RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-222ENST00000524035 TIAM1Q13009 1591 aa25.79■■□□□ 1.72
MEG3-222ENST00000524035 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.78■■□□□ 1.72
MEG3-222ENST00000524035 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
MEG3-222ENST00000524035 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.75■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 MAP3K1Q13233 1512 aa25.71■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 PBRM1Q86U86 1689 aa25.71■■□□□ 1.71
MEG3-222ENST00000524035 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
MEG3-222ENST00000524035 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.67■■□□□ 1.7
MEG3-222ENST00000524035 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.66■■□□□ 1.7
MEG3-222ENST00000524035 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.66■■□□□ 1.7
MEG3-222ENST00000524035 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.61■■□□□ 1.69
MEG3-222ENST00000524035 ITGAEP38570 1179 aa25.61■■□□□ 1.69
MEG3-222ENST00000524035 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.6■■□□□ 1.69
MEG3-222ENST00000524035 WDR62O43379 1518 aa25.59■■□□□ 1.69
MEG3-222ENST00000524035 SAMD9Q5K651 1589 aa25.59■■□□□ 1.69
MEG3-222ENST00000524035 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.56■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 ADAMTS12P58397 1594 aa25.55■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 FMN1Q68DA7 1419 aa25.55■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 ERCC6Q03468 1493 aa25.54■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 IFT140Q96RY7 1462 aa25.54■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 GRIN2BQ13224 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.53■■□□□ 1.68
MEG3-222ENST00000524035 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
MEG3-222ENST00000524035 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.48■■□□□ 1.67
MEG3-222ENST00000524035 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
MEG3-222ENST00000524035 IQGAP2Q13576 1575 aa25.44■■□□□ 1.66
MEG3-222ENST00000524035 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MEG3-222ENST00000524035 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MEG3-222ENST00000524035 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.36■■□□□ 1.65
MEG3-222ENST00000524035 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MEG3-222ENST00000524035 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MEG3-222ENST00000524035 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.34■■□□□ 1.65
MEG3-222ENST00000524035 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.33■■□□□ 1.65
MEG3-222ENST00000524035 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.27■■□□□ 1.64
MEG3-222ENST00000524035 GRIN2AQ12879 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
MEG3-222ENST00000524035 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.26■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.26■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 NCOA2Q15596 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.24■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.24■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 HECW1Q76N89 1606 aa25.23■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 ARID3CA6NKF2 412 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-222ENST00000524035 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.2■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 FBLN2P98095 1184 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 DISP1Q96F81 1524 aa25.18■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 KIAA0556O60303 1618 aa25.17■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.16■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 MAPKBP1O60336 1514 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 SYNJ2O15056 1496 aa25.14■■□□□ 1.62
MEG3-222ENST00000524035 PTPRKQ15262 1439 aa25.11■■□□□ 1.61
MEG3-222ENST00000524035 ARHGEF11O15085 1522 aa25.1■■□□□ 1.61
MEG3-222ENST00000524035 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.08■■□□□ 1.61
MEG3-222ENST00000524035 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.03■■□□□ 1.6
MEG3-222ENST00000524035 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 SIN3AQ96ST3 1273 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 NUP160Q12769 1436 aa24.99■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 NEUROD1Q13562 356 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 HFM1A2PYH4 1435 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 JPH4Q96JJ6 628 aa24.96■■□□□ 1.59
MEG3-222ENST00000524035 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.93■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 NAIPQ13075 1403 aa24.93■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.93■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 MIER1Q8N108 512 aa24.91■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.9■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.89■■□□□ 1.58
MEG3-222ENST00000524035 MIA2Q96PC5 1412 aa24.88■■□□□ 1.57
MEG3-222ENST00000524035 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
MEG3-222ENST00000524035 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
MEG3-222ENST00000524035 UACAQ9BZF9 1416 aa24.84■■□□□ 1.57
MEG3-222ENST00000524035 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MEG3-222ENST00000524035 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.8■■□□□ 1.56
MEG3-222ENST00000524035 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-222ENST00000524035 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
MEG3-222ENST00000524035 KDM6BO15054 1643 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-222ENST00000524035 KIF14Q15058 1648 aa24.76■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 ABCA8O94911 1581 aa24.73■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 DAPK1P53355 1430 aa24.73■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 AKNAQ7Z591 1439 aa24.71■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 TRIM52Q96A61 297 aa24.71■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.71■■□□□ 1.55
MEG3-222ENST00000524035 ABCC5O15440 1437 aa24.7■■□□□ 1.54
MEG3-222ENST00000524035 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.69■■□□□ 1.54
MEG3-222ENST00000524035 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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