RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525699.5

FNTA-204, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 5

Gene FNTA, Length 516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-204ENST00000525699 JPH4Q96JJ6 628 aa44.08■■■■■ 4.65
FNTA-204ENST00000525699 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
FNTA-204ENST00000525699 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.03■■■■■ 4.64
FNTA-204ENST00000525699 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
FNTA-204ENST00000525699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.88■■■■■ 4.61
FNTA-204ENST00000525699 IQGAP2Q13576 1575 aa43.79■■■■■ 4.6
FNTA-204ENST00000525699 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.6■■■■■ 4.57
FNTA-204ENST00000525699 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.59■■■■■ 4.57
FNTA-204ENST00000525699 PRXQ9BXM0 1461 aa43.59■■■■■ 4.57
FNTA-204ENST00000525699 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.51■■■■■ 4.56
FNTA-204ENST00000525699 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
FNTA-204ENST00000525699 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.49■■■■■ 4.55
FNTA-204ENST00000525699 PTPRGP23470 1445 aa43.48■■■■■ 4.55
FNTA-204ENST00000525699 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.47■■■■■ 4.55
FNTA-204ENST00000525699 DISP1Q96F81 1524 aa43.46■■■■■ 4.55
FNTA-204ENST00000525699 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.44■■■■■ 4.54
FNTA-204ENST00000525699 EEA1Q15075 1411 aa43.44■■■■■ 4.54
FNTA-204ENST00000525699 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
FNTA-204ENST00000525699 KIAA0556O60303 1618 aa43.38■■■■■ 4.54
FNTA-204ENST00000525699 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.33■■■■■ 4.53
FNTA-204ENST00000525699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
FNTA-204ENST00000525699 MAPKBP1O60336 1514 aa43.27■■■■■ 4.52
FNTA-204ENST00000525699 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.26■■■■■ 4.52
FNTA-204ENST00000525699 GOLGA3Q08378 1498 aa43.23■■■■■ 4.51
FNTA-204ENST00000525699 UACAQ9BZF9 1416 aa43.18■■■■■ 4.5
FNTA-204ENST00000525699 ABCC2Q92887 1545 aa43.17■■■■■ 4.5
FNTA-204ENST00000525699 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.14■■■■■ 4.5
FNTA-204ENST00000525699 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.12■■■■■ 4.49
FNTA-204ENST00000525699 KIF21BO75037 1637 aa43.08■■■■■ 4.49
FNTA-204ENST00000525699 DIP2BQ9P265 1576 aa43.08■■■■■ 4.49
FNTA-204ENST00000525699 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.05■■■■■ 4.48
FNTA-204ENST00000525699 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.97■■■■■ 4.47
FNTA-204ENST00000525699 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
FNTA-204ENST00000525699 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.95■■■■■ 4.47
FNTA-204ENST00000525699 ASXL2Q76L83 1435 aa42.94■■■■■ 4.46
FNTA-204ENST00000525699 SAMD9Q5K651 1589 aa42.94■■■■■ 4.46
FNTA-204ENST00000525699 P3H3Q8IVL6 736 aa42.92■■■■■ 4.46
FNTA-204ENST00000525699 ABCA8O94911 1581 aa42.9■■■■■ 4.46
FNTA-204ENST00000525699 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
FNTA-204ENST00000525699 TSPOAP1O95153 1857 aa42.83■■■■■ 4.45
FNTA-204ENST00000525699 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.83■■■■■ 4.45
FNTA-204ENST00000525699 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
FNTA-204ENST00000525699 GLI2P10070 1586 aa42.72■■■■■ 4.43
FNTA-204ENST00000525699 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.67■■■■■ 4.42
FNTA-204ENST00000525699 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
FNTA-204ENST00000525699 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.67■■■■■ 4.42
FNTA-204ENST00000525699 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.67■■■■■ 4.42
FNTA-204ENST00000525699 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.64■■■■■ 4.42
FNTA-204ENST00000525699 ARID3CA6NKF2 412 aa42.6■■■■■ 4.41
FNTA-204ENST00000525699 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
FNTA-204ENST00000525699 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.56■■■■■ 4.4
FNTA-204ENST00000525699 KDM6BO15054 1643 aa42.54■■■■■ 4.4
FNTA-204ENST00000525699 ATP10BO94823 1461 aa42.52■■■■■ 4.4
FNTA-204ENST00000525699 KCNH8Q96L42 1107 aa42.45■■■■■ 4.39
FNTA-204ENST00000525699 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
FNTA-204ENST00000525699 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.39■■■■■ 4.38
FNTA-204ENST00000525699 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
FNTA-204ENST00000525699 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
FNTA-204ENST00000525699 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.37■■■■■ 4.37
FNTA-204ENST00000525699 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.37■■■■■ 4.37
FNTA-204ENST00000525699 CD109Q6YHK3 1445 aa42.29■■■■■ 4.36
FNTA-204ENST00000525699 FMN1Q68DA7 1419 aa42.26■■■■■ 4.36
FNTA-204ENST00000525699 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.21■■■■■ 4.35
FNTA-204ENST00000525699 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.19■■■■■ 4.34
FNTA-204ENST00000525699 HECW1Q76N89 1606 aa42.17■■■■■ 4.34
FNTA-204ENST00000525699 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
FNTA-204ENST00000525699 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
FNTA-204ENST00000525699 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
FNTA-204ENST00000525699 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.11■■■■■ 4.33
FNTA-204ENST00000525699 CLIP1P30622 1438 aa42■■■■■ 4.31
FNTA-204ENST00000525699 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
FNTA-204ENST00000525699 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
FNTA-204ENST00000525699 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.95■■■■■ 4.31
FNTA-204ENST00000525699 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.3
FNTA-204ENST00000525699 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.9■■■■■ 4.3
FNTA-204ENST00000525699 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.86■■■■■ 4.29
FNTA-204ENST00000525699 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.86■■■■■ 4.29
FNTA-204ENST00000525699 NEO1Q92859 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
FNTA-204ENST00000525699 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
FNTA-204ENST00000525699 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.84■■■■■ 4.29
FNTA-204ENST00000525699 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
FNTA-204ENST00000525699 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
FNTA-204ENST00000525699 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.76■■■■■ 4.28
FNTA-204ENST00000525699 KIF14Q15058 1648 aa41.76■■■■■ 4.28
FNTA-204ENST00000525699 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
FNTA-204ENST00000525699 FANCAO15360 1455 aa41.72■■■■■ 4.27
FNTA-204ENST00000525699 CEP162Q5TB80 1403 aa41.72■■■■■ 4.27
FNTA-204ENST00000525699 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.69■■■■■ 4.27
FNTA-204ENST00000525699 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.65■■■■■ 4.26
FNTA-204ENST00000525699 RAPGEF3O95398 923 aa41.65■■■■■ 4.26
FNTA-204ENST00000525699 AKNAQ7Z591 1439 aa41.65■■■■■ 4.26
FNTA-204ENST00000525699 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.63■■■■■ 4.25
FNTA-204ENST00000525699 PLCH2O75038 1416 aa41.62■■■■■ 4.25
FNTA-204ENST00000525699 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.6■■■■■ 4.25
FNTA-204ENST00000525699 ADGRL1O94910 1474 aa41.6■■■■■ 4.25
FNTA-204ENST00000525699 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
FNTA-204ENST00000525699 RICTORQ6R327 1708 aa41.56■■■■■ 4.24
FNTA-204ENST00000525699 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.49■■■■■ 4.23
FNTA-204ENST00000525699 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.47■■■■■ 4.23
FNTA-204ENST00000525699 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.43■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.3 ms