RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.89■■■■□ 3.82
ME3-210ENST00000532471 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.89■■■■□ 3.82
ME3-210ENST00000532471 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.86■■■■□ 3.81
ME3-210ENST00000532471 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
ME3-210ENST00000532471 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
ME3-210ENST00000532471 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.6■■■■□ 3.77
ME3-210ENST00000532471 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.57■■■■□ 3.77
ME3-210ENST00000532471 IQGAP2Q13576 1575 aa38.57■■■■□ 3.76
ME3-210ENST00000532471 PRXQ9BXM0 1461 aa38.53■■■■□ 3.76
ME3-210ENST00000532471 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.52■■■■□ 3.76
ME3-210ENST00000532471 EEA1Q15075 1411 aa38.51■■■■□ 3.76
ME3-210ENST00000532471 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.49■■■■□ 3.75
ME3-210ENST00000532471 PTPRGP23470 1445 aa38.46■■■■□ 3.75
ME3-210ENST00000532471 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
ME3-210ENST00000532471 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.43■■■■□ 3.74
ME3-210ENST00000532471 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
ME3-210ENST00000532471 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.35■■■■□ 3.73
ME3-210ENST00000532471 DISP1Q96F81 1524 aa38.31■■■■□ 3.72
ME3-210ENST00000532471 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.29■■■■□ 3.72
ME3-210ENST00000532471 GOLGA3Q08378 1498 aa38.22■■■■□ 3.71
ME3-210ENST00000532471 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.2■■■■□ 3.71
ME3-210ENST00000532471 KIAA0556O60303 1618 aa38.16■■■■□ 3.7
ME3-210ENST00000532471 UACAQ9BZF9 1416 aa38.14■■■■□ 3.7
ME3-210ENST00000532471 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.08■■■■□ 3.69
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ME3-210ENST00000532471 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.05■■■■□ 3.68
ME3-210ENST00000532471 ABCC2Q92887 1545 aa38.05■■■■□ 3.68
ME3-210ENST00000532471 P3H3Q8IVL6 736 aa38.01■■■■□ 3.68
ME3-210ENST00000532471 KIF21BO75037 1637 aa38■■■■□ 3.67
ME3-210ENST00000532471 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.98■■■■□ 3.67
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ME3-210ENST00000532471 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.93■■■■□ 3.66
ME3-210ENST00000532471 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.88■■■■□ 3.65
ME3-210ENST00000532471 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.87■■■■□ 3.65
ME3-210ENST00000532471 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.87■■■■□ 3.65
ME3-210ENST00000532471 ASXL2Q76L83 1435 aa37.86■■■■□ 3.65
ME3-210ENST00000532471 DIP2BQ9P265 1576 aa37.81■■■■□ 3.64
ME3-210ENST00000532471 SAMD9Q5K651 1589 aa37.79■■■■□ 3.64
ME3-210ENST00000532471 ABCA8O94911 1581 aa37.78■■■■□ 3.64
ME3-210ENST00000532471 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
ME3-210ENST00000532471 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.66■■■■□ 3.62
ME3-210ENST00000532471 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.65■■■■□ 3.62
ME3-210ENST00000532471 ARID3CA6NKF2 412 aa37.63■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 GLI2P10070 1586 aa37.62■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.6■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 KCNH8Q96L42 1107 aa37.59■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
ME3-210ENST00000532471 ATP10BO94823 1461 aa37.55■■■■□ 3.6
ME3-210ENST00000532471 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.54■■■■□ 3.6
ME3-210ENST00000532471 TSPOAP1O95153 1857 aa37.54■■■■□ 3.6
ME3-210ENST00000532471 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
ME3-210ENST00000532471 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.41■■■■□ 3.58
ME3-210ENST00000532471 FMN1Q68DA7 1419 aa37.41■■■■□ 3.58
ME3-210ENST00000532471 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.39■■■■□ 3.58
ME3-210ENST00000532471 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
ME3-210ENST00000532471 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.38■■■■□ 3.57
ME3-210ENST00000532471 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.38■■■■□ 3.57
ME3-210ENST00000532471 CD109Q6YHK3 1445 aa37.36■■■■□ 3.57
ME3-210ENST00000532471 KDM6BO15054 1643 aa37.35■■■■□ 3.57
ME3-210ENST00000532471 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
ME3-210ENST00000532471 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.26■■■■□ 3.56
ME3-210ENST00000532471 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.24■■■■□ 3.55
ME3-210ENST00000532471 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
ME3-210ENST00000532471 CLIP1P30622 1438 aa37.18■■■■□ 3.54
ME3-210ENST00000532471 HECW1Q76N89 1606 aa37.14■■■■□ 3.54
ME3-210ENST00000532471 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.11■■■■□ 3.53
ME3-210ENST00000532471 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
ME3-210ENST00000532471 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
ME3-210ENST00000532471 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.06■■■■□ 3.52
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ME3-210ENST00000532471 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.03■■■■□ 3.52
ME3-210ENST00000532471 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.98■■■■□ 3.51
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ME3-210ENST00000532471 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.93■■■■□ 3.5
ME3-210ENST00000532471 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.93■■■■□ 3.5
ME3-210ENST00000532471 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.5
ME3-210ENST00000532471 CEP162Q5TB80 1403 aa36.91■■■■□ 3.5
ME3-210ENST00000532471 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.9■■■■□ 3.5
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ME3-210ENST00000532471 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.81■■■■□ 3.48
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ME3-210ENST00000532471 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.79■■■■□ 3.48
ME3-210ENST00000532471 AKNAQ7Z591 1439 aa36.79■■■■□ 3.48
ME3-210ENST00000532471 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.78■■■■□ 3.48
ME3-210ENST00000532471 KIF14Q15058 1648 aa36.77■■■■□ 3.48
ME3-210ENST00000532471 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.75■■■■□ 3.47
ME3-210ENST00000532471 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ME3-210ENST00000532471 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.7■■■■□ 3.47
ME3-210ENST00000532471 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.64■■■■□ 3.46
ME3-210ENST00000532471 ADGRL1O94910 1474 aa36.61■■■■□ 3.45
ME3-210ENST00000532471 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.6■■■■□ 3.45
ME3-210ENST00000532471 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.6■■■■□ 3.45
ME3-210ENST00000532471 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.59■■■■□ 3.45
ME3-210ENST00000532471 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.52■■■■□ 3.44
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