RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519751.5

MSC-AS1-206, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 596 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.03■■□□□ 1.92
MSC-AS1-206ENST00000519751 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.02■■□□□ 1.92
MSC-AS1-206ENST00000519751 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.99■■□□□ 1.91
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
MSC-AS1-206ENST00000519751 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.92■■□□□ 1.9
MSC-AS1-206ENST00000519751 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
MSC-AS1-206ENST00000519751 IQGAP2Q13576 1575 aa26.8■■□□□ 1.88
MSC-AS1-206ENST00000519751 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRXQ9BXM0 1461 aa26.73■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 EEA1Q15075 1411 aa26.73■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.71■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 PTPRGP23470 1445 aa26.71■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.71■■□□□ 1.87
MSC-AS1-206ENST00000519751 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.65■■□□□ 1.86
MSC-AS1-206ENST00000519751 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MSC-AS1-206ENST00000519751 DISP1Q96F81 1524 aa26.6■■□□□ 1.85
MSC-AS1-206ENST00000519751 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.57■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.57■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 GOLGA3Q08378 1498 aa26.56■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIAA0556O60303 1618 aa26.52■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 MAPKBP1O60336 1514 aa26.52■■□□□ 1.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 UACAQ9BZF9 1416 aa26.51■■□□□ 1.83
MSC-AS1-206ENST00000519751 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
MSC-AS1-206ENST00000519751 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.49■■□□□ 1.83
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCC2Q92887 1545 aa26.47■■□□□ 1.83
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.45■■□□□ 1.82
MSC-AS1-206ENST00000519751 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.44■■□□□ 1.82
MSC-AS1-206ENST00000519751 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.36■■□□□ 1.81
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF21BO75037 1637 aa26.36■■□□□ 1.81
MSC-AS1-206ENST00000519751 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.34■■□□□ 1.81
MSC-AS1-206ENST00000519751 DIP2BQ9P265 1576 aa26.33■■□□□ 1.81
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.33■■□□□ 1.81
MSC-AS1-206ENST00000519751 ASXL2Q76L83 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
MSC-AS1-206ENST00000519751 P3H3Q8IVL6 736 aa26.29■■□□□ 1.8
MSC-AS1-206ENST00000519751 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCA8O94911 1581 aa26.24■■□□□ 1.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 SAMD9Q5K651 1589 aa26.24■■□□□ 1.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 GLI2P10070 1586 aa26.18■■□□□ 1.78
MSC-AS1-206ENST00000519751 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.17■■□□□ 1.78
MSC-AS1-206ENST00000519751 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.16■■□□□ 1.78
MSC-AS1-206ENST00000519751 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
MSC-AS1-206ENST00000519751 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.14■■□□□ 1.78
MSC-AS1-206ENST00000519751 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.11■■□□□ 1.77
MSC-AS1-206ENST00000519751 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.06■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 ATP10BO94823 1461 aa26.06■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 TSPOAP1O95153 1857 aa26.05■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARID3CA6NKF2 412 aa26.05■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 KCNH8Q96L42 1107 aa26.05■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.04■■□□□ 1.76
MSC-AS1-206ENST00000519751 KDM6BO15054 1643 aa26.01■■□□□ 1.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26■■□□□ 1.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 FMN1Q68DA7 1419 aa25.97■■□□□ 1.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 CD109Q6YHK3 1445 aa25.97■■□□□ 1.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
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MSC-AS1-206ENST00000519751 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MSC-AS1-206ENST00000519751 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.91■■□□□ 1.74
MSC-AS1-206ENST00000519751 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.91■■□□□ 1.74
MSC-AS1-206ENST00000519751 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MSC-AS1-206ENST00000519751 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
MSC-AS1-206ENST00000519751 HECW1Q76N89 1606 aa25.81■■□□□ 1.72
MSC-AS1-206ENST00000519751 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.81■■□□□ 1.72
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.81■■□□□ 1.72
MSC-AS1-206ENST00000519751 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
MSC-AS1-206ENST00000519751 CLIP1P30622 1438 aa25.75■■□□□ 1.71
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MSC-AS1-206ENST00000519751 NEO1Q92859 1461 aa25.7■■□□□ 1.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.69■■□□□ 1.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.69■■□□□ 1.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.65■■□□□ 1.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
MSC-AS1-206ENST00000519751 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.61■■□□□ 1.69
MSC-AS1-206ENST00000519751 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
MSC-AS1-206ENST00000519751 FANCAO15360 1455 aa25.59■■□□□ 1.69
MSC-AS1-206ENST00000519751 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.57■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.56■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 PLCH2O75038 1416 aa25.56■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 CEP162Q5TB80 1403 aa25.55■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 AKNAQ7Z591 1439 aa25.55■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF14Q15058 1648 aa25.55■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 RAPGEF3O95398 923 aa25.54■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.53■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.52■■□□□ 1.68
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADGRL1O94910 1474 aa25.47■■□□□ 1.67
MSC-AS1-206ENST00000519751 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.46■■□□□ 1.67
MSC-AS1-206ENST00000519751 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.45■■□□□ 1.66
MSC-AS1-206ENST00000519751 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.44■■□□□ 1.66
MSC-AS1-206ENST00000519751 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.41■■□□□ 1.66
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.41■■□□□ 1.66
MSC-AS1-206ENST00000519751 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.39■■□□□ 1.66
MSC-AS1-206ENST00000519751 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.38■■□□□ 1.65
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