RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530721.5

RPS3-216, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-216ENST00000530721 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
RPS3-216ENST00000530721 CUL7Q14999 1698 aa22.23■■□□□ 1.15
RPS3-216ENST00000530721 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS3-216ENST00000530721 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS3-216ENST00000530721 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.113e-45■□□□□ 8.2
RPS3-216ENST00000530721 IQGAP2Q13576 1575 aa21.97■■□□□ 1.11
RPS3-216ENST00000530721 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.97■■□□□ 1.11
RPS3-216ENST00000530721 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS3-216ENST00000530721 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.95■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 MAPKBP1O60336 1514 aa21.94■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.94■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 PTPRGP23470 1445 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.9■■□□□ 1.1
RPS3-216ENST00000530721 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS3-216ENST00000530721 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS3-216ENST00000530721 DISP1Q96F81 1524 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS3-216ENST00000530721 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS3-216ENST00000530721 DIP2BQ9P265 1576 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS3-216ENST00000530721 ABCC2Q92887 1545 aa21.8■■□□□ 1.08
RPS3-216ENST00000530721 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS3-216ENST00000530721 UACAQ9BZF9 1416 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS3-216ENST00000530721 PRXQ9BXM0 1461 aa21.77■■□□□ 1.07
RPS3-216ENST00000530721 KIAA0556O60303 1618 aa21.77■■□□□ 1.07
RPS3-216ENST00000530721 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS3-216ENST00000530721 ASXL2Q76L83 1435 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS3-216ENST00000530721 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS3-216ENST00000530721 GOLGA3Q08378 1498 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS3-216ENST00000530721 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS3-216ENST00000530721 TSPOAP1O95153 1857 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS3-216ENST00000530721 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RPS3-216ENST00000530721 GLI2P10070 1586 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS3-216ENST00000530721 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS3-216ENST00000530721 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RPS3-216ENST00000530721 KDM6BO15054 1643 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS3-216ENST00000530721 EEA1Q15075 1411 aa21.59■■□□□ 1.05
RPS3-216ENST00000530721 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
RPS3-216ENST00000530721 ABCA8O94911 1581 aa21.56■■□□□ 1.04
RPS3-216ENST00000530721 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS3-216ENST00000530721 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS3-216ENST00000530721 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS3-216ENST00000530721 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RPS3-216ENST00000530721 P3H3Q8IVL6 736 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS3-216ENST00000530721 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS3-216ENST00000530721 SAMD9Q5K651 1589 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS3-216ENST00000530721 KCNH8Q96L42 1107 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS3-216ENST00000530721 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 KIF21BO75037 1637 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 ATP10BO94823 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 CD109Q6YHK3 1445 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 ARID3CA6NKF2 412 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS3-216ENST00000530721 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.32■■□□□ 1
RPS3-216ENST00000530721 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.32■■□□□ 1
RPS3-216ENST00000530721 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.29■■□□□ 1
RPS3-216ENST00000530721 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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RPS3-216ENST00000530721 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
RPS3-216ENST00000530721 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.24■□□□□ 0.99
RPS3-216ENST00000530721 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RPS3-216ENST00000530721 ADGRL1O94910 1474 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS3-216ENST00000530721 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS3-216ENST00000530721 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS3-216ENST00000530721 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS3-216ENST00000530721 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS3-216ENST00000530721 NEO1Q92859 1461 aa21.13■□□□□ 0.97
RPS3-216ENST00000530721 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.11■□□□□ 0.97
RPS3-216ENST00000530721 FMN1Q68DA7 1419 aa21.11■□□□□ 0.97
RPS3-216ENST00000530721 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
RPS3-216ENST00000530721 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.964e-23■□□□□ 10.1
RPS3-216ENST00000530721 HECW1Q76N89 1606 aa21.05■□□□□ 0.96
RPS3-216ENST00000530721 RAPGEF3O95398 923 aa21.05■□□□□ 0.96
RPS3-216ENST00000530721 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
RPS3-216ENST00000530721 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.02■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 FANCAO15360 1455 aa21.01■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 AKNAQ7Z591 1439 aa20.99■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
RPS3-216ENST00000530721 PLCH2O75038 1416 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS3-216ENST00000530721 RICTORQ6R327 1708 aa20.93■□□□□ 0.94
RPS3-216ENST00000530721 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
RPS3-216ENST00000530721 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS3-216ENST00000530721 CLIP1P30622 1438 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS3-216ENST00000530721 KIF14Q15058 1648 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.86■□□□□ 0.93
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