RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.69■■■■■ 4.43
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SERGEF-212ENST00000529728 JPH4Q96JJ6 628 aa42.6■■■■■ 4.41
SERGEF-212ENST00000529728 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
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SERGEF-212ENST00000529728 IQGAP2Q13576 1575 aa42.45■■■■■ 4.39
SERGEF-212ENST00000529728 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.43■■■■■ 4.38
SERGEF-212ENST00000529728 EEA1Q15075 1411 aa42.4■■■■■ 4.38
SERGEF-212ENST00000529728 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.35■■■■■ 4.37
SERGEF-212ENST00000529728 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.29■■■■■ 4.36
SERGEF-212ENST00000529728 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
SERGEF-212ENST00000529728 DISP1Q96F81 1524 aa42.18■■■■■ 4.34
SERGEF-212ENST00000529728 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.16■■■■■ 4.34
SERGEF-212ENST00000529728 KIAA0556O60303 1618 aa42.07■■■■■ 4.33
SERGEF-212ENST00000529728 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.06■■■■■ 4.32
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SERGEF-212ENST00000529728 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.05■■■■■ 4.32
SERGEF-212ENST00000529728 PTPRGP23470 1445 aa42.01■■■■■ 4.32
SERGEF-212ENST00000529728 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
SERGEF-212ENST00000529728 GOLGA3Q08378 1498 aa41.91■■■■■ 4.3
SERGEF-212ENST00000529728 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
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SERGEF-212ENST00000529728 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.82■■■■■ 4.29
SERGEF-212ENST00000529728 SAMD9Q5K651 1589 aa41.8■■■■■ 4.28
SERGEF-212ENST00000529728 UACAQ9BZF9 1416 aa41.77■■■■■ 4.28
SERGEF-212ENST00000529728 ABCC2Q92887 1545 aa41.76■■■■■ 4.28
SERGEF-212ENST00000529728 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.74■■■■■ 4.27
SERGEF-212ENST00000529728 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
SERGEF-212ENST00000529728 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
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SERGEF-212ENST00000529728 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.63■■■■■ 4.26
SERGEF-212ENST00000529728 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.6■■■■■ 4.25
SERGEF-212ENST00000529728 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
SERGEF-212ENST00000529728 DIP2BQ9P265 1576 aa41.58■■■■■ 4.25
SERGEF-212ENST00000529728 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
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SERGEF-212ENST00000529728 P3H3Q8IVL6 736 aa41.46■■■■■ 4.23
SERGEF-212ENST00000529728 ASXL2Q76L83 1435 aa41.45■■■■■ 4.23
SERGEF-212ENST00000529728 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
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SERGEF-212ENST00000529728 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.37■■■■■ 4.21
SERGEF-212ENST00000529728 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.36■■■■■ 4.21
SERGEF-212ENST00000529728 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.36■■■■■ 4.21
SERGEF-212ENST00000529728 GLI2P10070 1586 aa41.34■■■■■ 4.21
SERGEF-212ENST00000529728 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.27■■■■■ 4.2
SERGEF-212ENST00000529728 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
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SERGEF-212ENST00000529728 ATP10BO94823 1461 aa41.22■■■■■ 4.19
SERGEF-212ENST00000529728 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SERGEF-212ENST00000529728 TSPOAP1O95153 1857 aa41.19■■■■■ 4.18
SERGEF-212ENST00000529728 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.16■■■■■ 4.18
SERGEF-212ENST00000529728 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
SERGEF-212ENST00000529728 FMN1Q68DA7 1419 aa41.07■■■■■ 4.16
SERGEF-212ENST00000529728 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.02■■■■■ 4.16
SERGEF-212ENST00000529728 ARID3CA6NKF2 412 aa41■■■■■ 4.15
SERGEF-212ENST00000529728 HECW1Q76N89 1606 aa40.95■■■■■ 4.15
SERGEF-212ENST00000529728 CLIP1P30622 1438 aa40.9■■■■■ 4.14
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SERGEF-212ENST00000529728 KCNH8Q96L42 1107 aa40.86■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.86■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.86■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.85■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 CD109Q6YHK3 1445 aa40.83■■■■■ 4.13
SERGEF-212ENST00000529728 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
SERGEF-212ENST00000529728 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
SERGEF-212ENST00000529728 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
SERGEF-212ENST00000529728 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.77■■■■■ 4.12
SERGEF-212ENST00000529728 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.73■■■■■ 4.11
SERGEF-212ENST00000529728 CEP162Q5TB80 1403 aa40.7■■■■■ 4.11
SERGEF-212ENST00000529728 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.68■■■■■ 4.1
SERGEF-212ENST00000529728 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
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SERGEF-212ENST00000529728 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.2■■■■■ 4.03
SERGEF-212ENST00000529728 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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SERGEF-212ENST00000529728 ADGRL1O94910 1474 aa40.13■■■■■ 4.01
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.12■■■■■ 4.01
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