RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533166.5

BANF1-208, Transcript of barrier to autointegration factor 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene BANF1, Length 1,135 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BANF1-208	ENST00000533166	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.92	■■■■■ 4.46
BANF1-208	ENST00000533166	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
BANF1-208	ENST00000533166	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.82	■■■■■ 4.45
BANF1-208	ENST00000533166	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
BANF1-208	ENST00000533166	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.64	■■■■■ 4.42
BANF1-208	ENST00000533166	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.53	■■■■■ 4.4
BANF1-208	ENST00000533166	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.38	■■■■■ 4.38
BANF1-208	ENST00000533166	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.37	■■■■■ 4.37
BANF1-208	ENST00000533166	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
BANF1-208	ENST00000533166	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.33	■■■■■ 4.37
BANF1-208	ENST00000533166	PTPRG	P23470	1445 aa		42.31	■■■■■ 4.36
BANF1-208	ENST00000533166	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.3	■■■■■ 4.36
BANF1-208	ENST00000533166	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.28	■■■■■ 4.36
BANF1-208	ENST00000533166	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.28	■■■■■ 4.36
BANF1-208	ENST00000533166	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.25	■■■■■ 4.35
BANF1-208	ENST00000533166	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.23	■■■■■ 4.35
BANF1-208	ENST00000533166	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.2	■■■■■ 4.35
BANF1-208	ENST00000533166	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.16	■■■■■ 4.34
BANF1-208	ENST00000533166	EEA1	Q15075	1411 aa		42.13	■■■■■ 4.34
BANF1-208	ENST00000533166	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.1	■■■■■ 4.33
BANF1-208	ENST00000533166	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
BANF1-208	ENST00000533166	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.1	■■■■■ 4.33
BANF1-208	ENST00000533166	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.06	■■■■■ 4.32
BANF1-208	ENST00000533166	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.01	■■■■■ 4.32
BANF1-208	ENST00000533166	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.99	■■■■■ 4.31
BANF1-208	ENST00000533166	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.98	■■■■■ 4.31
BANF1-208	ENST00000533166	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.98	■■■■■ 4.31
BANF1-208	ENST00000533166	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.98	■■■■■ 4.31
BANF1-208	ENST00000533166	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.94	■■■■■ 4.3
BANF1-208	ENST00000533166	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.93	■■■■■ 4.3
BANF1-208	ENST00000533166	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.82	■■■■■ 4.29
BANF1-208	ENST00000533166	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.8	■■■■■ 4.28
BANF1-208	ENST00000533166	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.79	■■■■■ 4.28
BANF1-208	ENST00000533166	KIF21B	O75037	1637 aa		41.78	■■■■■ 4.28
BANF1-208	ENST00000533166	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.78	■■■■■ 4.28
BANF1-208	ENST00000533166	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
BANF1-208	ENST00000533166	ABCA8	O94911	1581 aa		41.71	■■■■■ 4.27
BANF1-208	ENST00000533166	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.71	■■■■■ 4.27
BANF1-208	ENST00000533166	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
BANF1-208	ENST00000533166	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.66	■■■■■ 4.26
BANF1-208	ENST00000533166	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.61	■■■■■ 4.25
BANF1-208	ENST00000533166	GLI2	P10070	1586 aa		41.55	■■■■■ 4.24
BANF1-208	ENST00000533166	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.54	■■■■■ 4.24
BANF1-208	ENST00000533166	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.5	■■■■■ 4.23
BANF1-208	ENST00000533166	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.49	■■■■■ 4.23
BANF1-208	ENST00000533166	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.48	■■■■■ 4.23
BANF1-208	ENST00000533166	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
BANF1-208	ENST00000533166	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.42	■■■■■ 4.22
BANF1-208	ENST00000533166	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.4	■■■■■ 4.22
BANF1-208	ENST00000533166	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.4	■■■■■ 4.22
BANF1-208	ENST00000533166	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.38	■■■■■ 4.21
BANF1-208	ENST00000533166	ATP10B	O94823	1461 aa		41.38	■■■■■ 4.21
BANF1-208	ENST00000533166	KDM6B	O15054	1643 aa		41.37	■■■■■ 4.21
BANF1-208	ENST00000533166	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.33	■■■■■ 4.21
BANF1-208	ENST00000533166	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
BANF1-208	ENST00000533166	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.19	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.18	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.18	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.16	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.16	■■■■■ 4.18
BANF1-208	ENST00000533166	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.11	■■■■■ 4.17
BANF1-208	ENST00000533166	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.08	■■■■■ 4.17
BANF1-208	ENST00000533166	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.01	■■■■■ 4.16
BANF1-208	ENST00000533166	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41	■■■■■ 4.15
BANF1-208	ENST00000533166	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
BANF1-208	ENST00000533166	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.94	■■■■■ 4.14
BANF1-208	ENST00000533166	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
BANF1-208	ENST00000533166	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
BANF1-208	ENST00000533166	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.9	■■■■■ 4.14
BANF1-208	ENST00000533166	CLIP1	P30622	1438 aa		40.77	■■■■■ 4.12
BANF1-208	ENST00000533166	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.77	■■■■■ 4.12	2e-7	■■■□□ 16.2
BANF1-208	ENST00000533166	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.73	■■■■■ 4.11
BANF1-208	ENST00000533166	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
BANF1-208	ENST00000533166	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.73	■■■■■ 4.11
BANF1-208	ENST00000533166	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.71	■■■■■ 4.11
BANF1-208	ENST00000533166	NEO1	Q92859	1461 aa		40.7	■■■■■ 4.11
BANF1-208	ENST00000533166	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.68	■■■■■ 4.1
BANF1-208	ENST00000533166	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.67	■■■■■ 4.1
BANF1-208	ENST00000533166	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.67	■■■■■ 4.1
BANF1-208	ENST00000533166	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
BANF1-208	ENST00000533166	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.58	■■■■■ 4.09
BANF1-208	ENST00000533166	FANCA	O15360	1455 aa		40.58	■■■■■ 4.09
BANF1-208	ENST00000533166	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	KIF14	Q15058	1648 aa		40.56	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.54	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.53	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.53	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.52	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.51	■■■■■ 4.08
BANF1-208	ENST00000533166	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.5	■■■■■ 4.07
BANF1-208	ENST00000533166	PLCH2	O75038	1416 aa		40.49	■■■■■ 4.07
BANF1-208	ENST00000533166	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.49	■■■■■ 4.07
BANF1-208	ENST00000533166	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.44	■■■■■ 4.06
BANF1-208	ENST00000533166	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
BANF1-208	ENST00000533166	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.42	■■■■■ 4.06
BANF1-208	ENST00000533166	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.38	■■■■■ 4.05
BANF1-208	ENST00000533166	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.32	■■■■■ 4.05
BANF1-208	ENST00000533166	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.31	■■■■■ 4.04
BANF1-208	ENST00000533166	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.3	■■■■■ 4.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms