RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524784.1

PACS1-202, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-202ENST00000524784 CLIP1P30622 1438 aa16.82■□□□□ 0.28
PACS1-202ENST00000524784 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-202ENST00000524784 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-202ENST00000524784 NUP160Q12769 1436 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-202ENST00000524784 CHD1O14646 1710 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-202ENST00000524784 IQGAP2Q13576 1575 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-202ENST00000524784 CEP170Q5SW79 1584 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-202ENST00000524784 P3H3Q8IVL6 736 aa16.7■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 JPH4Q96JJ6 628 aa16.7■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.69■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 OSCARQ8IYS5 282 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-202ENST00000524784 ARAP1Q96P48 1450 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.61■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 SAMD9Q5K651 1589 aa16.6■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 APLP2Q06481 763 aa16.59■□□□□ 0.25
PACS1-202ENST00000524784 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 FMN1Q68DA7 1419 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 DISP1Q96F81 1524 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 KIAA0556O60303 1618 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-202ENST00000524784 SHROOM2Q13796 1616 aa16.52■□□□□ 0.23
PACS1-202ENST00000524784 PTPRGP23470 1445 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-202ENST00000524784 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-202ENST00000524784 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-202ENST00000524784 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PACS1-202ENST00000524784 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PACS1-202ENST00000524784 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.4■□□□□ 0.22
PACS1-202ENST00000524784 MAP3K1Q13233 1512 aa16.39■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 HECW1Q76N89 1606 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 UACAQ9BZF9 1416 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 ARID3CA6NKF2 412 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 ABCA8O94911 1581 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 TIAM1Q13009 1591 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-202ENST00000524784 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.29■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.29■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.28■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 ARHGEF11O15085 1522 aa16.28■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PACS1-202ENST00000524784 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.27■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 ABCC2Q92887 1545 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 ATP10BO94823 1461 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.22■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.21■□□□□ 0.19
PACS1-202ENST00000524784 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 NCOA2Q15596 1464 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-202ENST00000524784 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PACS1-202ENST00000524784 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PACS1-202ENST00000524784 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-202ENST00000524784 KCNH8Q96L42 1107 aa16.11■□□□□ 0.17
PACS1-202ENST00000524784 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-202ENST00000524784 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 KIF14Q15058 1648 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 ASXL2Q76L83 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 MIA2Q96PC5 1412 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-202ENST00000524784 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.02■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 ITGAEP38570 1179 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 MAPKBP1O60336 1514 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-202ENST00000524784 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-202ENST00000524784 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-202ENST00000524784 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-202ENST00000524784 PLCH2O75038 1416 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-202ENST00000524784 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-202ENST00000524784 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.92■□□□□ 0.14
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