RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 IGF1RP08069 1367 aa39.97■■■■□ 3.99
PKP3-210ENST00000533249 CUL7Q14999 1698 aa39.91■■■■□ 3.98
PKP3-210ENST00000533249 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.86■■■■□ 3.97
PKP3-210ENST00000533249 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.8■■■■□ 3.96
PKP3-210ENST00000533249 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.74■■■■□ 3.95
PKP3-210ENST00000533249 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.72■■■■□ 3.95
PKP3-210ENST00000533249 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.69■■■■□ 3.94
PKP3-210ENST00000533249 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
PKP3-210ENST00000533249 MAPKBP1O60336 1514 aa39.62■■■■□ 3.93
PKP3-210ENST00000533249 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.62■■■■□ 3.93
PKP3-210ENST00000533249 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.61■■■■□ 3.93
PKP3-210ENST00000533249 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
PKP3-210ENST00000533249 DIP2BQ9P265 1576 aa39.52■■■■□ 3.92
PKP3-210ENST00000533249 PTPRGP23470 1445 aa39.52■■■■□ 3.92
PKP3-210ENST00000533249 IQGAP2Q13576 1575 aa39.49■■■■□ 3.91
PKP3-210ENST00000533249 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.48■■■■□ 3.91
PKP3-210ENST00000533249 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.44■■■■□ 3.9
PKP3-210ENST00000533249 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.36■■■■□ 3.89
PKP3-210ENST00000533249 TSPOAP1O95153 1857 aa39.3■■■■□ 3.88
PKP3-210ENST00000533249 ABCC2Q92887 1545 aa39.3■■■■□ 3.88
PKP3-210ENST00000533249 DISP1Q96F81 1524 aa39.3■■■■□ 3.88
PKP3-210ENST00000533249 KDM6BO15054 1643 aa39.22■■■■□ 3.87
PKP3-210ENST00000533249 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.21■■■■□ 3.87
PKP3-210ENST00000533249 UACAQ9BZF9 1416 aa39.21■■■■□ 3.87
PKP3-210ENST00000533249 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.2■■■■□ 3.87
PKP3-210ENST00000533249 ASXL2Q76L83 1435 aa39.19■■■■□ 3.86
PKP3-210ENST00000533249 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.15■■■■□ 3.86
PKP3-210ENST00000533249 KIAA0556O60303 1618 aa39.13■■■■□ 3.85
PKP3-210ENST00000533249 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.06■■■■□ 3.84
PKP3-210ENST00000533249 GLI2P10070 1586 aa39.04■■■■□ 3.84
PKP3-210ENST00000533249 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.04■■■■□ 3.84
PKP3-210ENST00000533249 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
PKP3-210ENST00000533249 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
PKP3-210ENST00000533249 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
PKP3-210ENST00000533249 PRXQ9BXM0 1461 aa38.92■■■■□ 3.82
PKP3-210ENST00000533249 GOLGA3Q08378 1498 aa38.9■■■■□ 3.82
PKP3-210ENST00000533249 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.85■■■■□ 3.81
PKP3-210ENST00000533249 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.83■■■■□ 3.81
PKP3-210ENST00000533249 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.79■■■■□ 3.8
PKP3-210ENST00000533249 ABCA8O94911 1581 aa38.77■■■■□ 3.8
PKP3-210ENST00000533249 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.75■■■■□ 3.79
PKP3-210ENST00000533249 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
PKP3-210ENST00000533249 P3H3Q8IVL6 736 aa38.64■■■■□ 3.78
PKP3-210ENST00000533249 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.64■■■■□ 3.78
PKP3-210ENST00000533249 KCNH8Q96L42 1107 aa38.64■■■■□ 3.78
PKP3-210ENST00000533249 CD109Q6YHK3 1445 aa38.57■■■■□ 3.77
PKP3-210ENST00000533249 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
PKP3-210ENST00000533249 ARID3CA6NKF2 412 aa38.56■■■■□ 3.76
PKP3-210ENST00000533249 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.55■■■■□ 3.76
PKP3-210ENST00000533249 ADGRL1O94910 1474 aa38.53■■■■□ 3.76
PKP3-210ENST00000533249 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.51■■■■□ 3.76
PKP3-210ENST00000533249 SAMD9Q5K651 1589 aa38.47■■■■□ 3.75
PKP3-210ENST00000533249 ATP10BO94823 1461 aa38.45■■■■□ 3.75
PKP3-210ENST00000533249 EEA1Q15075 1411 aa38.43■■■■□ 3.74
PKP3-210ENST00000533249 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
PKP3-210ENST00000533249 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.36■■■■□ 3.73
PKP3-210ENST00000533249 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
PKP3-210ENST00000533249 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
PKP3-210ENST00000533249 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.26■■■■□ 3.72
PKP3-210ENST00000533249 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.26■■■■□ 3.71
PKP3-210ENST00000533249 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.21■■■■□ 3.71
PKP3-210ENST00000533249 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
PKP3-210ENST00000533249 KIF21BO75037 1637 aa38.16■■■■□ 3.7
PKP3-210ENST00000533249 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.1■■■■□ 3.69
PKP3-210ENST00000533249 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.07■■■■□ 3.69
PKP3-210ENST00000533249 NEO1Q92859 1461 aa38.05■■■■□ 3.68
PKP3-210ENST00000533249 RAPGEF3O95398 923 aa38.04■■■■□ 3.68
PKP3-210ENST00000533249 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.03■■■■□ 3.68
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.02■■■■□ 3.68
PKP3-210ENST00000533249 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.02■■■■□ 3.68
PKP3-210ENST00000533249 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
PKP3-210ENST00000533249 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.92■■■■□ 3.66
PKP3-210ENST00000533249 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.89■■■■□ 3.66
PKP3-210ENST00000533249 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
PKP3-210ENST00000533249 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.653e-8■□□□□ 9.7
PKP3-210ENST00000533249 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.84■■■■□ 3.65
PKP3-210ENST00000533249 FANCAO15360 1455 aa37.83■■■■□ 3.65
PKP3-210ENST00000533249 AKNAQ7Z591 1439 aa37.82■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.8■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.79■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 RICTORQ6R327 1708 aa37.77■■■■□ 3.64
PKP3-210ENST00000533249 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.76■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 FMN1Q68DA7 1419 aa37.75■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 PTPRMP28827 1452 aa37.73■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.73■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.72■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 HECW1Q76N89 1606 aa37.72■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PKP3-210ENST00000533249 MADDQ8WXG6 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
PKP3-210ENST00000533249 PLCH2O75038 1416 aa37.62■■■■□ 3.61
PKP3-210ENST00000533249 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.61■■■■□ 3.61
PKP3-210ENST00000533249 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
PKP3-210ENST00000533249 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.58■■■■□ 3.61
PKP3-210ENST00000533249 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.57■■■■□ 3.6
PKP3-210ENST00000533249 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.57■■■■□ 3.6
PKP3-210ENST00000533249 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.54■■■■□ 3.6
PKP3-210ENST00000533249 KIF14Q15058 1648 aa37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms