RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
PACSIN3-204ENST00000528201 CUL7Q14999 1698 aa41.31■■■■■ 4.2
PACSIN3-204ENST00000528201 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.27■■■■■ 4.2
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.21■■■■■ 4.19
PACSIN3-204ENST00000528201 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.92■■■■■ 4.14
PACSIN3-204ENST00000528201 IQGAP2Q13576 1575 aa40.84■■■■■ 4.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.78■■■■■ 4.12
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRGP23470 1445 aa40.76■■■■■ 4.11
PACSIN3-204ENST00000528201 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.74■■■■■ 4.11
PACSIN3-204ENST00000528201 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.72■■■■■ 4.11
PACSIN3-204ENST00000528201 DISP1Q96F81 1524 aa40.71■■■■■ 4.11
PACSIN3-204ENST00000528201 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
PACSIN3-204ENST00000528201 PRXQ9BXM0 1461 aa40.68■■■■■ 4.1
PACSIN3-204ENST00000528201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
PACSIN3-204ENST00000528201 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
PACSIN3-204ENST00000528201 MAPKBP1O60336 1514 aa40.62■■■■■ 4.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.56■■■■■ 4.08
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.55■■■■■ 4.08
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.52■■■■■ 4.08
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0556O60303 1618 aa40.49■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC2Q92887 1545 aa40.47■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 DIP2BQ9P265 1576 aa40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 UACAQ9BZF9 1416 aa40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.42■■■■■ 4.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ASXL2Q76L83 1435 aa40.3■■■■■ 4.04
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA3Q08378 1498 aa40.29■■■■■ 4.04
PACSIN3-204ENST00000528201 EEA1Q15075 1411 aa40.29■■■■■ 4.04
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.26■■■■■ 4.04
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
PACSIN3-204ENST00000528201 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.24■■■■■ 4.03
PACSIN3-204ENST00000528201 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.18■■■■■ 4.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA8O94911 1581 aa40.12■■■■■ 4.01
PACSIN3-204ENST00000528201 P3H3Q8IVL6 736 aa40.11■■■■■ 4.01
PACSIN3-204ENST00000528201 GLI2P10070 1586 aa40.08■■■■■ 4.01
PACSIN3-204ENST00000528201 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPOAP1O95153 1857 aa40.02■■■■■ 4
PACSIN3-204ENST00000528201 SAMD9Q5K651 1589 aa40■■■■□ 3.99
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.96■■■■□ 3.99
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF21BO75037 1637 aa39.94■■■■□ 3.99
PACSIN3-204ENST00000528201 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM6BO15054 1643 aa39.92■■■■□ 3.98
PACSIN3-204ENST00000528201 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ARID3CA6NKF2 412 aa39.88■■■■□ 3.97
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.85■■■■□ 3.97
PACSIN3-204ENST00000528201 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.82■■■■□ 3.97
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP10BO94823 1461 aa39.82■■■■□ 3.97
PACSIN3-204ENST00000528201 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.8■■■■□ 3.96
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNH8Q96L42 1107 aa39.78■■■■□ 3.96
PACSIN3-204ENST00000528201 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
PACSIN3-204ENST00000528201 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
PACSIN3-204ENST00000528201 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.71■■■■□ 3.95
PACSIN3-204ENST00000528201 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.69■■■■□ 3.94
PACSIN3-204ENST00000528201 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
PACSIN3-204ENST00000528201 CD109Q6YHK3 1445 aa39.67■■■■□ 3.94
PACSIN3-204ENST00000528201 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
PACSIN3-204ENST00000528201 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.65■■■■□ 3.94
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.61■■■■□ 3.93
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.57■■■■□ 3.92
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.48■■■■□ 3.91
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.48■■■■□ 3.91
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.43■■■■□ 3.9
PACSIN3-204ENST00000528201 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.34■■■■□ 3.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FMN1Q68DA7 1419 aa39.31■■■■□ 3.88
PACSIN3-204ENST00000528201 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.29■■■■□ 3.88
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRL1O94910 1474 aa39.2■■■■□ 3.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.2■■■■□ 3.87
PACSIN3-204ENST00000528201 NEO1Q92859 1461 aa39.19■■■■□ 3.86
PACSIN3-204ENST00000528201 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
PACSIN3-204ENST00000528201 HECW1Q76N89 1606 aa39.17■■■■□ 3.86
PACSIN3-204ENST00000528201 RAPGEF3O95398 923 aa39.14■■■■□ 3.86
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.12■■■■□ 3.85
PACSIN3-204ENST00000528201 FANCAO15360 1455 aa39.04■■■■□ 3.84
PACSIN3-204ENST00000528201 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.04■■■■□ 3.84
PACSIN3-204ENST00000528201 AKNAQ7Z591 1439 aa39.01■■■■□ 3.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CLIP1P30622 1438 aa38.99■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.99■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.96■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 PLCH2O75038 1416 aa38.95■■■■□ 3.83
PACSIN3-204ENST00000528201 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF14Q15058 1648 aa38.92■■■■□ 3.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.88■■■■□ 3.81
PACSIN3-204ENST00000528201 RICTORQ6R327 1708 aa38.83■■■■□ 3.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.83■■■■□ 3.81
PACSIN3-204ENST00000528201 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.83■■■■□ 3.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.79■■■■□ 3.8
PACSIN3-204ENST00000528201 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.77■■■■□ 3.8
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.75■■■■□ 3.79
PACSIN3-204ENST00000528201 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.74■■■■□ 3.79
PACSIN3-204ENST00000528201 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.74■■■■□ 3.79
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.73■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms