RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.07■□□□□ 0.96
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TSTA3-212ENST00000530474 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.96■□□□□ 0.95
TSTA3-212ENST00000530474 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.96■□□□□ 0.95
TSTA3-212ENST00000530474 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.96■□□□□ 0.95
TSTA3-212ENST00000530474 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.95
TSTA3-212ENST00000530474 ARHGEF11O15085 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
TSTA3-212ENST00000530474 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.89■□□□□ 0.93
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TSTA3-212ENST00000530474 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.87■□□□□ 0.93
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TSTA3-212ENST00000530474 CEP170Q5SW79 1584 aa20.84■□□□□ 0.93
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TSTA3-212ENST00000530474 P3H3Q8IVL6 736 aa20.66■□□□□ 0.9
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TSTA3-212ENST00000530474 KIAA0556O60303 1618 aa20.61■□□□□ 0.89
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TSTA3-212ENST00000530474 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.55■□□□□ 0.88
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TSTA3-212ENST00000530474 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.43■□□□□ 0.86
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TSTA3-212ENST00000530474 MAP3K1Q13233 1512 aa20.42■□□□□ 0.86
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TSTA3-212ENST00000530474 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.38■□□□□ 0.85
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TSTA3-212ENST00000530474 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-212ENST00000530474 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.17■□□□□ 0.82
TSTA3-212ENST00000530474 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TSTA3-212ENST00000530474 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TSTA3-212ENST00000530474 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSTA3-212ENST00000530474 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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TSTA3-212ENST00000530474 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.11■□□□□ 0.81
TSTA3-212ENST00000530474 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSTA3-212ENST00000530474 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSTA3-212ENST00000530474 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-212ENST00000530474 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 KCNH8Q96L42 1107 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 ASXL2Q76L83 1435 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 KIF14Q15058 1648 aa20.05■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 NCOA2Q15596 1464 aa20.04■□□□□ 0.8
TSTA3-212ENST00000530474 DIP2BQ9P265 1576 aa20.01■□□□□ 0.79
TSTA3-212ENST00000530474 FAM69CQ0P6D2 419 aa20■□□□□ 0.79
TSTA3-212ENST00000530474 MIA2Q96PC5 1412 aa20■□□□□ 0.79
TSTA3-212ENST00000530474 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.99■□□□□ 0.79
TSTA3-212ENST00000530474 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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TSTA3-212ENST00000530474 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.95■□□□□ 0.78
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TSTA3-212ENST00000530474 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.93■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.92■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.91■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 PLCH2O75038 1416 aa19.9■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
TSTA3-212ENST00000530474 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TSTA3-212ENST00000530474 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.89■□□□□ 0.77
TSTA3-212ENST00000530474 GLI2P10070 1586 aa19.88■□□□□ 0.77
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