RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 ARAP1Q96P48 1450 aa31.22■■■□□ 2.59
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.2■■■□□ 2.59
TSTA3-214ENST00000531473 ADAMTS12P58397 1594 aa31.19■■■□□ 2.58
TSTA3-214ENST00000531473 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.18■■■□□ 2.58
TSTA3-214ENST00000531473 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.15■■■□□ 2.58
TSTA3-214ENST00000531473 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.14■■■□□ 2.58
TSTA3-214ENST00000531473 P3H3Q8IVL6 736 aa31.14■■■□□ 2.58
TSTA3-214ENST00000531473 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.11■■■□□ 2.57
TSTA3-214ENST00000531473 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
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TSTA3-214ENST00000531473 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.97■■■□□ 2.55
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TSTA3-214ENST00000531473 SYNJ2O15056 1496 aa30.88■■■□□ 2.53
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TSTA3-214ENST00000531473 CEP170Q5SW79 1584 aa30.82■■■□□ 2.52
TSTA3-214ENST00000531473 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.81■■■□□ 2.52
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TSTA3-214ENST00000531473 APLP2Q06481 763 aa30.79■■■□□ 2.52
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TSTA3-214ENST00000531473 NUP160Q12769 1436 aa30.67■■■□□ 2.5
TSTA3-214ENST00000531473 CHD1O14646 1710 aa30.66■■■□□ 2.5
TSTA3-214ENST00000531473 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.64■■■□□ 2.5
TSTA3-214ENST00000531473 DISP1Q96F81 1524 aa30.62■■■□□ 2.49
TSTA3-214ENST00000531473 FMN1Q68DA7 1419 aa30.58■■■□□ 2.49
TSTA3-214ENST00000531473 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.57■■■□□ 2.48
TSTA3-214ENST00000531473 TIAM1Q13009 1591 aa30.57■■■□□ 2.48
TSTA3-214ENST00000531473 JPH4Q96JJ6 628 aa30.55■■■□□ 2.48
TSTA3-214ENST00000531473 KIAA0556O60303 1618 aa30.54■■■□□ 2.48
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TSTA3-214ENST00000531473 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.53■■■□□ 2.48
TSTA3-214ENST00000531473 ARID3CA6NKF2 412 aa30.5■■■□□ 2.47
TSTA3-214ENST00000531473 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.45■■■□□ 2.47
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TSTA3-214ENST00000531473 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
TSTA3-214ENST00000531473 MAP3K1Q13233 1512 aa30.41■■■□□ 2.46
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TSTA3-214ENST00000531473 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.31■■■□□ 2.44
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TSTA3-214ENST00000531473 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-214ENST00000531473 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-214ENST00000531473 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.28■■■□□ 2.44
TSTA3-214ENST00000531473 HECW1Q76N89 1606 aa30.27■■■□□ 2.44
TSTA3-214ENST00000531473 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
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TSTA3-214ENST00000531473 SHROOM2Q13796 1616 aa30.22■■■□□ 2.43
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TSTA3-214ENST00000531473 ITGAEP38570 1179 aa30.13■■■□□ 2.41
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRGP23470 1445 aa30.11■■■□□ 2.41
TSTA3-214ENST00000531473 NCOA2Q15596 1464 aa30.09■■■□□ 2.41
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TSTA3-214ENST00000531473 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.07■■■□□ 2.4
TSTA3-214ENST00000531473 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.05■■■□□ 2.4
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TSTA3-214ENST00000531473 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-214ENST00000531473 ATP10BO94823 1461 aa29.97■■■□□ 2.39
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGEF11O15085 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
TSTA3-214ENST00000531473 OSCARQ8IYS5 282 aa29.96■■■□□ 2.39
TSTA3-214ENST00000531473 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.96■■■□□ 2.39
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TSTA3-214ENST00000531473 UACAQ9BZF9 1416 aa29.91■■■□□ 2.38
TSTA3-214ENST00000531473 KIF14Q15058 1648 aa29.87■■■□□ 2.37
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TSTA3-214ENST00000531473 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
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TSTA3-214ENST00000531473 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-214ENST00000531473 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRKQ15262 1439 aa29.78■■■□□ 2.36
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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TSTA3-214ENST00000531473 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.66■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 MIA2Q96PC5 1412 aa29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.63■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 KCNH8Q96L42 1107 aa29.62■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.6■■■□□ 2.33
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