1.39
VWCE-205ENST00000535710 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.69■■□□□ 1.38
VWCE-205ENST00000535710 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.69■■□□□ 1.38
VWCE-205ENST00000535710 UACAQ9BZF9 1416 aa23.69■■□□□ 1.38
VWCE-205ENST00000535710 ABCC2Q92887 1545 aa23.63■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.62■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 MAPKBP1O60336 1514 aa23.62■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.61■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 GOLGA3Q08378 1498 aa23.6■■□□□ 1.37
VWCE-205ENST00000535710 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.57■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 ASXL2Q76L83 1435 aa23.56■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 ARID3CA6NKF2 412 aa23.56■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.53■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 KIF21BO75037 1637 aa23.53■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 DIP2BQ9P265 1576 aa23.53■■□□□ 1.36
VWCE-205ENST00000535710 ABCA8O94911 1581 aa23.5■■□□□ 1.35
VWCE-205ENST00000535710 SAMD9Q5K651 1589 aa23.47■■□□□ 1.35
VWCE-205ENST00000535710 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.47■■□□□ 1.35
VWCE-205ENST00000535710 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
VWCE-205ENST00000535710 KCNH8Q96L42 1107 aa23.42■■□□□ 1.34
VWCE-205ENST00000535710 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VWCE-205ENST00000535710 ATP10BO94823 1461 aa23.39■■□□□ 1.33
VWCE-205ENST00000535710 TSPOAP1O95153 1857 aa23.36■■□□□ 1.33
VWCE-205ENST00000535710 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.35■■□□□ 1.33
VWCE-205ENST00000535710 GLI2P10070 1586 aa23.33■■□□□ 1.33
VWCE-205ENST00000535710 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.29■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.28■■□□□ 1.32
VWCE-205ENST00000535710 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.25■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 KDM6BO15054 1643 aa23.24■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.22■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 CD109Q6YHK3 1445 aa23.21■■□□□ 1.31
VWCE-205ENST00000535710 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.16■■□□□ 1.3
VWCE-205ENST00000535710 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.15■■□□□ 1.3
VWCE-205ENST00000535710 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
VWCE-205ENST00000535710 FMN1Q68DA7 1419 aa23.12■■□□□ 1.29
VWCE-205ENST00000535710 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.1■■□□□ 1.29
VWCE-205ENST00000535710 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.1■■□□□ 1.29
VWCE-205ENST00000535710 CLIP1P30622 1438 aa23.07■■□□□ 1.28
VWCE-205ENST00000535710 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.05■■□□□ 1.28
VWCE-205ENST00000535710 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.03■■□□□ 1.28
VWCE-205ENST00000535710 RAPGEF3O95398 923 aa22.99■■□□□ 1.27
VWCE-205ENST00000535710 HECW1Q76N89 1606 aa22.98■■□□□ 1.27
VWCE-205ENST00000535710 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
VWCE-205ENST00000535710 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.98■■□□□ 1.27
VWCE-205ENST00000535710 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
VWCE-205ENST00000535710 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.95■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 CEP162Q5TB80 1403 aa22.94■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 ADGRL1O94910 1474 aa22.93■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.92■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.91■■□□□ 1.26
VWCE-205ENST00000535710 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 NEO1Q92859 1461 aa22.88■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 KIF14Q15058 1648 aa22.86■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 AKNAQ7Z591 1439 aa22.86■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 FANCAO15360 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.86■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 PLCH2O75038 1416 aa22.86■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.85■■□□□ 1.25
VWCE-205ENST00000535710 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.8■■□□□ 1.24
VWCE-205ENST00000535710 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.78■■□□□ 1.24
VWCE-205ENST00000535710 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.78■■□□□ 1.24
VWCE-205ENST00000535710 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VWCE-205ENST00000535710 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.76■■□□□ 1.23
VWCE-205ENST00000535710 AFAP1Q8N556 730 aa22.71■■□□□ 1.23
VWCE-205ENST00000535710 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.7■■□□□ 1.22
VWCE-205ENST00000535710 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms