RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527407.5

ATRNL1-207, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-207ENST00000527407 CEP170Q5SW79 1584 aa42.6■■■■■ 4.41
ATRNL1-207ENST00000527407 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.51■■■■■ 4.4
ATRNL1-207ENST00000527407 CEP162Q5TB80 1403 aa42.47■■■■■ 4.39
ATRNL1-207ENST00000527407 PRXQ9BXM0 1461 aa42.43■■■■■ 4.38
ATRNL1-207ENST00000527407 ARHGEF11O15085 1522 aa42.4■■■■■ 4.38
ATRNL1-207ENST00000527407 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.35■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.34■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.34■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.34■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
ATRNL1-207ENST00000527407 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.31■■■■■ 4.36
ATRNL1-207ENST00000527407 JPH4Q96JJ6 628 aa42.25■■■■■ 4.35
ATRNL1-207ENST00000527407 SHROOM2Q13796 1616 aa42.21■■■■■ 4.35
ATRNL1-207ENST00000527407 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
ATRNL1-207ENST00000527407 IQGAP2Q13576 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
ATRNL1-207ENST00000527407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
ATRNL1-207ENST00000527407 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
ATRNL1-207ENST00000527407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.06■■■■■ 4.32
ATRNL1-207ENST00000527407 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.01■■■■■ 4.32
ATRNL1-207ENST00000527407 CLIP1P30622 1438 aa42■■■■■ 4.31
ATRNL1-207ENST00000527407 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.88■■■■■ 4.3
ATRNL1-207ENST00000527407 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.88■■■■■ 4.29
ATRNL1-207ENST00000527407 DISP1Q96F81 1524 aa41.81■■■■■ 4.28
ATRNL1-207ENST00000527407 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.77■■■■■ 4.28
ATRNL1-207ENST00000527407 HRCP23327 699 aa41.76■■■■■ 4.27
ATRNL1-207ENST00000527407 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
ATRNL1-207ENST00000527407 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
ATRNL1-207ENST00000527407 KIAA0556O60303 1618 aa41.71■■■■■ 4.27
ATRNL1-207ENST00000527407 PTPRGP23470 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
ATRNL1-207ENST00000527407 P3H3Q8IVL6 736 aa41.59■■■■■ 4.25
ATRNL1-207ENST00000527407 SAMD9Q5K651 1589 aa41.52■■■■■ 4.24
ATRNL1-207ENST00000527407 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
ATRNL1-207ENST00000527407 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.41■■■■■ 4.22
ATRNL1-207ENST00000527407 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.4■■■■■ 4.22
ATRNL1-207ENST00000527407 UACAQ9BZF9 1416 aa41.39■■■■■ 4.22
ATRNL1-207ENST00000527407 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.39■■■■■ 4.22
ATRNL1-207ENST00000527407 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.38■■■■■ 4.21
ATRNL1-207ENST00000527407 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
ATRNL1-207ENST00000527407 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.31■■■■■ 4.2
ATRNL1-207ENST00000527407 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.29■■■■■ 4.2
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCC2Q92887 1545 aa41.29■■■■■ 4.2
ATRNL1-207ENST00000527407 APLP2Q06481 763 aa41.28■■■■■ 4.2
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCA8O94911 1581 aa41.22■■■■■ 4.19
ATRNL1-207ENST00000527407 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
ATRNL1-207ENST00000527407 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.1■■■■■ 4.17
ATRNL1-207ENST00000527407 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.08■■■■■ 4.17
ATRNL1-207ENST00000527407 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 MAPKBP1O60336 1514 aa41.06■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 FMN1Q68DA7 1419 aa41.06■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 ARID3CA6NKF2 412 aa41.05■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 MAP3K1Q13233 1512 aa41.04■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
ATRNL1-207ENST00000527407 ASXL2Q76L83 1435 aa40.96■■■■■ 4.15
ATRNL1-207ENST00000527407 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
ATRNL1-207ENST00000527407 ATP10BO94823 1461 aa40.92■■■■■ 4.14
ATRNL1-207ENST00000527407 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
ATRNL1-207ENST00000527407 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
ATRNL1-207ENST00000527407 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.86■■■■■ 4.13
ATRNL1-207ENST00000527407 TIAM1Q13009 1591 aa40.85■■■■■ 4.13
ATRNL1-207ENST00000527407 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.83■■■■■ 4.13
ATRNL1-207ENST00000527407 HECW1Q76N89 1606 aa40.81■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.79■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.79■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.79■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 DIP2BQ9P265 1576 aa40.78■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.77■■■■■ 4.12
ATRNL1-207ENST00000527407 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
ATRNL1-207ENST00000527407 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
ATRNL1-207ENST00000527407 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.72■■■■■ 4.11
ATRNL1-207ENST00000527407 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
ATRNL1-207ENST00000527407 KCNH8Q96L42 1107 aa40.7■■■■■ 4.11
ATRNL1-207ENST00000527407 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.65■■■■■ 4.1
ATRNL1-207ENST00000527407 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
ATRNL1-207ENST00000527407 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.62■■■■■ 4.09
ATRNL1-207ENST00000527407 GLI2P10070 1586 aa40.6■■■■■ 4.09
ATRNL1-207ENST00000527407 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.57■■■■■ 4.08
ATRNL1-207ENST00000527407 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.56■■■■■ 4.08
ATRNL1-207ENST00000527407 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
ATRNL1-207ENST00000527407 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
ATRNL1-207ENST00000527407 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.43■■■■■ 4.06
ATRNL1-207ENST00000527407 TSPOAP1O95153 1857 aa40.41■■■■■ 4.06
ATRNL1-207ENST00000527407 CD109Q6YHK3 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
ATRNL1-207ENST00000527407 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.4■■■■■ 4.06
ATRNL1-207ENST00000527407 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.35■■■■■ 4.05
ATRNL1-207ENST00000527407 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.32■■■■■ 4.04
ATRNL1-207ENST00000527407 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ATRNL1-207ENST00000527407 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
ATRNL1-207ENST00000527407 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.26■■■■■ 4.04
ATRNL1-207ENST00000527407 KIF14Q15058 1648 aa40.25■■■■■ 4.03
ATRNL1-207ENST00000527407 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.24■■■■■ 4.03
ATRNL1-207ENST00000527407 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.23■■■■■ 4.03
ATRNL1-207ENST00000527407 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.21■■■■■ 4.03
ATRNL1-207ENST00000527407 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.18■■■■■ 4.02
ATRNL1-207ENST00000527407 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
ATRNL1-207ENST00000527407 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
ATRNL1-207ENST00000527407 PLCH2O75038 1416 aa40.08■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms