RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.88■■■■□ 3.49
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPRK-222ENST00000532751 JPH4Q96JJ6 628 aa36.81■■■■□ 3.48
PTPRK-222ENST00000532751 EEA1Q15075 1411 aa36.77■■■■□ 3.48
PTPRK-222ENST00000532751 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.77■■■■□ 3.48
PTPRK-222ENST00000532751 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
PTPRK-222ENST00000532751 PRXQ9BXM0 1461 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPRK-222ENST00000532751 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.69■■■■□ 3.46
PTPRK-222ENST00000532751 IQGAP2Q13576 1575 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRK-222ENST00000532751 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.6■■■■□ 3.45
PTPRK-222ENST00000532751 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
PTPRK-222ENST00000532751 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.49■■■■□ 3.43
PTPRK-222ENST00000532751 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.44■■■■□ 3.42
PTPRK-222ENST00000532751 KIF21BO75037 1637 aa36.39■■■■□ 3.42
PTPRK-222ENST00000532751 DISP1Q96F81 1524 aa36.35■■■■□ 3.41
PTPRK-222ENST00000532751 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.34■■■■□ 3.41
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0556O60303 1618 aa36.31■■■■□ 3.4
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRGP23470 1445 aa36.31■■■■□ 3.4
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA3Q08378 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRK-222ENST00000532751 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PTPRK-222ENST00000532751 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRK-222ENST00000532751 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PTPRK-222ENST00000532751 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
PTPRK-222ENST00000532751 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
PTPRK-222ENST00000532751 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRK-222ENST00000532751 UACAQ9BZF9 1416 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRK-222ENST00000532751 SAMD9Q5K651 1589 aa36.06■■■■□ 3.36
PTPRK-222ENST00000532751 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC2Q92887 1545 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRK-222ENST00000532751 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
PTPRK-222ENST00000532751 MAPKBP1O60336 1514 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRK-222ENST00000532751 P3H3Q8IVL6 736 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRK-222ENST00000532751 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRK-222ENST00000532751 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA8O94911 1581 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRK-222ENST00000532751 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRK-222ENST00000532751 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRK-222ENST00000532751 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
PTPRK-222ENST00000532751 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRK-222ENST00000532751 DIP2BQ9P265 1576 aa35.76■■■■□ 3.31
PTPRK-222ENST00000532751 ASXL2Q76L83 1435 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRK-222ENST00000532751 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRK-222ENST00000532751 FMN1Q68DA7 1419 aa35.58■■■■□ 3.29
PTPRK-222ENST00000532751 ATP10BO94823 1461 aa35.58■■■■□ 3.29
PTPRK-222ENST00000532751 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.58■■■■□ 3.29
PTPRK-222ENST00000532751 GLI2P10070 1586 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPRK-222ENST00000532751 ARID3CA6NKF2 412 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPRK-222ENST00000532751 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PTPRK-222ENST00000532751 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PTPRK-222ENST00000532751 TSPOAP1O95153 1857 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PTPRK-222ENST00000532751 CLIP1P30622 1438 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPRK-222ENST00000532751 HECW1Q76N89 1606 aa35.44■■■■□ 3.26
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH8Q96L42 1107 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRK-222ENST00000532751 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPRK-222ENST00000532751 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRK-222ENST00000532751 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PTPRK-222ENST00000532751 CEP162Q5TB80 1403 aa35.32■■■■□ 3.25
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.32■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 CD109Q6YHK3 1445 aa35.26■■■■□ 3.24
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 KDM6BO15054 1643 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.21■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.2■■■■□ 3.23
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRK-222ENST00000532751 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
PTPRK-222ENST00000532751 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
PTPRK-222ENST00000532751 KIF14Q15058 1648 aa35.02■■■■□ 3.2
PTPRK-222ENST00000532751 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.01■■■■□ 3.2
PTPRK-222ENST00000532751 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.96■■■■□ 3.19
PTPRK-222ENST00000532751 NEO1Q92859 1461 aa34.95■■■■□ 3.19
PTPRK-222ENST00000532751 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
PTPRK-222ENST00000532751 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.92■■■■□ 3.18
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.91■■■■□ 3.18
PTPRK-222ENST00000532751 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.91■■■■□ 3.18
PTPRK-222ENST00000532751 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.89■■■■□ 3.18
PTPRK-222ENST00000532751 FANCAO15360 1455 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRK-222ENST00000532751 PLCH2O75038 1416 aa34.85■■■■□ 3.17
PTPRK-222ENST00000532751 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.81■■■■□ 3.16
PTPRK-222ENST00000532751 AKNAQ7Z591 1439 aa34.8■■■■□ 3.16
PTPRK-222ENST00000532751 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.75■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.74■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.74■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.72■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 TIAM1Q13009 1591 aa34.72■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 PREX2Q70Z35 1606 aa34.72■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPRK-222ENST00000532751 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
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