RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 JPH4Q96JJ6 628 aa29.28■■■□□ 2.28
SPCS2-204ENST00000527225 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SPCS2-204ENST00000527225 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.24■■■□□ 2.27
SPCS2-204ENST00000527225 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SPCS2-204ENST00000527225 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.09■■■□□ 2.25
SPCS2-204ENST00000527225 IQGAP2Q13576 1575 aa29.05■■■□□ 2.24
SPCS2-204ENST00000527225 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.94■■■□□ 2.22
SPCS2-204ENST00000527225 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.91■■■□□ 2.22
SPCS2-204ENST00000527225 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.9■■■□□ 2.22
SPCS2-204ENST00000527225 PRXQ9BXM0 1461 aa28.89■■■□□ 2.22
SPCS2-204ENST00000527225 PTPRGP23470 1445 aa28.87■■■□□ 2.21
SPCS2-204ENST00000527225 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.87■■■□□ 2.21
SPCS2-204ENST00000527225 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
SPCS2-204ENST00000527225 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
SPCS2-204ENST00000527225 DISP1Q96F81 1524 aa28.84■■■□□ 2.21
SPCS2-204ENST00000527225 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.81■■■□□ 2.2
SPCS2-204ENST00000527225 MAPKBP1O60336 1514 aa28.79■■■□□ 2.2
SPCS2-204ENST00000527225 KIAA0556O60303 1618 aa28.77■■■□□ 2.2
SPCS2-204ENST00000527225 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SPCS2-204ENST00000527225 EEA1Q15075 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
SPCS2-204ENST00000527225 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.76■■■□□ 2.19
SPCS2-204ENST00000527225 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.68■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.68■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC2Q92887 1545 aa28.68■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 GOLGA3Q08378 1498 aa28.67■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 UACAQ9BZF9 1416 aa28.67■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 DIP2BQ9P265 1576 aa28.65■■■□□ 2.18
SPCS2-204ENST00000527225 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.62■■■□□ 2.17
SPCS2-204ENST00000527225 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.61■■■□□ 2.17
SPCS2-204ENST00000527225 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SPCS2-204ENST00000527225 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.54■■■□□ 2.16
SPCS2-204ENST00000527225 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.52■■■□□ 2.16
SPCS2-204ENST00000527225 ASXL2Q76L83 1435 aa28.52■■■□□ 2.16
SPCS2-204ENST00000527225 KIF21BO75037 1637 aa28.51■■■□□ 2.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SPCS2-204ENST00000527225 TSPOAP1O95153 1857 aa28.48■■■□□ 2.15
SPCS2-204ENST00000527225 ABCA8O94911 1581 aa28.47■■■□□ 2.15
SPCS2-204ENST00000527225 SAMD9Q5K651 1589 aa28.47■■■□□ 2.15
SPCS2-204ENST00000527225 GLI2P10070 1586 aa28.43■■■□□ 2.14
SPCS2-204ENST00000527225 P3H3Q8IVL6 736 aa28.4■■■□□ 2.14
SPCS2-204ENST00000527225 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SPCS2-204ENST00000527225 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.32■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 KDM6BO15054 1643 aa28.29■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.29■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.28■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.27■■■□□ 2.12
SPCS2-204ENST00000527225 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.25■■■□□ 2.11
SPCS2-204ENST00000527225 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SPCS2-204ENST00000527225 ATP10BO94823 1461 aa28.22■■■□□ 2.11
SPCS2-204ENST00000527225 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.21■■■□□ 2.11
SPCS2-204ENST00000527225 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.18■■■□□ 2.1
SPCS2-204ENST00000527225 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.17■■■□□ 2.1
SPCS2-204ENST00000527225 ARID3CA6NKF2 412 aa28.17■■■□□ 2.1
SPCS2-204ENST00000527225 KCNH8Q96L42 1107 aa28.15■■■□□ 2.1
SPCS2-204ENST00000527225 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
SPCS2-204ENST00000527225 CD109Q6YHK3 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
SPCS2-204ENST00000527225 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.08■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.05■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.02■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SPCS2-204ENST00000527225 FMN1Q68DA7 1419 aa28■■■□□ 2.07
SPCS2-204ENST00000527225 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SPCS2-204ENST00000527225 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.94■■■□□ 2.06
SPCS2-204ENST00000527225 HECW1Q76N89 1606 aa27.92■■■□□ 2.06
SPCS2-204ENST00000527225 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SPCS2-204ENST00000527225 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
SPCS2-204ENST00000527225 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.85■■■□□ 2.05
SPCS2-204ENST00000527225 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.84■■■□□ 2.05
SPCS2-204ENST00000527225 NEO1Q92859 1461 aa27.82■■■□□ 2.04
SPCS2-204ENST00000527225 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
SPCS2-204ENST00000527225 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.8■■■□□ 2.04
SPCS2-204ENST00000527225 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.77■■■□□ 2.04
SPCS2-204ENST00000527225 CLIP1P30622 1438 aa27.76■■■□□ 2.04
SPCS2-204ENST00000527225 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.75■■■□□ 2.03
SPCS2-204ENST00000527225 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SPCS2-204ENST00000527225 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SPCS2-204ENST00000527225 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.74■■■□□ 2.03
SPCS2-204ENST00000527225 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
SPCS2-204ENST00000527225 FANCAO15360 1455 aa27.68■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.68■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 ADGRL1O94910 1474 aa27.67■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 KIF14Q15058 1648 aa27.67■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.66■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.66■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 AKNAQ7Z591 1439 aa27.66■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 RAPGEF3O95398 923 aa27.65■■■□□ 2.02
SPCS2-204ENST00000527225 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.64■■■□□ 2.01
SPCS2-204ENST00000527225 PLCH2O75038 1416 aa27.63■■■□□ 2.01
SPCS2-204ENST00000527225 RICTORQ6R327 1708 aa27.61■■■□□ 2.01
SPCS2-204ENST00000527225 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
SPCS2-204ENST00000527225 CEP162Q5TB80 1403 aa27.54■■■□□ 2
SPCS2-204ENST00000527225 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.52■■■□□ 2
SPCS2-204ENST00000527225 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.5■■□□□ 1.99
SPCS2-204ENST00000527225 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.49■■□□□ 1.99
SPCS2-204ENST00000527225 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms