RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
PTDSS2-202ENST00000525059 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.97■■■■□ 3.19
PTDSS2-202ENST00000525059 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.96■■■■□ 3.19
PTDSS2-202ENST00000525059 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
PTDSS2-202ENST00000525059 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.71■■■■□ 3.15
PTDSS2-202ENST00000525059 IQGAP2Q13576 1575 aa34.6■■■■□ 3.13
PTDSS2-202ENST00000525059 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.56■■■■□ 3.12
PTDSS2-202ENST00000525059 PTPRGP23470 1445 aa34.52■■■■□ 3.12
PTDSS2-202ENST00000525059 PRXQ9BXM0 1461 aa34.52■■■■□ 3.12
PTDSS2-202ENST00000525059 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.5■■■■□ 3.11
PTDSS2-202ENST00000525059 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
PTDSS2-202ENST00000525059 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
PTDSS2-202ENST00000525059 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.46■■■■□ 3.11
PTDSS2-202ENST00000525059 DISP1Q96F81 1524 aa34.45■■■■□ 3.1
PTDSS2-202ENST00000525059 MAPKBP1O60336 1514 aa34.39■■■■□ 3.1
PTDSS2-202ENST00000525059 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.38■■■■□ 3.09
PTDSS2-202ENST00000525059 EEA1Q15075 1411 aa34.32■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.31■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.3■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.28■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 KIAA0556O60303 1618 aa34.27■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 UACAQ9BZF9 1416 aa34.27■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCC2Q92887 1545 aa34.26■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.26■■■■□ 3.08
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.24■■■■□ 3.07
PTDSS2-202ENST00000525059 GOLGA3Q08378 1498 aa34.22■■■■□ 3.07
PTDSS2-202ENST00000525059 DIP2BQ9P265 1576 aa34.17■■■■□ 3.06
PTDSS2-202ENST00000525059 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.15■■■■□ 3.06
PTDSS2-202ENST00000525059 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.12■■■■□ 3.05
PTDSS2-202ENST00000525059 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.09■■■■□ 3.05
PTDSS2-202ENST00000525059 ASXL2Q76L83 1435 aa34.08■■■■□ 3.05
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCA8O94911 1581 aa33.98■■■■□ 3.03
PTDSS2-202ENST00000525059 GLI2P10070 1586 aa33.96■■■■□ 3.03
PTDSS2-202ENST00000525059 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF21BO75037 1637 aa33.93■■■■□ 3.02
PTDSS2-202ENST00000525059 SAMD9Q5K651 1589 aa33.91■■■■□ 3.02
PTDSS2-202ENST00000525059 P3H3Q8IVL6 736 aa33.89■■■■□ 3.02
PTDSS2-202ENST00000525059 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PTDSS2-202ENST00000525059 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.82■■■■□ 3.01
PTDSS2-202ENST00000525059 TSPOAP1O95153 1857 aa33.79■■■■□ 3
PTDSS2-202ENST00000525059 ATP10BO94823 1461 aa33.73■■■□□ 2.99
PTDSS2-202ENST00000525059 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.72■■■□□ 2.99
PTDSS2-202ENST00000525059 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PTDSS2-202ENST00000525059 KDM6BO15054 1643 aa33.71■■■□□ 2.99
PTDSS2-202ENST00000525059 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.69■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.67■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.64■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.64■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 KCNH8Q96L42 1107 aa33.64■■■□□ 2.98
PTDSS2-202ENST00000525059 ARID3CA6NKF2 412 aa33.59■■■□□ 2.97
PTDSS2-202ENST00000525059 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PTDSS2-202ENST00000525059 CD109Q6YHK3 1445 aa33.58■■■□□ 2.97
PTDSS2-202ENST00000525059 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.57■■■□□ 2.96
PTDSS2-202ENST00000525059 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.55■■■□□ 2.96
PTDSS2-202ENST00000525059 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.54■■■□□ 2.96
PTDSS2-202ENST00000525059 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PTDSS2-202ENST00000525059 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PTDSS2-202ENST00000525059 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.46■■■□□ 2.95
PTDSS2-202ENST00000525059 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
PTDSS2-202ENST00000525059 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
PTDSS2-202ENST00000525059 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.41■■■□□ 2.94
PTDSS2-202ENST00000525059 FMN1Q68DA7 1419 aa33.41■■■□□ 2.94
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.41■■■□□ 2.94
PTDSS2-202ENST00000525059 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.34■■■□□ 2.93
PTDSS2-202ENST00000525059 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.3■■■□□ 2.92
PTDSS2-202ENST00000525059 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.27■■■□□ 2.92
PTDSS2-202ENST00000525059 NEO1Q92859 1461 aa33.24■■■□□ 2.91
PTDSS2-202ENST00000525059 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
PTDSS2-202ENST00000525059 HECW1Q76N89 1606 aa33.22■■■□□ 2.91
PTDSS2-202ENST00000525059 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
PTDSS2-202ENST00000525059 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
PTDSS2-202ENST00000525059 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.92e-7■■■■■ 47.7
PTDSS2-202ENST00000525059 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.1■■■□□ 2.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CLIP1P30622 1438 aa33.09■■■□□ 2.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.07■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 RAPGEF3O95398 923 aa33.06■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRL1O94910 1474 aa33.05■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 FANCAO15360 1455 aa33.05■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 AKNAQ7Z591 1439 aa33.04■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 PLCH2O75038 1416 aa33.03■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
PTDSS2-202ENST00000525059 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.99■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.99■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.97■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.97■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.96■■■□□ 2.87
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF14Q15058 1648 aa32.91■■■□□ 2.86
PTDSS2-202ENST00000525059 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.91■■■□□ 2.86
PTDSS2-202ENST00000525059 RICTORQ6R327 1708 aa32.87■■■□□ 2.85
PTDSS2-202ENST00000525059 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.84■■■□□ 2.85
PTDSS2-202ENST00000525059 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.84■■■□□ 2.85
PTDSS2-202ENST00000525059 CEP162Q5TB80 1403 aa32.82■■■□□ 2.84
PTDSS2-202ENST00000525059 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.82■■■□□ 2.84
PTDSS2-202ENST00000525059 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.8■■■□□ 2.84
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