RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.76■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 ARAP1Q96P48 1450 aa19.75■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.74■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.74■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 FBLN2P98095 1184 aa19.71■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.71■□□□□ 0.75
ATG13-211ENST00000528494 APLP2Q06481 763 aa19.7■□□□□ 0.74
ATG13-211ENST00000528494 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ATG13-211ENST00000528494 ADAMTS12P58397 1594 aa19.68■□□□□ 0.74
ATG13-211ENST00000528494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ATG13-211ENST00000528494 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.61■□□□□ 0.73
ATG13-211ENST00000528494 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.61■□□□□ 0.73
ATG13-211ENST00000528494 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
ATG13-211ENST00000528494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ATG13-211ENST00000528494 GRIN2AQ12879 1464 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG13-211ENST00000528494 SYNJ2O15056 1496 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG13-211ENST00000528494 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ATG13-211ENST00000528494 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG13-211ENST00000528494 IQGAP2Q13576 1575 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG13-211ENST00000528494 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG13-211ENST00000528494 SAMD9Q5K651 1589 aa19.43■□□□□ 0.7
ATG13-211ENST00000528494 CEP170Q5SW79 1584 aa19.43■□□□□ 0.7
ATG13-211ENST00000528494 FMN1Q68DA7 1419 aa19.42■□□□□ 0.7
ATG13-211ENST00000528494 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
ATG13-211ENST00000528494 JPH4Q96JJ6 628 aa19.4■□□□□ 0.7
ATG13-211ENST00000528494 NUP160Q12769 1436 aa19.38■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.38■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 ARID3CA6NKF2 412 aa19.37■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.37■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.35■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 DISP1Q96F81 1524 aa19.34■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 TIAM1Q13009 1591 aa19.33■□□□□ 0.69
ATG13-211ENST00000528494 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
ATG13-211ENST00000528494 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.3■□□□□ 0.68
ATG13-211ENST00000528494 CHD1O14646 1710 aa19.29■□□□□ 0.68
ATG13-211ENST00000528494 KIAA0556O60303 1618 aa19.29■□□□□ 0.68
ATG13-211ENST00000528494 MAP3K1Q13233 1512 aa19.28■□□□□ 0.68
ATG13-211ENST00000528494 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.25■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.23■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.21■□□□□ 0.67
ATG13-211ENST00000528494 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.2■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 ITGAEP38570 1179 aa19.19■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.19■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.17■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 HECW1Q76N89 1606 aa19.16■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.16■□□□□ 0.66
ATG13-211ENST00000528494 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.13■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 PTPRGP23470 1445 aa19.11■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.11■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.1■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ATG13-211ENST00000528494 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.08■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 NCOA2Q15596 1464 aa19.06■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.04■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.04■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 SHROOM2Q13796 1616 aa19.03■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 OSCARQ8IYS5 282 aa19.03■□□□□ 0.64
ATG13-211ENST00000528494 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 ABCA8O94911 1581 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 NEUROD1Q13562 356 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 ATP10BO94823 1461 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG13-211ENST00000528494 UACAQ9BZF9 1416 aa18.95■□□□□ 0.62
ATG13-211ENST00000528494 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.94■□□□□ 0.62
ATG13-211ENST00000528494 ARHGEF11O15085 1522 aa18.93■□□□□ 0.62
ATG13-211ENST00000528494 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
ATG13-211ENST00000528494 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.85■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.85■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 KIF14Q15058 1648 aa18.85■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 PTPRKQ15262 1439 aa18.84■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 KCNH8Q96L42 1107 aa18.84■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 ABCC2Q92887 1545 aa18.84■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.83■□□□□ 0.61
ATG13-211ENST00000528494 MIA2Q96PC5 1412 aa18.81■□□□□ 0.6
ATG13-211ENST00000528494 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.81■□□□□ 0.6
ATG13-211ENST00000528494 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ATG13-211ENST00000528494 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG13-211ENST00000528494 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ATG13-211ENST00000528494 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
ATG13-211ENST00000528494 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG13-211ENST00000528494 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG13-211ENST00000528494 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms