RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520804.1

PABPC1-215, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 2

Gene PABPC1, Length 493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-215	ENST00000520804	IGF1R	P08069	1367 aa		34.31	■■■■□ 3.08
PABPC1-215	ENST00000520804	CUL7	Q14999	1698 aa		34.25	■■■■□ 3.07
PABPC1-215	ENST00000520804	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PABPC1-215	ENST00000520804	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PABPC1-215	ENST00000520804	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PABPC1-215	ENST00000520804	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PABPC1-215	ENST00000520804	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.93	■■■■□ 3.02
PABPC1-215	ENST00000520804	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PABPC1-215	ENST00000520804	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PABPC1-215	ENST00000520804	PTPRG	P23470	1445 aa		33.82	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.81	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.79	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.79	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.77	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.77	■■■■□ 3
PABPC1-215	ENST00000520804	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PABPC1-215	ENST00000520804	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PABPC1-215	ENST00000520804	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PABPC1-215	ENST00000520804	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PABPC1-215	ENST00000520804	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PABPC1-215	ENST00000520804	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PABPC1-215	ENST00000520804	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PABPC1-215	ENST00000520804	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PABPC1-215	ENST00000520804	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PABPC1-215	ENST00000520804	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PABPC1-215	ENST00000520804	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PABPC1-215	ENST00000520804	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PABPC1-215	ENST00000520804	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PABPC1-215	ENST00000520804	KDM6B	O15054	1643 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PABPC1-215	ENST00000520804	GLI2	P10070	1586 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PABPC1-215	ENST00000520804	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PABPC1-215	ENST00000520804	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PABPC1-215	ENST00000520804	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PABPC1-215	ENST00000520804	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCA8	O94911	1581 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PABPC1-215	ENST00000520804	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PABPC1-215	ENST00000520804	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PABPC1-215	ENST00000520804	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PABPC1-215	ENST00000520804	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PABPC1-215	ENST00000520804	EEA1	Q15075	1411 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PABPC1-215	ENST00000520804	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PABPC1-215	ENST00000520804	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PABPC1-215	ENST00000520804	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PABPC1-215	ENST00000520804	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PABPC1-215	ENST00000520804	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PABPC1-215	ENST00000520804	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PABPC1-215	ENST00000520804	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33	■■■□□ 2.87
PABPC1-215	ENST00000520804	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PABPC1-215	ENST00000520804	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PABPC1-215	ENST00000520804	ATP10B	O94823	1461 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PABPC1-215	ENST00000520804	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PABPC1-215	ENST00000520804	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PABPC1-215	ENST00000520804	KIF21B	O75037	1637 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PABPC1-215	ENST00000520804	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PABPC1-215	ENST00000520804	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PABPC1-215	ENST00000520804	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PABPC1-215	ENST00000520804	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PABPC1-215	ENST00000520804	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PABPC1-215	ENST00000520804	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PABPC1-215	ENST00000520804	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PABPC1-215	ENST00000520804	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PABPC1-215	ENST00000520804	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PABPC1-215	ENST00000520804	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PABPC1-215	ENST00000520804	NEO1	Q92859	1461 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PABPC1-215	ENST00000520804	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PABPC1-215	ENST00000520804	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PABPC1-215	ENST00000520804	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PABPC1-215	ENST00000520804	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PABPC1-215	ENST00000520804	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PABPC1-215	ENST00000520804	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PABPC1-215	ENST00000520804	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.46	■■■□□ 2.79
PABPC1-215	ENST00000520804	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PABPC1-215	ENST00000520804	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PABPC1-215	ENST00000520804	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PABPC1-215	ENST00000520804	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	FANCA	O15360	1455 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PABPC1-215	ENST00000520804	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PABPC1-215	ENST00000520804	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PABPC1-215	ENST00000520804	PLCH2	O75038	1416 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	PTPRM	P28827	1452 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PABPC1-215	ENST00000520804	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	KIF14	Q15058	1648 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PABPC1-215	ENST00000520804	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.14	■■■□□ 2.74

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