RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527749.5

RELA-211, Transcript of RELA proto-oncogene, NF-kB subunit, humanhuman

TSL 5

Gene RELA, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELA-211ENST00000527749 ARAP1Q96P48 1450 aa46.13■■■■■ 4.98
RELA-211ENST00000527749 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.12■■■■■ 4.97
RELA-211ENST00000527749 PRXQ9BXM0 1461 aa46.12■■■■■ 4.97
RELA-211ENST00000527749 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.1■■■■■ 4.97
RELA-211ENST00000527749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.09■■■■■ 4.97
RELA-211ENST00000527749 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
RELA-211ENST00000527749 JPH4Q96JJ6 628 aa46.05■■■■■ 4.96
RELA-211ENST00000527749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.01■■■■■ 4.96
RELA-211ENST00000527749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
RELA-211ENST00000527749 IQGAP2Q13576 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
RELA-211ENST00000527749 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.79■■■■■ 4.92
RELA-211ENST00000527749 KIF21BO75037 1637 aa45.7■■■■■ 4.91
RELA-211ENST00000527749 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.66■■■■■ 4.9
RELA-211ENST00000527749 DISP1Q96F81 1524 aa45.59■■■■■ 4.89
RELA-211ENST00000527749 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.59■■■■■ 4.89
RELA-211ENST00000527749 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.49■■■■■ 4.87
RELA-211ENST00000527749 KIAA0556O60303 1618 aa45.48■■■■■ 4.87
RELA-211ENST00000527749 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.46■■■■■ 4.87
RELA-211ENST00000527749 GOLGA3Q08378 1498 aa45.43■■■■■ 4.86
RELA-211ENST00000527749 PTPRGP23470 1445 aa45.43■■■■■ 4.86
RELA-211ENST00000527749 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
RELA-211ENST00000527749 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
RELA-211ENST00000527749 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.28■■■■■ 4.84
RELA-211ENST00000527749 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
RELA-211ENST00000527749 SAMD9Q5K651 1589 aa45.22■■■■■ 4.83
RELA-211ENST00000527749 P3H3Q8IVL6 736 aa45.19■■■■■ 4.82
RELA-211ENST00000527749 UACAQ9BZF9 1416 aa45.13■■■■■ 4.82
RELA-211ENST00000527749 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.07■■■■■ 4.81
RELA-211ENST00000527749 ABCC2Q92887 1545 aa45.06■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.03■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.03■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.01■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.01■■■■■ 4.8
RELA-211ENST00000527749 ABCA8O94911 1581 aa44.98■■■■■ 4.79
RELA-211ENST00000527749 MAPKBP1O60336 1514 aa44.91■■■■■ 4.78
RELA-211ENST00000527749 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.87■■■■■ 4.77
RELA-211ENST00000527749 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.86■■■■■ 4.77
RELA-211ENST00000527749 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
RELA-211ENST00000527749 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.75■■■■■ 4.75
RELA-211ENST00000527749 ASXL2Q76L83 1435 aa44.72■■■■■ 4.75
RELA-211ENST00000527749 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.7■■■■■ 4.75
RELA-211ENST00000527749 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.7■■■■■ 4.75
RELA-211ENST00000527749 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.69■■■■■ 4.74
RELA-211ENST00000527749 ARID3CA6NKF2 412 aa44.66■■■■■ 4.74
RELA-211ENST00000527749 DIP2BQ9P265 1576 aa44.65■■■■■ 4.74
RELA-211ENST00000527749 CLIP1P30622 1438 aa44.64■■■■■ 4.74
RELA-211ENST00000527749 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
RELA-211ENST00000527749 ATP10BO94823 1461 aa44.6■■■■■ 4.73
RELA-211ENST00000527749 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.6■■■■■ 4.73
RELA-211ENST00000527749 FMN1Q68DA7 1419 aa44.58■■■■■ 4.73
RELA-211ENST00000527749 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.51■■■■■ 4.72
RELA-211ENST00000527749 CEP162Q5TB80 1403 aa44.49■■■■■ 4.71
RELA-211ENST00000527749 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
RELA-211ENST00000527749 GLI2P10070 1586 aa44.4■■■■■ 4.7
RELA-211ENST00000527749 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
RELA-211ENST00000527749 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
RELA-211ENST00000527749 HECW1Q76N89 1606 aa44.39■■■■■ 4.7
RELA-211ENST00000527749 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
RELA-211ENST00000527749 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
RELA-211ENST00000527749 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
RELA-211ENST00000527749 KCNH8Q96L42 1107 aa44.32■■■■■ 4.69
RELA-211ENST00000527749 TSPOAP1O95153 1857 aa44.3■■■■■ 4.68
RELA-211ENST00000527749 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.29■■■■■ 4.68
RELA-211ENST00000527749 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.23■■■■■ 4.67
RELA-211ENST00000527749 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.23■■■■■ 4.67
RELA-211ENST00000527749 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.19■■■■■ 4.66
RELA-211ENST00000527749 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.18■■■■■ 4.66
RELA-211ENST00000527749 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
RELA-211ENST00000527749 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.12■■■■■ 4.65
RELA-211ENST00000527749 CD109Q6YHK3 1445 aa44.07■■■■■ 4.65
RELA-211ENST00000527749 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.07■■■■■ 4.65
RELA-211ENST00000527749 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.06■■■■■ 4.64
RELA-211ENST00000527749 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
RELA-211ENST00000527749 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.97■■■■■ 4.63
RELA-211ENST00000527749 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.96■■■■■ 4.63
RELA-211ENST00000527749 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
RELA-211ENST00000527749 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.94■■■■■ 4.62
RELA-211ENST00000527749 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.92■■■■■ 4.62
RELA-211ENST00000527749 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.9■■■■■ 4.62
RELA-211ENST00000527749 KDM6BO15054 1643 aa43.88■■■■■ 4.62
RELA-211ENST00000527749 KIF14Q15058 1648 aa43.87■■■■■ 4.61
RELA-211ENST00000527749 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
RELA-211ENST00000527749 NEO1Q92859 1461 aa43.66■■■■■ 4.58
RELA-211ENST00000527749 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.66■■■■■ 4.58
RELA-211ENST00000527749 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.65■■■■■ 4.58
RELA-211ENST00000527749 PLCH2O75038 1416 aa43.65■■■■■ 4.58
RELA-211ENST00000527749 TIAM1Q13009 1591 aa43.63■■■■■ 4.58
RELA-211ENST00000527749 FANCAO15360 1455 aa43.61■■■■■ 4.57
RELA-211ENST00000527749 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.59■■■■■ 4.57
RELA-211ENST00000527749 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.58■■■■■ 4.57
RELA-211ENST00000527749 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.58■■■■■ 4.57
RELA-211ENST00000527749 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.57■■■■■ 4.57
RELA-211ENST00000527749 AKNAQ7Z591 1439 aa43.54■■■■■ 4.56
RELA-211ENST00000527749 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.48■■■■■ 4.55
RELA-211ENST00000527749 MAP3K1Q13233 1512 aa43.48■■■■■ 4.55
RELA-211ENST00000527749 PREX2Q70Z35 1606 aa43.48■■■■■ 4.55
RELA-211ENST00000527749 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.48■■■■■ 4.55
RELA-211ENST00000527749 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.47■■■■■ 4.55
RELA-211ENST00000527749 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.46■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.3 ms