RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524349.5

RPS20-211, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS20, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-211ENST00000524349 JPH4Q96JJ6 628 aa43.15■■■■■ 4.5
RPS20-211ENST00000524349 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
RPS20-211ENST00000524349 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
RPS20-211ENST00000524349 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.01■■■■■ 4.48
RPS20-211ENST00000524349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.85■■■■■ 4.45
RPS20-211ENST00000524349 IQGAP2Q13576 1575 aa42.71■■■■■ 4.43
RPS20-211ENST00000524349 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
RPS20-211ENST00000524349 PRXQ9BXM0 1461 aa42.58■■■■■ 4.41
RPS20-211ENST00000524349 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.57■■■■■ 4.41
RPS20-211ENST00000524349 PTPRGP23470 1445 aa42.54■■■■■ 4.4
RPS20-211ENST00000524349 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.5■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.49■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.48■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 DISP1Q96F81 1524 aa42.47■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.44■■■■■ 4.38
RPS20-211ENST00000524349 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.41■■■■■ 4.38
RPS20-211ENST00000524349 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.38■■■■■ 4.37
RPS20-211ENST00000524349 EEA1Q15075 1411 aa42.33■■■■■ 4.37
RPS20-211ENST00000524349 KIAA0556O60303 1618 aa42.31■■■■■ 4.36
RPS20-211ENST00000524349 MAPKBP1O60336 1514 aa42.22■■■■■ 4.35
RPS20-211ENST00000524349 UACAQ9BZF9 1416 aa42.2■■■■■ 4.35
RPS20-211ENST00000524349 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.18■■■■■ 4.34
RPS20-211ENST00000524349 GOLGA3Q08378 1498 aa42.17■■■■■ 4.34
RPS20-211ENST00000524349 ABCC2Q92887 1545 aa42.16■■■■■ 4.34
RPS20-211ENST00000524349 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.14■■■■■ 4.34
RPS20-211ENST00000524349 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.13■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.11■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 P3H3Q8IVL6 736 aa42.1■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.08■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 DIP2BQ9P265 1576 aa42.05■■■■■ 4.32
RPS20-211ENST00000524349 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.04■■■■■ 4.32
RPS20-211ENST00000524349 ASXL2Q76L83 1435 aa42■■■■■ 4.31
RPS20-211ENST00000524349 KIF21BO75037 1637 aa41.95■■■■■ 4.31
RPS20-211ENST00000524349 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.95■■■■■ 4.31
RPS20-211ENST00000524349 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
RPS20-211ENST00000524349 ABCA8O94911 1581 aa41.87■■■■■ 4.29
RPS20-211ENST00000524349 SAMD9Q5K651 1589 aa41.84■■■■■ 4.29
RPS20-211ENST00000524349 ARID3CA6NKF2 412 aa41.82■■■■■ 4.29
RPS20-211ENST00000524349 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
RPS20-211ENST00000524349 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.75■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 TSPOAP1O95153 1857 aa41.74■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.67■■■■■ 4.26
RPS20-211ENST00000524349 GLI2P10070 1586 aa41.67■■■■■ 4.26
RPS20-211ENST00000524349 KCNH8Q96L42 1107 aa41.61■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 ATP10BO94823 1461 aa41.58■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 KDM6BO15054 1643 aa41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.49■■■■■ 4.23
RPS20-211ENST00000524349 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
RPS20-211ENST00000524349 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.4■■■■■ 4.22
RPS20-211ENST00000524349 CD109Q6YHK3 1445 aa41.36■■■■■ 4.21
RPS20-211ENST00000524349 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.34■■■■■ 4.21
RPS20-211ENST00000524349 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
RPS20-211ENST00000524349 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
RPS20-211ENST00000524349 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.26■■■■■ 4.2
RPS20-211ENST00000524349 FMN1Q68DA7 1419 aa41.23■■■■■ 4.19
RPS20-211ENST00000524349 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.23■■■■■ 4.19
RPS20-211ENST00000524349 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
RPS20-211ENST00000524349 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.19■■■■■ 4.18
RPS20-211ENST00000524349 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
RPS20-211ENST00000524349 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.12■■■■■ 4.17
RPS20-211ENST00000524349 HECW1Q76N89 1606 aa41.08■■■■■ 4.17
RPS20-211ENST00000524349 CLIP1P30622 1438 aa41.03■■■■■ 4.16
RPS20-211ENST00000524349 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.141e-70■□□□□ 10.3
RPS20-211ENST00000524349 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
RPS20-211ENST00000524349 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.9■■■■■ 4.14
RPS20-211ENST00000524349 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.88■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.87■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 NEO1Q92859 1461 aa40.85■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.85■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.84■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 RAPGEF3O95398 923 aa40.83■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.82■■■■■ 4.12
RPS20-211ENST00000524349 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.79■■■■■ 4.12
RPS20-211ENST00000524349 FANCAO15360 1455 aa40.77■■■■■ 4.12
RPS20-211ENST00000524349 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
RPS20-211ENST00000524349 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.75■■■■■ 4.11
RPS20-211ENST00000524349 CEP162Q5TB80 1403 aa40.75■■■■■ 4.11
RPS20-211ENST00000524349 KIF14Q15058 1648 aa40.74■■■■■ 4.11
RPS20-211ENST00000524349 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.73■■■■■ 4.11
RPS20-211ENST00000524349 AKNAQ7Z591 1439 aa40.72■■■■■ 4.11
RPS20-211ENST00000524349 ADGRL1O94910 1474 aa40.69■■■■■ 4.1
RPS20-211ENST00000524349 PLCH2O75038 1416 aa40.67■■■■■ 4.1
RPS20-211ENST00000524349 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.65■■■■■ 4.1
RPS20-211ENST00000524349 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
RPS20-211ENST00000524349 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
RPS20-211ENST00000524349 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.56■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.55■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.52■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.52■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 RICTORQ6R327 1708 aa40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms