RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.77
TSNARE1-206ENST00000520462 CUL7Q14999 1698 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-206ENST00000520462 IGF1RP08069 1367 aa26.1■■□□□ 1.77
TSNARE1-206ENST00000520462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
TSNARE1-206ENST00000520462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26■■□□□ 1.75
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-206ENST00000520462 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-206ENST00000520462 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-206ENST00000520462 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-206ENST00000520462 MAPKBP1O60336 1514 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-206ENST00000520462 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPRGP23470 1445 aa25.81■■□□□ 1.72
TSNARE1-206ENST00000520462 DIP2BQ9P265 1576 aa25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1-206ENST00000520462 EEA1Q15075 1411 aa25.79■■□□□ 1.72
TSNARE1-206ENST00000520462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.79■■□□□ 1.72
TSNARE1-206ENST00000520462 IQGAP2Q13576 1575 aa25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1-206ENST00000520462 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-206ENST00000520462 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-206ENST00000520462 PRXQ9BXM0 1461 aa25.72■■□□□ 1.71
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPOAP1O95153 1857 aa25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1-206ENST00000520462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC2Q92887 1545 aa25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM6BO15054 1643 aa25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1-206ENST00000520462 DISP1Q96F81 1524 aa25.62■■□□□ 1.69
TSNARE1-206ENST00000520462 ASXL2Q76L83 1435 aa25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1-206ENST00000520462 UACAQ9BZF9 1416 aa25.59■■□□□ 1.69
TSNARE1-206ENST00000520462 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1-206ENST00000520462 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1-206ENST00000520462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0556O60303 1618 aa25.52■■□□□ 1.68
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF21BO75037 1637 aa25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1-206ENST00000520462 GLI2P10070 1586 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA3Q08378 1498 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-206ENST00000520462 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-206ENST00000520462 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-206ENST00000520462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-206ENST00000520462 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1-206ENST00000520462 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-206ENST00000520462 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-206ENST00000520462 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNH8Q96L42 1107 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCA8O94911 1581 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 P3H3Q8IVL6 736 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 SAMD9Q5K651 1589 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-206ENST00000520462 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1-206ENST00000520462 ARID3CA6NKF2 412 aa25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRL1O94910 1474 aa25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-206ENST00000520462 CD109Q6YHK3 1445 aa25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-206ENST00000520462 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-206ENST00000520462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1-206ENST00000520462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP10BO94823 1461 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-206ENST00000520462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-206ENST00000520462 FMN1Q68DA7 1419 aa24.95■■□□□ 1.59
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1-206ENST00000520462 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1-206ENST00000520462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1-206ENST00000520462 CLIP1P30622 1438 aa24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 HECW1Q76N89 1606 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 RAPGEF3O95398 923 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 NEO1Q92859 1461 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-206ENST00000520462 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP162Q5TB80 1403 aa24.78■■□□□ 1.56
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TSNARE1-206ENST00000520462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-206ENST00000520462 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-206ENST00000520462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-206ENST00000520462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-206ENST00000520462 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 FANCAO15360 1455 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 AKNAQ7Z591 1439 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPRMP28827 1452 aa24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1-206ENST00000520462 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.63■■□□□ 1.53
TSNARE1-206ENST00000520462 RICTORQ6R327 1708 aa24.63■■□□□ 1.53
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.61■■□□□ 1.53
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