RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 IGF1RP08069 1367 aa27.41■■□□□ 1.98
KCNQ1-206ENST00000526095 JPH4Q96JJ6 628 aa27.4■■□□□ 1.98
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-206ENST00000526095 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.3■■□□□ 1.96
KCNQ1-206ENST00000526095 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-206ENST00000526095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-206ENST00000526095 MAPKBP1O60336 1514 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-206ENST00000526095 IQGAP2Q13576 1575 aa27.11■■□□□ 1.93
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1-206ENST00000526095 DIP2BQ9P265 1576 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1-206ENST00000526095 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-206ENST00000526095 PTPRGP23470 1445 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.98■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.98■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 DISP1Q96F81 1524 aa26.96■■□□□ 1.91
KCNQ1-206ENST00000526095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
KCNQ1-206ENST00000526095 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-206ENST00000526095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNQ1-206ENST00000526095 TSPOAP1O95153 1857 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCC2Q92887 1545 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA0556O60303 1618 aa26.88■■□□□ 1.89
KCNQ1-206ENST00000526095 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.86■■□□□ 1.89
KCNQ1-206ENST00000526095 UACAQ9BZF9 1416 aa26.82■■□□□ 1.88
KCNQ1-206ENST00000526095 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
KCNQ1-206ENST00000526095 ASXL2Q76L83 1435 aa26.8■■□□□ 1.88
KCNQ1-206ENST00000526095 KDM6BO15054 1643 aa26.79■■□□□ 1.88
KCNQ1-206ENST00000526095 PRXQ9BXM0 1461 aa26.77■■□□□ 1.88
KCNQ1-206ENST00000526095 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.76■■□□□ 1.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
KCNQ1-206ENST00000526095 GLI2P10070 1586 aa26.75■■□□□ 1.87
KCNQ1-206ENST00000526095 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.75■■□□□ 1.87
KCNQ1-206ENST00000526095 GOLGA3Q08378 1498 aa26.67■■□□□ 1.86
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.65■■□□□ 1.86
KCNQ1-206ENST00000526095 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCA8O94911 1581 aa26.63■■□□□ 1.85
KCNQ1-206ENST00000526095 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.55■■□□□ 1.84
KCNQ1-206ENST00000526095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.51■■□□□ 1.83
KCNQ1-206ENST00000526095 SAMD9Q5K651 1589 aa26.49■■□□□ 1.83
KCNQ1-206ENST00000526095 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.47■■□□□ 1.83
KCNQ1-206ENST00000526095 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
KCNQ1-206ENST00000526095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.47■■□□□ 1.83
KCNQ1-206ENST00000526095 EEA1Q15075 1411 aa26.44■■□□□ 1.82
KCNQ1-206ENST00000526095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.42■■□□□ 1.82
KCNQ1-206ENST00000526095 P3H3Q8IVL6 736 aa26.42■■□□□ 1.82
KCNQ1-206ENST00000526095 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP10BO94823 1461 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CD109Q6YHK3 1445 aa26.35■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 KCNH8Q96L42 1107 aa26.35■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ARID3CA6NKF2 412 aa26.33■■□□□ 1.81
KCNQ1-206ENST00000526095 KIF21BO75037 1637 aa26.32■■□□□ 1.8
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ADGRL1O94910 1474 aa26.28■■□□□ 1.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.26■■□□□ 1.79
KCNQ1-206ENST00000526095 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.25■■□□□ 1.79
KCNQ1-206ENST00000526095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
KCNQ1-206ENST00000526095 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
KCNQ1-206ENST00000526095 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.19■■□□□ 1.78
KCNQ1-206ENST00000526095 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.15■■□□□ 1.78
KCNQ1-206ENST00000526095 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
KCNQ1-206ENST00000526095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
KCNQ1-206ENST00000526095 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.11■■□□□ 1.77
KCNQ1-206ENST00000526095 NEO1Q92859 1461 aa26.05■■□□□ 1.76
KCNQ1-206ENST00000526095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.04■■□□□ 1.76
KCNQ1-206ENST00000526095 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.04■■□□□ 1.76
KCNQ1-206ENST00000526095 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.03■■□□□ 1.76
KCNQ1-206ENST00000526095 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.98■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.98■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 RAPGEF3O95398 923 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-206ENST00000526095 RICTORQ6R327 1708 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 HECW1Q76N89 1606 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.92■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 FMN1Q68DA7 1419 aa25.9■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 FANCAO15360 1455 aa25.9■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.89■■□□□ 1.74
KCNQ1-206ENST00000526095 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1-206ENST00000526095 AKNAQ7Z591 1439 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-206ENST00000526095 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1-206ENST00000526095 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-206ENST00000526095 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.83■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 KIF14Q15058 1648 aa25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.8■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 MADDQ8WXG6 1647 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 PLCH2O75038 1416 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNQ1-206ENST00000526095 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.76■■□□□ 1.71
KCNQ1-206ENST00000526095 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
KCNQ1-206ENST00000526095 PTPRMP28827 1452 aa25.75■■□□□ 1.71
KCNQ1-206ENST00000526095 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.73■■□□□ 1.71
KCNQ1-206ENST00000526095 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
KCNQ1-206ENST00000526095 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms