RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
SNHG6-201ENST00000520348 SYNJ2O15056 1496 aa25.39■■□□□ 1.65
SNHG6-201ENST00000520348 GRIN2AQ12879 1464 aa25.38■■□□□ 1.65
SNHG6-201ENST00000520348 SAMD9Q5K651 1589 aa25.32■■□□□ 1.64
SNHG6-201ENST00000520348 IQGAP2Q13576 1575 aa25.29■■□□□ 1.64
SNHG6-201ENST00000520348 NUP160Q12769 1436 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG6-201ENST00000520348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG6-201ENST00000520348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.23■■□□□ 1.63
SNHG6-201ENST00000520348 CEP170Q5SW79 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
SNHG6-201ENST00000520348 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNHG6-201ENST00000520348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SNHG6-201ENST00000520348 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG6-201ENST00000520348 MAP3K1Q13233 1512 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG6-201ENST00000520348 CHD1O14646 1710 aa25.1■■□□□ 1.61
SNHG6-201ENST00000520348 FMN1Q68DA7 1419 aa25.08■■□□□ 1.61
SNHG6-201ENST00000520348 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SNHG6-201ENST00000520348 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.07■■□□□ 1.6
SNHG6-201ENST00000520348 KIAA0556O60303 1618 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG6-201ENST00000520348 DISP1Q96F81 1524 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG6-201ENST00000520348 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.05■■□□□ 1.6
SNHG6-201ENST00000520348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG6-201ENST00000520348 TIAM1Q13009 1591 aa25■■□□□ 1.59
SNHG6-201ENST00000520348 SHROOM2Q13796 1616 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 FBLN2P98095 1184 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 P3H3Q8IVL6 736 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 APLP2Q06481 763 aa24.93■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SNHG6-201ENST00000520348 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.87■■□□□ 1.57
SNHG6-201ENST00000520348 JPH4Q96JJ6 628 aa24.87■■□□□ 1.57
SNHG6-201ENST00000520348 HECW1Q76N89 1606 aa24.86■■□□□ 1.57
SNHG6-201ENST00000520348 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.86■■□□□ 1.57
SNHG6-201ENST00000520348 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.85■■□□□ 1.57
SNHG6-201ENST00000520348 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.81■■□□□ 1.56
SNHG6-201ENST00000520348 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.77■■□□□ 1.56
SNHG6-201ENST00000520348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNHG6-201ENST00000520348 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SNHG6-201ENST00000520348 ABCA8O94911 1581 aa24.73■■□□□ 1.55
SNHG6-201ENST00000520348 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SNHG6-201ENST00000520348 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.7■■□□□ 1.54
SNHG6-201ENST00000520348 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNHG6-201ENST00000520348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SNHG6-201ENST00000520348 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG6-201ENST00000520348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG6-201ENST00000520348 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGEF11O15085 1522 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 PTPRGP23470 1445 aa24.6■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.58■■□□□ 1.53
SNHG6-201ENST00000520348 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
SNHG6-201ENST00000520348 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG6-201ENST00000520348 NCOA2Q15596 1464 aa24.53■■□□□ 1.52
SNHG6-201ENST00000520348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.53■■□□□ 1.52
SNHG6-201ENST00000520348 UACAQ9BZF9 1416 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG6-201ENST00000520348 ABCC2Q92887 1545 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 ATP10BO94823 1461 aa24.48■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 OSCARQ8IYS5 282 aa24.48■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.45■■□□□ 1.51
SNHG6-201ENST00000520348 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.44■■□□□ 1.5
SNHG6-201ENST00000520348 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SNHG6-201ENST00000520348 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SNHG6-201ENST00000520348 MIA2Q96PC5 1412 aa24.36■■□□□ 1.49
SNHG6-201ENST00000520348 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.35■■□□□ 1.49
SNHG6-201ENST00000520348 KIF14Q15058 1648 aa24.32■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 ARID3CA6NKF2 412 aa24.32■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.32■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.31■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.29■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 HRCP23327 699 aa24.27■■□□□ 1.48
SNHG6-201ENST00000520348 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.25■■□□□ 1.47
SNHG6-201ENST00000520348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SNHG6-201ENST00000520348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SNHG6-201ENST00000520348 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SNHG6-201ENST00000520348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.19■■□□□ 1.46
SNHG6-201ENST00000520348 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNHG6-201ENST00000520348 PREX2Q70Z35 1606 aa24.14■■□□□ 1.46
SNHG6-201ENST00000520348 PTPRKQ15262 1439 aa24.14■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 AKNAQ7Z591 1439 aa24.12■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.11■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.11■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.08■■□□□ 1.45
SNHG6-201ENST00000520348 HFM1A2PYH4 1435 aa24.08■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.08■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.06■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.06■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.06■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.06■■□□□ 1.44
SNHG6-201ENST00000520348 DAPK1P53355 1430 aa24.05■■□□□ 1.44
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