RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-209ENST00000534197 KIF27Q86VH2 1401 aa38.62■■■■□ 3.77
GNPTG-209ENST00000534197 CUL7Q14999 1698 aa38.55■■■■□ 3.76
GNPTG-209ENST00000534197 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.48■■■■□ 3.75
GNPTG-209ENST00000534197 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.45■■■■□ 3.75
GNPTG-209ENST00000534197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.38■■■■□ 3.73
GNPTG-209ENST00000534197 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.34■■■■□ 3.73
GNPTG-209ENST00000534197 MAPKBP1O60336 1514 aa38.22■■■■□ 3.71
GNPTG-209ENST00000534197 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.2■■■■□ 3.71
GNPTG-209ENST00000534197 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.7
GNPTG-209ENST00000534197 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.16■■■■□ 3.7
GNPTG-209ENST00000534197 IQGAP2Q13576 1575 aa38.13■■■■□ 3.69
GNPTG-209ENST00000534197 DIP2BQ9P265 1576 aa38.13■■■■□ 3.69
GNPTG-209ENST00000534197 PTPRGP23470 1445 aa38.11■■■■□ 3.69
GNPTG-209ENST00000534197 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
GNPTG-209ENST00000534197 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.04■■■■□ 3.68
GNPTG-209ENST00000534197 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.04■■■■□ 3.68
GNPTG-209ENST00000534197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.02■■■■□ 3.68
GNPTG-209ENST00000534197 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
GNPTG-209ENST00000534197 DISP1Q96F81 1524 aa37.99■■■■□ 3.67
GNPTG-209ENST00000534197 TSPOAP1O95153 1857 aa37.94■■■■□ 3.66
GNPTG-209ENST00000534197 ABCC2Q92887 1545 aa37.92■■■■□ 3.66
GNPTG-209ENST00000534197 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
GNPTG-209ENST00000534197 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.84■■■■□ 3.65
GNPTG-209ENST00000534197 UACAQ9BZF9 1416 aa37.83■■■■□ 3.65
GNPTG-209ENST00000534197 KIAA0556O60303 1618 aa37.81■■■■□ 3.64
GNPTG-209ENST00000534197 ASXL2Q76L83 1435 aa37.8■■■■□ 3.64
GNPTG-209ENST00000534197 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.77■■■■□ 3.64
GNPTG-209ENST00000534197 KDM6BO15054 1643 aa37.76■■■■□ 3.63
GNPTG-209ENST00000534197 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.72■■■■□ 3.63
GNPTG-209ENST00000534197 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.7■■■■□ 3.63
GNPTG-209ENST00000534197 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
GNPTG-209ENST00000534197 GLI2P10070 1586 aa37.68■■■■□ 3.62
GNPTG-209ENST00000534197 PRXQ9BXM0 1461 aa37.68■■■■□ 3.62
GNPTG-209ENST00000534197 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
GNPTG-209ENST00000534197 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
GNPTG-209ENST00000534197 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.52■■■■□ 3.6
GNPTG-209ENST00000534197 GOLGA3Q08378 1498 aa37.52■■■■□ 3.6
GNPTG-209ENST00000534197 ABCA8O94911 1581 aa37.47■■■■□ 3.59
GNPTG-209ENST00000534197 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.43■■■■□ 3.58
GNPTG-209ENST00000534197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
GNPTG-209ENST00000534197 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.41■■■■□ 3.58
GNPTG-209ENST00000534197 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.36■■■■□ 3.57
GNPTG-209ENST00000534197 P3H3Q8IVL6 736 aa37.31■■■■□ 3.56
GNPTG-209ENST00000534197 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.3■■■■□ 3.56
GNPTG-209ENST00000534197 KCNH8Q96L42 1107 aa37.25■■■■□ 3.55
GNPTG-209ENST00000534197 SAMD9Q5K651 1589 aa37.23■■■■□ 3.55
GNPTG-209ENST00000534197 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.21■■■■□ 3.55
GNPTG-209ENST00000534197 ARID3CA6NKF2 412 aa37.2■■■■□ 3.55
GNPTG-209ENST00000534197 CD109Q6YHK3 1445 aa37.19■■■■□ 3.54
GNPTG-209ENST00000534197 ATP10BO94823 1461 aa37.16■■■■□ 3.54
GNPTG-209ENST00000534197 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.15■■■■□ 3.54
GNPTG-209ENST00000534197 EEA1Q15075 1411 aa37.13■■■■□ 3.53
GNPTG-209ENST00000534197 ADGRL1O94910 1474 aa37.1■■■■□ 3.53
GNPTG-209ENST00000534197 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GNPTG-209ENST00000534197 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.07■■■■□ 3.52
GNPTG-209ENST00000534197 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
GNPTG-209ENST00000534197 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.98■■■■□ 3.51
GNPTG-209ENST00000534197 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.95■■■■□ 3.51
GNPTG-209ENST00000534197 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
GNPTG-209ENST00000534197 KIF21BO75037 1637 aa36.93■■■■□ 3.5
GNPTG-209ENST00000534197 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.87■■■■□ 3.49
GNPTG-209ENST00000534197 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
GNPTG-209ENST00000534197 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
GNPTG-209ENST00000534197 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.78■■■■□ 3.48
GNPTG-209ENST00000534197 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.75■■■■□ 3.47
GNPTG-209ENST00000534197 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.75■■■■□ 3.47
GNPTG-209ENST00000534197 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.7■■■■□ 3.47
GNPTG-209ENST00000534197 RAPGEF3O95398 923 aa36.7■■■■□ 3.47
GNPTG-209ENST00000534197 NEO1Q92859 1461 aa36.69■■■■□ 3.46
GNPTG-209ENST00000534197 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.66■■■■□ 3.46
GNPTG-209ENST00000534197 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.66■■■■□ 3.46
GNPTG-209ENST00000534197 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
GNPTG-209ENST00000534197 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.61■■■■□ 3.453e-7■■■□□ 17.8
GNPTG-209ENST00000534197 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
GNPTG-209ENST00000534197 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.6■■■■□ 3.45
GNPTG-209ENST00000534197 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.57■■■■□ 3.45
GNPTG-209ENST00000534197 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.55■■■■□ 3.44
GNPTG-209ENST00000534197 RICTORQ6R327 1708 aa36.51■■■■□ 3.43
GNPTG-209ENST00000534197 AKNAQ7Z591 1439 aa36.5■■■■□ 3.43
GNPTG-209ENST00000534197 FANCAO15360 1455 aa36.49■■■■□ 3.43
GNPTG-209ENST00000534197 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.48■■■■□ 3.43
GNPTG-209ENST00000534197 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 FMN1Q68DA7 1419 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 HECW1Q76N89 1606 aa36.42■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.4■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.39■■■■□ 3.42
GNPTG-209ENST00000534197 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.37■■■■□ 3.41
GNPTG-209ENST00000534197 PTPRMP28827 1452 aa36.36■■■■□ 3.41
GNPTG-209ENST00000534197 PLCH2O75038 1416 aa36.34■■■■□ 3.41
GNPTG-209ENST00000534197 MADDQ8WXG6 1647 aa36.33■■■■□ 3.41
GNPTG-209ENST00000534197 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 KIF14Q15058 1648 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.3■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.27■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.27■■■■□ 3.4
GNPTG-209ENST00000534197 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.24■■■■□ 3.39
GNPTG-209ENST00000534197 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
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