RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 JPH4Q96JJ6 628 aa42.39■■■■■ 4.38
LAPTM4B-202ENST00000517924 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.37■■■■■ 4.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.28■■■■■ 4.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 IQGAP2Q13576 1575 aa42.01■■■■■ 4.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.91■■■■■ 4.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRXQ9BXM0 1461 aa41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 DISP1Q96F81 1524 aa41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRGP23470 1445 aa41.78■■■■■ 4.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.75■■■■■ 4.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.74■■■■■ 4.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.74■■■■■ 4.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIAA0556O60303 1618 aa41.65■■■■■ 4.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAPKBP1O60336 1514 aa41.64■■■■■ 4.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.58■■■■■ 4.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.53■■■■■ 4.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 DIP2BQ9P265 1576 aa41.5■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC2Q92887 1545 aa41.49■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 UACAQ9BZF9 1416 aa41.48■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.47■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 EEA1Q15075 1411 aa41.46■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.46■■■■■ 4.23
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.41■■■■■ 4.22
LAPTM4B-202ENST00000517924 GOLGA3Q08378 1498 aa41.4■■■■■ 4.22
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.31■■■■■ 4.2
LAPTM4B-202ENST00000517924 ASXL2Q76L83 1435 aa41.31■■■■■ 4.2
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.3■■■■■ 4.2
LAPTM4B-202ENST00000517924 TSPOAP1O95153 1857 aa41.29■■■■■ 4.2
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA8O94911 1581 aa41.22■■■■■ 4.19
LAPTM4B-202ENST00000517924 P3H3Q8IVL6 736 aa41.21■■■■■ 4.19
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF21BO75037 1637 aa41.2■■■■■ 4.19
LAPTM4B-202ENST00000517924 SAMD9Q5K651 1589 aa41.18■■■■■ 4.18
LAPTM4B-202ENST00000517924 GLI2P10070 1586 aa41.11■■■■■ 4.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.03■■■■■ 4.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.99■■■■■ 4.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.97■■■■■ 4.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM6BO15054 1643 aa40.96■■■■■ 4.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARID3CA6NKF2 412 aa40.94■■■■■ 4.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.93■■■■■ 4.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.9■■■■■ 4.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP10BO94823 1461 aa40.87■■■■■ 4.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.82■■■■■ 4.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNH8Q96L42 1107 aa40.81■■■■■ 4.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.73■■■■■ 4.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.69■■■■■ 4.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 CD109Q6YHK3 1445 aa40.66■■■■■ 4.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.61■■■■■ 4.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.59■■■■■ 4.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.54■■■■■ 4.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 FMN1Q68DA7 1419 aa40.41■■■■■ 4.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.37■■■■■ 4.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 HECW1Q76N89 1606 aa40.36■■■■■ 4.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.3■■■■■ 4.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.3■■■■■ 4.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.041e-8■■□□□ 11.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.27■■■■■ 4.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.26■■■■■ 4.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEO1Q92859 1461 aa40.19■■■■■ 4.02
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.14■■■■■ 4.02
LAPTM4B-202ENST00000517924 CLIP1P30622 1438 aa40.14■■■■■ 4.02
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRL1O94910 1474 aa40.13■■■■■ 4.01
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAPGEF3O95398 923 aa40.1■■■■■ 4.01
LAPTM4B-202ENST00000517924 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.1■■■■■ 4.01
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF14Q15058 1648 aa40.09■■■■■ 4.01
LAPTM4B-202ENST00000517924 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.08■■■■■ 4.01
LAPTM4B-202ENST00000517924 FANCAO15360 1455 aa40.07■■■■■ 4
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.02■■■■■ 4
LAPTM4B-202ENST00000517924 AKNAQ7Z591 1439 aa40.02■■■■■ 4
LAPTM4B-202ENST00000517924 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
LAPTM4B-202ENST00000517924 RICTORQ6R327 1708 aa39.99■■■■□ 3.99
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.98■■■■□ 3.99
LAPTM4B-202ENST00000517924 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.96■■■■□ 3.99
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLCH2O75038 1416 aa39.96■■■■□ 3.99
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.95■■■■□ 3.99
LAPTM4B-202ENST00000517924 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP162Q5TB80 1403 aa39.85■■■■□ 3.97
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.8■■■■□ 3.96
LAPTM4B-202ENST00000517924 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.79■■■■□ 3.96
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.79■■■■□ 3.96
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.79■■■■□ 3.96
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