RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533998.5

FNTA-214, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 3

Gene FNTA, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-214ENST00000533998 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.21■■■■■ 4.51
FNTA-214ENST00000533998 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.12■■■■■ 4.49
FNTA-214ENST00000533998 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
FNTA-214ENST00000533998 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.96■■■■■ 4.47
FNTA-214ENST00000533998 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
FNTA-214ENST00000533998 IQGAP2Q13576 1575 aa42.8■■■■■ 4.44
FNTA-214ENST00000533998 PRXQ9BXM0 1461 aa42.72■■■■■ 4.43
FNTA-214ENST00000533998 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.67■■■■■ 4.42
FNTA-214ENST00000533998 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.61■■■■■ 4.41
FNTA-214ENST00000533998 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.57■■■■■ 4.41
FNTA-214ENST00000533998 EEA1Q15075 1411 aa42.57■■■■■ 4.41
FNTA-214ENST00000533998 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.56■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 PTPRGP23470 1445 aa42.56■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.56■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 DISP1Q96F81 1524 aa42.53■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.53■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.51■■■■■ 4.4
FNTA-214ENST00000533998 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
FNTA-214ENST00000533998 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
FNTA-214ENST00000533998 KIAA0556O60303 1618 aa42.39■■■■■ 4.38
FNTA-214ENST00000533998 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
FNTA-214ENST00000533998 MAPKBP1O60336 1514 aa42.32■■■■■ 4.37
FNTA-214ENST00000533998 GOLGA3Q08378 1498 aa42.3■■■■■ 4.36
FNTA-214ENST00000533998 UACAQ9BZF9 1416 aa42.27■■■■■ 4.36
FNTA-214ENST00000533998 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.26■■■■■ 4.36
FNTA-214ENST00000533998 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.25■■■■■ 4.35
FNTA-214ENST00000533998 ABCC2Q92887 1545 aa42.22■■■■■ 4.35
FNTA-214ENST00000533998 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.18■■■■■ 4.34
FNTA-214ENST00000533998 KIF21BO75037 1637 aa42.15■■■■■ 4.34
FNTA-214ENST00000533998 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.12■■■■■ 4.33
FNTA-214ENST00000533998 DIP2BQ9P265 1576 aa42.08■■■■■ 4.33
FNTA-214ENST00000533998 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.05■■■■■ 4.32
FNTA-214ENST00000533998 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.02■■■■■ 4.32
FNTA-214ENST00000533998 SAMD9Q5K651 1589 aa41.99■■■■■ 4.31
FNTA-214ENST00000533998 ASXL2Q76L83 1435 aa41.99■■■■■ 4.31
FNTA-214ENST00000533998 P3H3Q8IVL6 736 aa41.99■■■■■ 4.31
FNTA-214ENST00000533998 ABCA8O94911 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
FNTA-214ENST00000533998 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
FNTA-214ENST00000533998 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
FNTA-214ENST00000533998 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
FNTA-214ENST00000533998 GLI2P10070 1586 aa41.81■■■■■ 4.28
FNTA-214ENST00000533998 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.8■■■■■ 4.28
FNTA-214ENST00000533998 TSPOAP1O95153 1857 aa41.78■■■■■ 4.28
FNTA-214ENST00000533998 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
FNTA-214ENST00000533998 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.73■■■■■ 4.27
FNTA-214ENST00000533998 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.71■■■■■ 4.27
FNTA-214ENST00000533998 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.71■■■■■ 4.27
FNTA-214ENST00000533998 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.68■■■■■ 4.26
FNTA-214ENST00000533998 ATP10BO94823 1461 aa41.64■■■■■ 4.26
FNTA-214ENST00000533998 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.59■■■■■ 4.25
FNTA-214ENST00000533998 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
FNTA-214ENST00000533998 ARID3CA6NKF2 412 aa41.58■■■■■ 4.25
FNTA-214ENST00000533998 KCNH8Q96L42 1107 aa41.54■■■■■ 4.24
FNTA-214ENST00000533998 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
FNTA-214ENST00000533998 KDM6BO15054 1643 aa41.51■■■■■ 4.23
FNTA-214ENST00000533998 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.47■■■■■ 4.23
FNTA-214ENST00000533998 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
FNTA-214ENST00000533998 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
FNTA-214ENST00000533998 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.42■■■■■ 4.22
FNTA-214ENST00000533998 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.42■■■■■ 4.22
FNTA-214ENST00000533998 CD109Q6YHK3 1445 aa41.39■■■■■ 4.22
FNTA-214ENST00000533998 FMN1Q68DA7 1419 aa41.37■■■■■ 4.21
FNTA-214ENST00000533998 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.33■■■■■ 4.21
FNTA-214ENST00000533998 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.27■■■■■ 4.2
FNTA-214ENST00000533998 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.26■■■■■ 4.19
FNTA-214ENST00000533998 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
FNTA-214ENST00000533998 HECW1Q76N89 1606 aa41.19■■■■■ 4.18
FNTA-214ENST00000533998 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
FNTA-214ENST00000533998 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
FNTA-214ENST00000533998 CLIP1P30622 1438 aa41.1■■■■■ 4.17
FNTA-214ENST00000533998 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.03■■■■■ 4.16
FNTA-214ENST00000533998 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
FNTA-214ENST00000533998 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.155e-9■■■■■ 49.4
FNTA-214ENST00000533998 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.99■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.98■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 NEO1Q92859 1461 aa40.96■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
FNTA-214ENST00000533998 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.91■■■■■ 4.14
FNTA-214ENST00000533998 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.87■■■■■ 4.13
FNTA-214ENST00000533998 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
FNTA-214ENST00000533998 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
FNTA-214ENST00000533998 CEP162Q5TB80 1403 aa40.82■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 FANCAO15360 1455 aa40.8■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.78■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.78■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 PLCH2O75038 1416 aa40.77■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.77■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 KIF14Q15058 1648 aa40.77■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 AKNAQ7Z591 1439 aa40.76■■■■■ 4.12
FNTA-214ENST00000533998 RAPGEF3O95398 923 aa40.75■■■■■ 4.11
FNTA-214ENST00000533998 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.71■■■■■ 4.11
FNTA-214ENST00000533998 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.66■■■■■ 4.1
FNTA-214ENST00000533998 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
FNTA-214ENST00000533998 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.62■■■■■ 4.09
FNTA-214ENST00000533998 RICTORQ6R327 1708 aa40.61■■■■■ 4.09
FNTA-214ENST00000533998 ADGRL1O94910 1474 aa40.6■■■■■ 4.09
FNTA-214ENST00000533998 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.53■■■■■ 4.08
FNTA-214ENST00000533998 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.52■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms