RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520804.1

PABPC1-215, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-215ENST00000520804 IGF1RP08069 1367 aa34.31■■■■□ 3.08
PABPC1-215ENST00000520804 CUL7Q14999 1698 aa34.25■■■■□ 3.07
PABPC1-215ENST00000520804 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.16■■■■□ 3.06
PABPC1-215ENST00000520804 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.08■■■■□ 3.05
PABPC1-215ENST00000520804 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.96■■■■□ 3.03
PABPC1-215ENST00000520804 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.94■■■■□ 3.02
PABPC1-215ENST00000520804 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.93■■■■□ 3.02
PABPC1-215ENST00000520804 MAPKBP1O60336 1514 aa33.89■■■■□ 3.02
PABPC1-215ENST00000520804 IQGAP2Q13576 1575 aa33.85■■■■□ 3.01
PABPC1-215ENST00000520804 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.84■■■■□ 3.01
PABPC1-215ENST00000520804 PTPRGP23470 1445 aa33.82■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.81■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.79■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.79■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.77■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 DIP2BQ9P265 1576 aa33.77■■■■□ 3
PABPC1-215ENST00000520804 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PABPC1-215ENST00000520804 DISP1Q96F81 1524 aa33.69■■■□□ 2.98
PABPC1-215ENST00000520804 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.65■■■□□ 2.98
PABPC1-215ENST00000520804 ABCC2Q92887 1545 aa33.63■■■□□ 2.97
PABPC1-215ENST00000520804 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
PABPC1-215ENST00000520804 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.59■■■□□ 2.97
PABPC1-215ENST00000520804 UACAQ9BZF9 1416 aa33.58■■■□□ 2.97
PABPC1-215ENST00000520804 KIAA0556O60303 1618 aa33.54■■■□□ 2.96
PABPC1-215ENST00000520804 ASXL2Q76L83 1435 aa33.51■■■□□ 2.95
PABPC1-215ENST00000520804 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.51■■■□□ 2.95
PABPC1-215ENST00000520804 TSPOAP1O95153 1857 aa33.5■■■□□ 2.95
PABPC1-215ENST00000520804 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.49■■■□□ 2.95
PABPC1-215ENST00000520804 PRXQ9BXM0 1461 aa33.48■■■□□ 2.95
PABPC1-215ENST00000520804 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.44■■■□□ 2.94
PABPC1-215ENST00000520804 KDM6BO15054 1643 aa33.43■■■□□ 2.94
PABPC1-215ENST00000520804 GLI2P10070 1586 aa33.42■■■□□ 2.94
PABPC1-215ENST00000520804 GOLGA3Q08378 1498 aa33.37■■■□□ 2.93
PABPC1-215ENST00000520804 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
PABPC1-215ENST00000520804 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
PABPC1-215ENST00000520804 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
PABPC1-215ENST00000520804 ABCA8O94911 1581 aa33.24■■■□□ 2.91
PABPC1-215ENST00000520804 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.23■■■□□ 2.91
PABPC1-215ENST00000520804 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.23■■■□□ 2.91
PABPC1-215ENST00000520804 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.19■■■□□ 2.9
PABPC1-215ENST00000520804 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.12■■■□□ 2.89
PABPC1-215ENST00000520804 EEA1Q15075 1411 aa33.11■■■□□ 2.89
PABPC1-215ENST00000520804 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
PABPC1-215ENST00000520804 P3H3Q8IVL6 736 aa33.07■■■□□ 2.88
PABPC1-215ENST00000520804 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.06■■■□□ 2.88
PABPC1-215ENST00000520804 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
PABPC1-215ENST00000520804 SAMD9Q5K651 1589 aa33.04■■■□□ 2.88
PABPC1-215ENST00000520804 KCNH8Q96L42 1107 aa33.01■■■□□ 2.87
PABPC1-215ENST00000520804 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33■■■□□ 2.87
PABPC1-215ENST00000520804 CD109Q6YHK3 1445 aa32.98■■■□□ 2.87
PABPC1-215ENST00000520804 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.97■■■□□ 2.87
PABPC1-215ENST00000520804 ATP10BO94823 1461 aa32.96■■■□□ 2.87
PABPC1-215ENST00000520804 ARID3CA6NKF2 412 aa32.92■■■□□ 2.86
PABPC1-215ENST00000520804 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.89■■■□□ 2.86
PABPC1-215ENST00000520804 KIF21BO75037 1637 aa32.85■■■□□ 2.85
PABPC1-215ENST00000520804 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
PABPC1-215ENST00000520804 ADGRL1O94910 1474 aa32.82■■■□□ 2.84
PABPC1-215ENST00000520804 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.81■■■□□ 2.84
PABPC1-215ENST00000520804 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.77■■■□□ 2.84
PABPC1-215ENST00000520804 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
PABPC1-215ENST00000520804 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.74■■■□□ 2.83
PABPC1-215ENST00000520804 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
PABPC1-215ENST00000520804 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
PABPC1-215ENST00000520804 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.71■■■□□ 2.83
PABPC1-215ENST00000520804 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.69■■■□□ 2.82
PABPC1-215ENST00000520804 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.66■■■□□ 2.82
PABPC1-215ENST00000520804 NEO1Q92859 1461 aa32.59■■■□□ 2.81
PABPC1-215ENST00000520804 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.58■■■□□ 2.81
PABPC1-215ENST00000520804 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
PABPC1-215ENST00000520804 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.56■■■□□ 2.8
PABPC1-215ENST00000520804 RAPGEF3O95398 923 aa32.49■■■□□ 2.79
PABPC1-215ENST00000520804 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.46■■■□□ 2.79
PABPC1-215ENST00000520804 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
PABPC1-215ENST00000520804 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.79
PABPC1-215ENST00000520804 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.44■■■□□ 2.78
PABPC1-215ENST00000520804 FMN1Q68DA7 1419 aa32.43■■■□□ 2.78
PABPC1-215ENST00000520804 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.41■■■□□ 2.78
PABPC1-215ENST00000520804 HECW1Q76N89 1606 aa32.38■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.38■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 FANCAO15360 1455 aa32.38■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 AKNAQ7Z591 1439 aa32.38■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.33■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 RICTORQ6R327 1708 aa32.33■■■□□ 2.77
PABPC1-215ENST00000520804 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.28■■■□□ 2.76
PABPC1-215ENST00000520804 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.26■■■□□ 2.76
PABPC1-215ENST00000520804 PLCH2O75038 1416 aa32.26■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.23■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.21■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 PTPRMP28827 1452 aa32.2■■■□□ 2.75
PABPC1-215ENST00000520804 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.18■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.17■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 KIF14Q15058 1648 aa32.17■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.16■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.15■■■□□ 2.74
PABPC1-215ENST00000520804 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms