RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534208.5

NDUFS3-212, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene NDUFS3, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-212ENST00000534208 JPH4Q96JJ6 628 aa34.48■■■■□ 3.11
NDUFS3-212ENST00000534208 CUL7Q14999 1698 aa34.44■■■■□ 3.1
NDUFS3-212ENST00000534208 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.35■■■■□ 3.09
NDUFS3-212ENST00000534208 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.25■■■■□ 3.07
NDUFS3-212ENST00000534208 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.08■■■■□ 3.05
NDUFS3-212ENST00000534208 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.08■■■■□ 3.05
NDUFS3-212ENST00000534208 MAPKBP1O60336 1514 aa34.04■■■■□ 3.04
NDUFS3-212ENST00000534208 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.04
NDUFS3-212ENST00000534208 IQGAP2Q13576 1575 aa34.02■■■■□ 3.04
NDUFS3-212ENST00000534208 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.98■■■■□ 3.03
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.98■■■■□ 3.03
NDUFS3-212ENST00000534208 PTPRGP23470 1445 aa33.97■■■■□ 3.03
NDUFS3-212ENST00000534208 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.97■■■■□ 3.03
NDUFS3-212ENST00000534208 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.93■■■■□ 3.02
NDUFS3-212ENST00000534208 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.89■■■■□ 3.02
NDUFS3-212ENST00000534208 DIP2BQ9P265 1576 aa33.89■■■■□ 3.02
NDUFS3-212ENST00000534208 DISP1Q96F81 1524 aa33.85■■■■□ 3.01
NDUFS3-212ENST00000534208 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.84■■■■□ 3.01
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCC2Q92887 1545 aa33.8■■■■□ 3
NDUFS3-212ENST00000534208 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
NDUFS3-212ENST00000534208 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.77■■■■□ 3
NDUFS3-212ENST00000534208 UACAQ9BZF9 1416 aa33.73■■■□□ 2.99
NDUFS3-212ENST00000534208 KIAA0556O60303 1618 aa33.71■■■□□ 2.99
NDUFS3-212ENST00000534208 PRXQ9BXM0 1461 aa33.69■■■□□ 2.98
NDUFS3-212ENST00000534208 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.68■■■□□ 2.98
NDUFS3-212ENST00000534208 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.65■■■□□ 2.98
NDUFS3-212ENST00000534208 ASXL2Q76L83 1435 aa33.64■■■□□ 2.98
NDUFS3-212ENST00000534208 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
NDUFS3-212ENST00000534208 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.61■■■□□ 2.97
NDUFS3-212ENST00000534208 GLI2P10070 1586 aa33.58■■■□□ 2.97
NDUFS3-212ENST00000534208 TSPOAP1O95153 1857 aa33.58■■■□□ 2.97
NDUFS3-212ENST00000534208 GOLGA3Q08378 1498 aa33.56■■■□□ 2.96
NDUFS3-212ENST00000534208 KDM6BO15054 1643 aa33.53■■■□□ 2.96
NDUFS3-212ENST00000534208 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
NDUFS3-212ENST00000534208 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
NDUFS3-212ENST00000534208 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
NDUFS3-212ENST00000534208 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.42■■■□□ 2.94
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCA8O94911 1581 aa33.41■■■□□ 2.94
NDUFS3-212ENST00000534208 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.38■■■□□ 2.93
NDUFS3-212ENST00000534208 EEA1Q15075 1411 aa33.36■■■□□ 2.93
NDUFS3-212ENST00000534208 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.35■■■□□ 2.93
NDUFS3-212ENST00000534208 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.27■■■□□ 2.92
NDUFS3-212ENST00000534208 SAMD9Q5K651 1589 aa33.24■■■□□ 2.91
NDUFS3-212ENST00000534208 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
NDUFS3-212ENST00000534208 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
NDUFS3-212ENST00000534208 P3H3Q8IVL6 736 aa33.18■■■□□ 2.9
NDUFS3-212ENST00000534208 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.15■■■□□ 2.9
NDUFS3-212ENST00000534208 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.12■■■□□ 2.89
NDUFS3-212ENST00000534208 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.12■■■□□ 2.89
NDUFS3-212ENST00000534208 CD109Q6YHK3 1445 aa33.11■■■□□ 2.89
NDUFS3-212ENST00000534208 KCNH8Q96L42 1107 aa33.11■■■□□ 2.89
NDUFS3-212ENST00000534208 ATP10BO94823 1461 aa33.11■■■□□ 2.89
NDUFS3-212ENST00000534208 KIF21BO75037 1637 aa33.07■■■□□ 2.88
NDUFS3-212ENST00000534208 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.06■■■□□ 2.88
NDUFS3-212ENST00000534208 ARID3CA6NKF2 412 aa33.01■■■□□ 2.87
NDUFS3-212ENST00000534208 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.96■■■□□ 2.87
NDUFS3-212ENST00000534208 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
NDUFS3-212ENST00000534208 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.94■■■□□ 2.86
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.94■■■□□ 2.86
NDUFS3-212ENST00000534208 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
NDUFS3-212ENST00000534208 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.91■■■□□ 2.86
NDUFS3-212ENST00000534208 ADGRL1O94910 1474 aa32.91■■■□□ 2.86
NDUFS3-212ENST00000534208 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.87■■■□□ 2.85
NDUFS3-212ENST00000534208 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
NDUFS3-212ENST00000534208 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
NDUFS3-212ENST00000534208 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.83■■■□□ 2.85
NDUFS3-212ENST00000534208 NEO1Q92859 1461 aa32.76■■■□□ 2.84
NDUFS3-212ENST00000534208 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
NDUFS3-212ENST00000534208 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.73■■■□□ 2.83
NDUFS3-212ENST00000534208 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.65■■■□□ 2.82
NDUFS3-212ENST00000534208 FMN1Q68DA7 1419 aa32.64■■■□□ 2.82
NDUFS3-212ENST00000534208 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.64■■■□□ 2.82
NDUFS3-212ENST00000534208 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.811e-6■■■■□ 25.1
NDUFS3-212ENST00000534208 RAPGEF3O95398 923 aa32.6■■■□□ 2.81
NDUFS3-212ENST00000534208 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
NDUFS3-212ENST00000534208 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.58■■■□□ 2.81
NDUFS3-212ENST00000534208 HECW1Q76N89 1606 aa32.56■■■□□ 2.8
NDUFS3-212ENST00000534208 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.55■■■□□ 2.8
NDUFS3-212ENST00000534208 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.54■■■□□ 2.8
NDUFS3-212ENST00000534208 FANCAO15360 1455 aa32.53■■■□□ 2.8
NDUFS3-212ENST00000534208 AKNAQ7Z591 1439 aa32.51■■■□□ 2.8
NDUFS3-212ENST00000534208 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
NDUFS3-212ENST00000534208 RICTORQ6R327 1708 aa32.46■■■□□ 2.79
NDUFS3-212ENST00000534208 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 PLCH2O75038 1416 aa32.43■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.41■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.41■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.41■■■□□ 2.78
NDUFS3-212ENST00000534208 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.38■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.34■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.34■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.33■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 KIF14Q15058 1648 aa32.33■■■□□ 2.77
NDUFS3-212ENST00000534208 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.31■■■□□ 2.76
NDUFS3-212ENST00000534208 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.31■■■□□ 2.76
NDUFS3-212ENST00000534208 PTPRMP28827 1452 aa32.3■■■□□ 2.76
NDUFS3-212ENST00000534208 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
NDUFS3-212ENST00000534208 CLIP1P30622 1438 aa32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms