RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527680.1

TRAPPC4-208, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-208ENST00000527680 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.79■■■■□ 3.8
TRAPPC4-208ENST00000527680 CUL7Q14999 1698 aa38.73■■■■□ 3.79
TRAPPC4-208ENST00000527680 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
TRAPPC4-208ENST00000527680 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.7■■■■□ 3.79
TRAPPC4-208ENST00000527680 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC4-208ENST00000527680 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
TRAPPC4-208ENST00000527680 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.5■■■■□ 3.75
TRAPPC4-208ENST00000527680 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
TRAPPC4-208ENST00000527680 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.47■■■■□ 3.75
TRAPPC4-208ENST00000527680 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.42■■■■□ 3.74
TRAPPC4-208ENST00000527680 PTPRGP23470 1445 aa38.42■■■■□ 3.74
TRAPPC4-208ENST00000527680 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.4■■■■□ 3.74
TRAPPC4-208ENST00000527680 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.37■■■■□ 3.73
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAPKBP1O60336 1514 aa38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC4-208ENST00000527680 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.32■■■■□ 3.73
TRAPPC4-208ENST00000527680 IQGAP2Q13576 1575 aa38.31■■■■□ 3.72
TRAPPC4-208ENST00000527680 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.28■■■■□ 3.72
TRAPPC4-208ENST00000527680 DIP2BQ9P265 1576 aa38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC4-208ENST00000527680 DISP1Q96F81 1524 aa38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC4-208ENST00000527680 ABCC2Q92887 1545 aa38.11■■■■□ 3.69
TRAPPC4-208ENST00000527680 TSPOAP1O95153 1857 aa38.09■■■■□ 3.69
TRAPPC4-208ENST00000527680 UACAQ9BZF9 1416 aa38.08■■■■□ 3.69
TRAPPC4-208ENST00000527680 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.05■■■■□ 3.68
TRAPPC4-208ENST00000527680 ASXL2Q76L83 1435 aa38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC4-208ENST00000527680 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC4-208ENST00000527680 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.99■■■■□ 3.67
TRAPPC4-208ENST00000527680 KDM6BO15054 1643 aa37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC4-208ENST00000527680 KIAA0556O60303 1618 aa37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC4-208ENST00000527680 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.89■■■■□ 3.66
TRAPPC4-208ENST00000527680 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.86■■■■□ 3.65
TRAPPC4-208ENST00000527680 GOLGA3Q08378 1498 aa37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC4-208ENST00000527680 PRXQ9BXM0 1461 aa37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC4-208ENST00000527680 GLI2P10070 1586 aa37.81■■■■□ 3.64
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC4-208ENST00000527680 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
TRAPPC4-208ENST00000527680 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
TRAPPC4-208ENST00000527680 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.74■■■■□ 3.63
TRAPPC4-208ENST00000527680 P3H3Q8IVL6 736 aa37.69■■■■□ 3.62
TRAPPC4-208ENST00000527680 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
TRAPPC4-208ENST00000527680 KCNH8Q96L42 1107 aa37.66■■■■□ 3.62
TRAPPC4-208ENST00000527680 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.62■■■■□ 3.61
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC4-208ENST00000527680 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.6■■■■□ 3.61
TRAPPC4-208ENST00000527680 ABCA8O94911 1581 aa37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC4-208ENST00000527680 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARID3CA6NKF2 412 aa37.55■■■■□ 3.6
TRAPPC4-208ENST00000527680 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
TRAPPC4-208ENST00000527680 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC4-208ENST00000527680 CD109Q6YHK3 1445 aa37.47■■■■□ 3.59
TRAPPC4-208ENST00000527680 EEA1Q15075 1411 aa37.46■■■■□ 3.59
TRAPPC4-208ENST00000527680 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
TRAPPC4-208ENST00000527680 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
TRAPPC4-208ENST00000527680 ATP10BO94823 1461 aa37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC4-208ENST00000527680 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC4-208ENST00000527680 SAMD9Q5K651 1589 aa37.32■■■■□ 3.56
TRAPPC4-208ENST00000527680 ADGRL1O94910 1474 aa37.26■■■■□ 3.55
TRAPPC4-208ENST00000527680 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.23■■■■□ 3.55
TRAPPC4-208ENST00000527680 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.2■■■■□ 3.55
TRAPPC4-208ENST00000527680 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC4-208ENST00000527680 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TRAPPC4-208ENST00000527680 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC4-208ENST00000527680 KIF21BO75037 1637 aa37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC4-208ENST00000527680 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
TRAPPC4-208ENST00000527680 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.07■■■■□ 3.53
TRAPPC4-208ENST00000527680 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.05■■■■□ 3.52
TRAPPC4-208ENST00000527680 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.04■■■■□ 3.52
TRAPPC4-208ENST00000527680 EFCAB5A4FU69 1503 aa37■■■■□ 3.51
TRAPPC4-208ENST00000527680 RAPGEF3O95398 923 aa36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC4-208ENST00000527680 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC4-208ENST00000527680 NEO1Q92859 1461 aa36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
TRAPPC4-208ENST00000527680 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
TRAPPC4-208ENST00000527680 FMN1Q68DA7 1419 aa36.76■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 AKNAQ7Z591 1439 aa36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FANCAO15360 1455 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.71■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.7■■■■□ 3.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 HECW1Q76N89 1606 aa36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 RICTORQ6R327 1708 aa36.57■■■■□ 3.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PLCH2O75038 1416 aa36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 PTPRMP28827 1452 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.51■■■■□ 3.43
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC4-208ENST00000527680 CLIP1P30622 1438 aa36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC4-208ENST00000527680 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC4-208ENST00000527680 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC4-208ENST00000527680 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC4-208ENST00000527680 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms